dna遺傳演算法

Ⅰ 遺傳演算法有哪些特點

經現代醫學研究表明，DNA是現存生命最重要的遺傳物質。而遺傳則是指經由基因的傳遞，使後代獲得親代的特徵。遺傳學正是研究遺傳這一現象的一門學科，除遺傳因素外，還有環境，以及環境與遺傳的交互作用也是決定生物特徵的因素。

遺傳演算法是一種可用於復雜系統優化的一種搜索演算法，與傳統的演算法相比，具有以下4個特點：第一，它是以決策變數的編碼作為運算對象；第二，遺傳演算法直接以適應度作為搜索信息，無需導數等其他輔助信息；第三，遺傳演算法使用多個點的搜索信息，具有隱含並行性；最後，它沒有使用非確定性規則，而是採用了概率搜索技術。

Ⅱ 基因遺傳演算法的終止條件一般是適應度數值小於0.()

基因遺傳演算法的終止條件一般是適應度數值小於0。是對的。

遺傳演算法便基於達爾文的進化論，模擬了自然選擇，物競天擇、適者生存，通過N代的遺傳、變異、交叉、復制，進化出問題的最優解。

Ⅲ 基因演算法和遺傳演算法的區別

遺傳演算法
一種基於自然群體遺傳演化機制的高效探索演算法，它是美國學者Holland於1975年首先提出來的。它摒棄了傳統的搜索方式，模擬自然界生物進化過程，採用人工進化的方式對目標空間進行隨機化搜索。它將問題域中的可能解看作是群體的一個個體或染色體，並將每一個體編碼成符號串形式，模擬達爾文的遺傳選擇和自然淘汰的生物進化過程，對群體反復進行基於遺傳學的操作（遺傳，交叉和變異），根據預定的目標適應度函數對每個個體進行評價，依據適者生存，優勝劣汰的進化規則，不斷得到更優的群體，同時以全局並行搜索方式來搜索優化群體中的最優個體，求得滿足要求的最優解。
Holland創建的遺傳演算法是一種概率搜索演算法，它是利用某種編碼技術作用於稱為染色體的數串，其基本思想是模擬由這些組成的進化過程。跗演算法通過有組織地然而是隨機地信息交換重新組合那些適應性好的串，在每一代中，利用上一代串結構中適應好的位和段來生成一個新的串的群體；作為額外增添，偶爾也要在串結構中嘗試用新的位和段來替代原來的部分。
遺傳演算法是一類隨機化演算法，但是它不是簡單的隨機走動，它可以有效地利用已經有的信息處理來搜索那些有希望改善解質量的串，類似於自然進化，遺傳演算法通過作用於染色體上的基因，尋找好的染色體來求解問題。與自然界相似，遺傳演算法對待求解問題本身一無所知，它所需要的僅是對演算法所產生的每個染色體進行評價，並基於適應度值來造反染色體，使適用性好的染色體比適應性差的染色體有更多的繁殖機會。
基因演算法
一種生物進化的演算法,實際上是一種多目標的探索法.能夠用於計劃與排程.它是非常新的技術,目前,還沒有在商業中實際運用.
採用生物基因技術高級演算法,處理日益復雜的現實世界,也是人工智慧上,高級約束演算法上的挑戰. 基因演算法是一種搜索技術，它的目標是尋找最好的解決方案。這種搜索技術是一種優化組合，它以模仿生物進化過程為基礎。基因演算法的基本思想是，進化就是選擇了最優種類。基因演算法將應用APS上，以獲得「最優」的解決方案。

Ⅳ 基因遺傳演算法主流

基因遺傳演算法是一種靈感源於達爾文自然進化理論的啟發式搜索演算法 該演算法反映了自然選擇的過程 即最適者被選定繁殖 並產生下一代
自然選擇的過程從選擇群體中最適應環境的個體開始 後代繼承了父母的特性 並且這些特性將添加到下一代中 如果父母具有更好的適應性 那麼它們的後代將更易於存活 迭代地進行該自然選擇的過程 最終 我們將得到由最適應環境的個體組成的一代
這一概念可以被應用於搜索問題中 我們考濾一個問題的諸多解決方案 並從中搜尋出最佳方案
遺傳演算法含以下五步
1.初始化
2.個體評價（計算適應度函數）
3.選擇運算
4.交叉運算
5.變異運算
初始化
該過程從種群的一組個體開始 且每一個體都是待解決問題的一個候選解
個體以一組參數（變數）為特徵 這些特徵被稱為基因 串聯這些基因就可以組成染色體（問題的解）
在遺傳演算法中 單個個體的基因組以字元串的方式呈現 通常我們可以使用二進制（1和0的字元串）編碼 即一個二進制串代表一條染色體串 因此可以說我們將基因串或候選解的特徵編碼在染色體中
個體評價利用適應度函數評估了該個體對環境的適應度（與其它個體徑爭的能力）每一個體都有適應評分 個體被選中進行繁殖的可能性取決於其適應度評分 適應度函數是遺傳演算法進化的驅動力 也是進行自然選擇的唯一標准 它的設計應結合求解問題本身的要求而定
選擇運算的目的是選出適應性最好的個體 並使它們將基因傳到下一代中 基於其適應度評分 我們選擇多對較優個體（父母）適應度高的個體更易被選中繁殖 即將較優父母的基因傳遞到下一代
交叉運算是遺傳演算法中最重要的階段 對每一對配對的父母 基因都存在隨機選中的交叉點
變異運算
在某些形成的新後代中 它們的某些基因可能受到低概率變異因子的作用 這意味著二進制位串中的某些位可能會翻轉
變異運算前後
變異運算可用於保持群內的多樣性 並防止過早收斂
終止
在群體收斂的情況下（群體內不產生與前一代差異較大的後代）該演算法終止 也就是說遺傳演算法提供了一組問題的解

Ⅳ 遺傳演算法原理簡介

遺傳演算法（Genetic Algorithm, GA）是一種進化計算（Evolutionary Computing）演算法，屬於人工智慧技術的一部分。遺傳演算法最早是由John Holland和他的學生發明並改進的，源於對達芬奇物種進化理論的模仿。在物種進化過程中，為了適應環境，好的基因得到保留，不好的基因被淘汰，這樣經過很多代基因的變化，物種的基因就是當前自然環境下適應度最好的基因。該演算法被廣泛應用於優化和搜索中，用於尋求最優解（或最優解的近似），其最主要的步驟包括交叉（crossover）和突變（mutation）。

所有的生物體都由細胞組成，每個細胞中都包含了同樣的染色體（chromosome）。染色體由一串DNA組成，我們可以簡單地把一個生物個體表示為一條染色體。每條染色體上都包含著基因，而基因又是由多個DNA組成的。每個基因都控制著個體某個性狀的表達，例如眼睛的顏色、眼皮的單雙等。在物種繁衍的過程中，首先發生交叉，來自於父母的染色體經過分裂和重組，形成後代的染色體。之後，後代有一定概率發生基因突變，即染色體上某個位置處的基因以一定概率發生變化。之後，對每一代都重復進行交叉和突變兩個步驟。對於每一個後代，我們可以通過一定的方式測量其適應度。適應度越好的個體，在下一次交叉中被選中的概率越大，它的基因越容易傳給下一代。這樣，後代的適應度就會越來越好，直到收斂到一個穩定值。

在優化問題中，可行解總是有很多個，我們希望尋找一個最優解，它相對於其他可行解來說具有更好的適應度（即目標函數值更大或更小）。每個可行解就是一個「生物個體」，可以表示為狀態空間中的一個點和適應度。每個解都是一個經過編碼的序列，已二進制編碼為例，每個解都是一個二進制序列。這樣每個染色體就是一個二進制序列。遺傳演算法從從一組可行解開始，稱為population，從population中隨機選擇染色體進行交叉產生下一代。這一做法的基於下一代的適應度會好於上一代。遺傳演算法的過程如下：

終止條件可以是達到了最大迭代次數，或者是前後連續幾代的最優染色體的適應度差值小於一個閾值。以上演算法描述也許還不夠直觀，我們舉例說明。假設解可以用二進制編碼表示，則每個染色體都是一個二進制序列。假設序列長度為16，則每個染色體都是一個16位的二進制序列：

首先，我們隨機生成一個population，假設population size為20，則有20個長度為16的二進制序列。計算每個染色體的適應度，然後選取兩個染色體進行交叉，如下圖所示。下圖在第6為上將染色體斷開再重組，斷開的位置是可以隨機選擇的。當然，斷裂位置也可以不止一個。可以根據具體問題選擇具體的交叉方式來提升演算法性能。

之後，隨機選取後代染色體上某個基因發生基因突變，突變的位置是隨機選取的。並且，基因突變並不是在每個後代上都會發生，只是有一定的概率。對於二進制編碼，基因突變的方式是按位取反：

上述例子是關於二進制編碼的，像求解一元函數在某個區間內的最大最小值就可以使用二進制編碼。例如，求解函數f(x)=x+sin(3x)+cos(3x)在區間[0,6]內的最小值。假設我們需要最小值點x保留4位小數，那麼求解區間被離散成60000個數。因為2 {15}<60000<2 {16}，所以，需要16位二進制數來表示這60000個可能的解。其中0x0000表示0，0x0001表示0.0001，以此類推。針對這個例子，文末給出了demo code．

然而，在排序問題中無法使用二進制編碼，應該採用排列編碼（permutation encoding）。例如有下面兩個染色體：

交叉：隨機選取一個交叉點，從該出將兩個染色體斷開。染色體A的前部分組成後代1的前部分，然後掃描染色體B，如果出現了後代1中不包含的基因，則將其順序加入後代1中。同理，染色體B的前部分組成了後代2的前部分，掃描染色體A獲得後代2的後部分。注意，交叉的方式多種多樣，此處只是舉出其中一種方式。

( 1 5 3 2 6 | 4 7 9 8) + ( 8 5 6 7 2 | 3 1 4 9) => ( 1 5 3 2 6 8 7 4 9) + ( 8 5 6 7 2 1 3 4 9)

突變：對於一個染色體，隨機選中兩個基因互換位置。例如第3個基因和倒數第2個基因互換：

(1 5 3 2 6 8 7 4 9) => (1 5 4 2 6 8 7 3 9)

此外還有值編碼（value encoding）和樹編碼（tree encoding）等，具體例子可以參考這個鏈接： http://obitko.com/tutorials/genetic-algorithms/encoding.php

在實際的遺傳演算法中，往往會保留上一代中的少數幾個精英（elite），即將上一代population中適應度最好的幾個染色體加入到後代的poulation中，同時去除後代population中適應度最差的幾個染色體。通過這個策略，如果在某次迭代中產生了最優解，則最優解能夠一直保留到迭代結束。

用GA求函數最小值的demo code： https://github.com/JiaxYau/GA_test

參考資料 ：

[1] Introction to Genetic Algorithm, http://obitko.com/tutorials/genetic-algorithms/index.php

[2] Holland J H. Adaption in natural and artificial systems

Ⅵ ] 基因遺傳演算法的組成部分包括什麼

初始化編碼#適應度函數#選擇#交叉和變異