❶ 建議收藏!10 種 python 聚類演算法完整操作示例
聚類或聚類分析是無監督學習問題。它通常被用作數據分析技術,用於發現數據中的有趣模式,例如基於其行為的客戶群。有許多聚類演算法可供選擇,對於所有情況,沒有單一的最佳聚類演算法。相反,最好探索一系列聚類演算法以及每種演算法的不同配置。在本教程中,你將發現如何在 python 中安裝和使用頂級聚類演算法。完成本教程後,你將知道:
聚類分析,即聚類,是一項無監督的機器學習任務。它包括自動發現數據中的自然分組。與監督學習(類似預測建模)不同,聚類演算法只解釋輸入數據,並在特徵空間中找到自然組或群集。
群集通常是特徵空間中的密度區域,其中來自域的示例(觀測或數據行)比其他群集更接近群集。群集可以具有作為樣本或點特徵空間的中心(質心),並且可以具有邊界或范圍。
聚類可以作為數據分析活動提供幫助,以便了解更多關於問題域的信息,即所謂的模式發現或知識發現。例如:
聚類還可用作特徵工程的類型,其中現有的和新的示例可被映射並標記為屬於數據中所標識的群集之一。雖然確實存在許多特定於群集的定量措施,但是對所識別的群集的評估是主觀的,並且可能需要領域專家。通常,聚類演算法在人工合成數據集上與預先定義的群集進行學術比較,預計演算法會發現這些群集。
有許多類型的聚類演算法。許多演算法在特徵空間中的示例之間使用相似度或距離度量,以發現密集的觀測區域。因此,在使用聚類演算法之前,擴展數據通常是良好的實踐。
一些聚類演算法要求您指定或猜測數據中要發現的群集的數量,而另一些演算法要求指定觀測之間的最小距離,其中示例可以被視為「關閉」或「連接」。因此,聚類分析是一個迭代過程,在該過程中,對所識別的群集的主觀評估被反饋回演算法配置的改變中,直到達到期望的或適當的結果。scikit-learn 庫提供了一套不同的聚類演算法供選擇。下面列出了10種比較流行的演算法:
每個演算法都提供了一種不同的方法來應對數據中發現自然組的挑戰。沒有最好的聚類演算法,也沒有簡單的方法來找到最好的演算法為您的數據沒有使用控制實驗。在本教程中,我們將回顧如何使用來自 scikit-learn 庫的這10個流行的聚類演算法中的每一個。這些示例將為您復制粘貼示例並在自己的數據上測試方法提供基礎。我們不會深入研究演算法如何工作的理論,也不會直接比較它們。讓我們深入研究一下。
在本節中,我們將回顧如何在 scikit-learn 中使用10個流行的聚類演算法。這包括一個擬合模型的例子和可視化結果的例子。這些示例用於將粘貼復制到您自己的項目中,並將方法應用於您自己的數據。
1.庫安裝
首先,讓我們安裝庫。不要跳過此步驟,因為你需要確保安裝了最新版本。你可以使用 pip Python 安裝程序安裝 scikit-learn 存儲庫,如下所示:
接下來,讓我們確認已經安裝了庫,並且您正在使用一個現代版本。運行以下腳本以輸出庫版本號。
運行該示例時,您應該看到以下版本號或更高版本。
2.聚類數據集
我們將使用 make _ classification ()函數創建一個測試二分類數據集。數據集將有1000個示例,每個類有兩個輸入要素和一個群集。這些群集在兩個維度上是可見的,因此我們可以用散點圖繪制數據,並通過指定的群集對圖中的點進行顏色繪制。這將有助於了解,至少在測試問題上,群集的識別能力如何。該測試問題中的群集基於多變數高斯,並非所有聚類演算法都能有效地識別這些類型的群集。因此,本教程中的結果不應用作比較一般方法的基礎。下面列出了創建和匯總合成聚類數據集的示例。
運行該示例將創建合成的聚類數據集,然後創建輸入數據的散點圖,其中點由類標簽(理想化的群集)著色。我們可以清楚地看到兩個不同的數據組在兩個維度,並希望一個自動的聚類演算法可以檢測這些分組。
已知聚類著色點的合成聚類數據集的散點圖接下來,我們可以開始查看應用於此數據集的聚類演算法的示例。我已經做了一些最小的嘗試來調整每個方法到數據集。3.親和力傳播親和力傳播包括找到一組最能概括數據的範例。
它是通過 AffinityPropagation 類實現的,要調整的主要配置是將「 阻尼 」設置為0.5到1,甚至可能是「首選項」。下面列出了完整的示例。
運行該示例符合訓練數據集上的模型,並預測數據集中每個示例的群集。然後創建一個散點圖,並由其指定的群集著色。在這種情況下,我無法取得良好的結果。
數據集的散點圖,具有使用親和力傳播識別的聚類
4.聚合聚類
聚合聚類涉及合並示例,直到達到所需的群集數量為止。它是層次聚類方法的更廣泛類的一部分,通過 AgglomerationClustering 類實現的,主要配置是「 n _ clusters 」集,這是對數據中的群集數量的估計,例如2。下面列出了完整的示例。
運行該示例符合訓練數據集上的模型,並預測數據集中每個示例的群集。然後創建一個散點圖,並由其指定的群集著色。在這種情況下,可以找到一個合理的分組。
使用聚集聚類識別出具有聚類的數據集的散點圖
5.BIRCHBIRCH
聚類( BIRCH 是平衡迭代減少的縮寫,聚類使用層次結構)包括構造一個樹狀結構,從中提取聚類質心。
它是通過 Birch 類實現的,主要配置是「 threshold 」和「 n _ clusters 」超參數,後者提供了群集數量的估計。下面列出了完整的示例。
運行該示例符合訓練數據集上的模型,並預測數據集中每個示例的群集。然後創建一個散點圖,並由其指定的群集著色。在這種情況下,可以找到一個很好的分組。
使用BIRCH聚類確定具有聚類的數據集的散點圖
6.DBSCANDBSCAN
聚類(其中 DBSCAN 是基於密度的空間聚類的雜訊應用程序)涉及在域中尋找高密度區域,並將其周圍的特徵空間區域擴展為群集。
它是通過 DBSCAN 類實現的,主要配置是「 eps 」和「 min _ samples 」超參數。下面列出了完整的示例。
運行該示例符合訓練數據集上的模型,並預測數據集中每個示例的群集。然後創建一個散點圖,並由其指定的群集著色。在這種情況下,盡管需要更多的調整,但是找到了合理的分組。
使用DBSCAN集群識別出具有集群的數據集的散點圖
7.K均值
K-均值聚類可以是最常見的聚類演算法,並涉及向群集分配示例,以盡量減少每個群集內的方差。
它是通過 K-均值類實現的,要優化的主要配置是「 n _ clusters 」超參數設置為數據中估計的群集數量。下面列出了完整的示例。
運行該示例符合訓練數據集上的模型,並預測數據集中每個示例的群集。然後創建一個散點圖,並由其指定的群集著色。在這種情況下,可以找到一個合理的分組,盡管每個維度中的不等等方差使得該方法不太適合該數據集。
使用K均值聚類識別出具有聚類的數據集的散點圖
8.Mini-Batch
K-均值Mini-Batch K-均值是 K-均值的修改版本,它使用小批量的樣本而不是整個數據集對群集質心進行更新,這可以使大數據集的更新速度更快,並且可能對統計雜訊更健壯。
它是通過 MiniBatchKMeans 類實現的,要優化的主配置是「 n _ clusters 」超參數,設置為數據中估計的群集數量。下面列出了完整的示例。
運行該示例符合訓練數據集上的模型,並預測數據集中每個示例的群集。然後創建一個散點圖,並由其指定的群集著色。在這種情況下,會找到與標准 K-均值演算法相當的結果。
帶有最小批次K均值聚類的聚類數據集的散點圖
9.均值漂移聚類
均值漂移聚類涉及到根據特徵空間中的實例密度來尋找和調整質心。
它是通過 MeanShift 類實現的,主要配置是「帶寬」超參數。下面列出了完整的示例。
運行該示例符合訓練數據集上的模型,並預測數據集中每個示例的群集。然後創建一個散點圖,並由其指定的群集著色。在這種情況下,可以在數據中找到一組合理的群集。
具有均值漂移聚類的聚類數據集散點圖
10.OPTICSOPTICS
聚類( OPTICS 短於訂購點數以標識聚類結構)是上述 DBSCAN 的修改版本。
它是通過 OPTICS 類實現的,主要配置是「 eps 」和「 min _ samples 」超參數。下面列出了完整的示例。
運行該示例符合訓練數據集上的模型,並預測數據集中每個示例的群集。然後創建一個散點圖,並由其指定的群集著色。在這種情況下,我無法在此數據集上獲得合理的結果。
使用OPTICS聚類確定具有聚類的數據集的散點圖
11.光譜聚類
光譜聚類是一類通用的聚類方法,取自線性線性代數。
它是通過 Spectral 聚類類實現的,而主要的 Spectral 聚類是一個由聚類方法組成的通用類,取自線性線性代數。要優化的是「 n _ clusters 」超參數,用於指定數據中的估計群集數量。下面列出了完整的示例。
運行該示例符合訓練數據集上的模型,並預測數據集中每個示例的群集。然後創建一個散點圖,並由其指定的群集著色。在這種情況下,找到了合理的集群。
使用光譜聚類聚類識別出具有聚類的數據集的散點圖
12.高斯混合模型
高斯混合模型總結了一個多變數概率密度函數,顧名思義就是混合了高斯概率分布。它是通過 Gaussian Mixture 類實現的,要優化的主要配置是「 n _ clusters 」超參數,用於指定數據中估計的群集數量。下面列出了完整的示例。
運行該示例符合訓練數據集上的模型,並預測數據集中每個示例的群集。然後創建一個散點圖,並由其指定的群集著色。在這種情況下,我們可以看到群集被完美地識別。這並不奇怪,因為數據集是作為 Gaussian 的混合生成的。
使用高斯混合聚類識別出具有聚類的數據集的散點圖
在本文中,你發現了如何在 python 中安裝和使用頂級聚類演算法。具體來說,你學到了:
❷ 聚類演算法有哪些分類
聚類演算法的分類有:
1、劃分法
劃分法(partitioning methods),給定一個有N個元組或者紀錄的數據集,分裂法將構造K個分組,每一個分組就代表一個聚類,K小於N。而且這K個分組滿足下列條件:
(1) 每一個分組至少包含一個數據紀錄;
(2)每一個數據紀錄屬於且僅屬於一個分組(注意:這個要求在某些模糊聚類演算法中可以放寬);
2、層次法
層次法(hierarchical methods),這種方法對給定的數據集進行層次似的分解,直到某種條件滿足為止。具體又可分為「自底向上」和「自頂向下」兩種方案。
例如,在「自底向上」方案中,初始時每一個數據紀錄都組成一個單獨的組,在接下來的迭代中,它把那些相互鄰近的組合並成一個組,直到所有的記錄組成一個分組或者某個條件滿足為止。
3、密度演算法
基於密度的方法(density-based methods),基於密度的方法與其它方法的一個根本區別是:它不是基於各種各樣的距離的,而是基於密度的。這樣就能克服基於距離的演算法只能發現「類圓形」的聚類的缺點。
4、圖論聚類法
圖論聚類方法解決的第一步是建立與問題相適應的圖,圖的節點對應於被分析數據的最小單元,圖的邊(或弧)對應於最小處理單元數據之間的相似性度量。因此,每一個最小處理單元數據之間都會有一個度量表達,這就確保了數據的局部特性比較易於處理。圖論聚類法是以樣本數據的局域連接特徵作為聚類的主要信息源,因而其主要優點是易於處理局部數據的特性。
5、網格演算法
基於網格的方法(grid-based methods),這種方法首先將數據空間劃分成為有限個單元(cell)的網格結構,所有的處理都是以單個的單元為對象的。這么處理的一個突出的優點就是處理速度很快,通常這是與目標資料庫中記錄的個數無關的,它只與把數據空間分為多少個單元有關。
代表演算法有:STING演算法、CLIQUE演算法、WAVE-CLUSTER演算法;
6、模型演算法
基於模型的方法(model-based methods),基於模型的方法給每一個聚類假定一個模型,然後去尋找能夠很好的滿足這個模型的數據集。這樣一個模型可能是數據點在空間中的密度分布函數或者其它。它的一個潛在的假定就是:目標數據集是由一系列的概率分布所決定的。
通常有兩種嘗試方向:統計的方案和神經網路的方案。
(2)動態聚類演算法簡單聚類演算法擴展閱讀:
聚類演算法的要求:
1、可伸縮性
許多聚類演算法在小於 200 個數據對象的小數據集合上工作得很好;但是,一個大規模資料庫可能包含幾百萬個對象,在這樣的大數據集合樣本上進行聚類可能會導致有偏的結果。
我們需要具有高度可伸縮性的聚類演算法。
2、不同屬性
許多演算法被設計用來聚類數值類型的數據。但是,應用可能要求聚類其他類型的數據,如二元類型(binary),分類/標稱類型(categorical/nominal),序數型(ordinal)數據,或者這些數據類型的混合。
3、任意形狀
許多聚類演算法基於歐幾里得或者曼哈頓距離度量來決定聚類。基於這樣的距離度量的演算法趨向於發現具有相近尺度和密度的球狀簇。但是,一個簇可能是任意形狀的。提出能發現任意形狀簇的演算法是很重要的。
4、領域最小化
許多聚類演算法在聚類分析中要求用戶輸入一定的參數,例如希望產生的簇的數目。聚類結果對於輸入參數十分敏感。參數通常很難確定,特別是對於包含高維對象的數據集來說。這樣不僅加重了用戶的負擔,也使得聚類的質量難以控制。
5、處理「雜訊」
絕大多數現實中的資料庫都包含了孤立點,缺失,或者錯誤的數據。一些聚類演算法對於這樣的數據敏感,可能導致低質量的聚類結果。
6、記錄順序
一些聚類演算法對於輸入數據的順序是敏感的。例如,同一個數據集合,當以不同的順序交給同一個演算法時,可能生成差別很大的聚類結果。開發對數據輸入順序不敏感的演算法具有重要的意義。
❸ 聚類演算法有哪些
聚類演算法有:劃分法、層次法、密度演算法、圖論聚類法、網格演算法、模型演算法。
1、劃分法
劃分法(partitioning methods),給定一個有N個元組或者紀錄的數據集,分裂法將構造K個分組,每一個分組就代表一個聚類,K<N。使用這個基本思想的演算法有:K-MEANS演算法、K-MEDOIDS演算法、CLARANS演算法。
2、層次法
層次法(hierarchical methods),這種方法對給定的數據集進行層次似的分解,直到某種條件滿足為止。具體又可分為「自底向上」和「自頂向下」兩種方案。代表演算法有:BIRCH演算法、CURE演算法、CHAMELEON演算法等。
3、密度演算法
基於密度的方法(density-based methods),基於密度的方法與其它方法的一個根本區別是:它不是基於各種各樣的距離的,而是基於密度的。這樣就能克服基於距離的演算法只能發現「類圓形」的聚類的缺點。代表演算法有:DBSCAN演算法、OPTICS演算法、DENCLUE演算法等。
4、圖論聚類法
圖論聚類方法解決的第一步是建立與問題相適應的圖,圖的節點對應於被分析數據的最小單元,圖的邊(或弧)對應於最小處理單元數據之間的相似性度量。因此,每一個最小處理單元數據之間都會有一個度量表達,這就確保了數據的局部特性比較易於處理。圖論聚類法是以樣本數據的局域連接特徵作為聚類的主要信息源,因而其主要優點是易於處理局部數據的特性。
5、網格演算法
基於網格的方法(grid-based methods),這種方法首先將數據空間劃分成為有限個單元(cell)的網格結構,所有的處理都是以單個的單元為對象的。代表演算法有:STING演算法、CLIQUE演算法、WAVE-CLUSTER演算法。
6、模型演算法
基於模型的方法(model-based methods),基於模型的方法給每一個聚類假定一個模型,然後去尋找能夠很好的滿足這個模型的數據集。通常有兩種嘗試方向:統計的方案和神經網路的方案。
(3)動態聚類演算法簡單聚類演算法擴展閱讀:
聚類分析起源於分類學,在古老的分類學中,人們主要依靠經驗和專業知識來實現分類,很少利用數學工具進行定量的分類。隨著人類科學技術的發展,對分類的要求越來越高,以致有時僅憑經驗和專業知識難以確切地進行分類,於是人們逐漸地把數學工具引用到了分類學中,形成了數值分類學,之後又將多元分析的技術引入到數值分類學形成了聚類分析。聚類分析內容非常豐富,有系統聚類法、有序樣品聚類法、動態聚類法、模糊聚類法、圖論聚類法、聚類預報法等。
在商業上,聚類可以幫助市場分析人員從消費者資料庫中區分出不同的消費群體來,並且概括出每一類消費者的消費模式或者說習慣。它作為數據挖掘中的一個模塊,可以作為一個單獨的工具以發現資料庫中分布的一些深層的信息,並且概括出每一類的特點,或者把注意力放在某一個特定的類上以作進一步的分析;並且,聚類分析也可以作為數據挖掘演算法中其他分析演算法的一個預處理步驟。
❹ 動態聚類法有哪些
應該都是動態聚類演算法,K均值肯定是
❺ 聚類演算法有哪幾種
聚類演算法有:聚類分析是通過數據建模簡化數據的一種方法。傳統的統計聚類分析方法包括系統聚類法、分解法、加入法、動態聚類法、有序樣品聚類、有重疊聚類和模糊聚類等。採用k均值、k中心點等演算法的聚類分析工具已被加入到許多著名的統計分析軟體包中,如SPSS、SAS等。
❻ 聚類分析中常見的數據類型有哪些
聚類分宴搭析,又稱群分析,即建立一種分類方法:將一批樣品或者指標(變數),按照它們在性質上的親疏、相似程度進行分類。
按其聚類的方法,數據類型有以下六種:
①系統聚類分析:開始每個對象自成一類,然後將最相似的兩類合並,合並過後重新計算新槐祥槐類與其它類的距離或相近性程度。這一過程一直繼續下去直到所有的對象歸為一類為止
②調優法(動態聚類法):鉛友首先對n個對象進行初步分類,然後根據分類的損失函數盡可能小的原則對其進行調整,直到分類合理為止;
③最優分割法(有序樣品聚類法):開始將所有樣品看成一類,然後根據某種最優准則將他們分割為二類、三類,一直分割到所需要的K類為止;
④模糊聚類法:利用模糊集理論來處理分類的問題,他將經濟領域中最有模糊特徵的兩態數據或多態數據具有明顯的分類效果;
⑤圖論據類法:利用圖論中最小支撐樹的概念來處理分類問題;
⑥聚類預報法:聚類預報彌補了回歸分析和判別分析的不足。
按分類對象的不同:聚類分為R型和Q型
❼ 第六章 數據聚類演算法——基於系統聚類法
數據聚類分析是一種無監督的機器學習方法。數據聚類演算法從演算法實現的不同方式方面可以劃分為結構性或者分散性兩種演算法類型,從計算方式而言,可以拆分為至上而下(大——小,整體到具體)和至下而上(小——大,具體到整體)兩個計算方式。
系統聚類又稱作層次聚類,是通過計算將距離較近的樣本先聚成一類,距離較遠的樣本後聚成了類,通過不斷計算樣本之間距離,最終每個樣本都能找到合適的聚簇。
從聚類的過程分析,可以將聚類劃分為:
1、系統聚類:主要用於對小數據量的樣本間聚類及對指標聚類。
2、逐步聚類法:也稱作為快速聚類法,主要用於對大數據樣本之間的聚類。
3、有序樣本聚類法:用於對有序的數據樣本進行聚類,將次序相鄰的樣本聚為一類的豎閉方法。
4、模糊聚類法:基於模糊數學的樣本聚類分析方法,主要適用於小數據樣本。
在聚類中,主要的距離計算方法包括:最短距離法,最長距離法,中間距離法,重心法,離差平方和法及類平均距離法,這些距離的定法包括了前面介紹過的歐式距離、馬氏距離、餘弦相似性等。
主要通過樣本數值之間的距離計算,然後將距離值最小的樣本進行合並的過程。具體步驟如下:
1、定義樣本數據之間的距離計算方式。
2、計算初始樣本兩兩余凱裂之間的距離,構成距離矩陣。
3、在距離矩陣中篩選出最小的距離值,將最小值對應的兩個樣本合並為一個新的樣本。
4、將新的樣本納入到樣本中,再次進行迭代計算距離矩陣,重復2、3步驟,直到所有的樣本均合並為一個大樣本。
將兩個聚類中心的距離定義為兩個類的重心之間的距離,而類的重心為屬於該類的樣本的平均值。重心的概念能夠較好地體現類的屬性。
利用類平均值法對數據進行聚類的方法屬於動態聚類的方法,也稱作逐步聚類法,大致步驟是實現通過粗粒度的方式對樣本進行分類,然後再逐步調整樣本所屬的聚簇孫物,直到把所有樣本分到合理的聚簇中。
❽ 聚類演算法
1. 概述
K-means聚類演算法也稱k均值聚類演算法,是集簡單和經典於一身的基於距離的聚類演算法。它採用距離作為相似性的評價指標,即認為兩個對象的距離越近,其相似度就越大。該演算法認為類簇是由距離靠近的對象組成的,因此把得到 緊湊且獨立的簇作為最終目標。
2. 演算法核心思想
K-means聚類演算法是一種迭代求解的聚類分析演算法,其步驟是隨機選取K個對象作為初始的聚類中心,然後計算每個對象與各個種子聚類中心之間的距離,把每個對象分配給距離它最近的聚類中心。聚類中心以及分配給它們的對象就代表一個聚類。每分配一個樣本,聚類的聚類中心會根據聚類中現有的對象被重新計算。這個過程將不斷重復直到滿足某個終止條件。終止條件可以是沒有(或最小數目)對象被重新分配給不同的聚類,沒有(或最小數目)聚類中心再發生變化,誤差平方和局部最小。
3. 演算法實現步驟
1、首先確定一個k值,即我們希望將數據集經過聚類得到k個集合。
2、從數據集中隨機選擇k個數據點作為質心。
3、對數據集中每一個點,計算其與每一個質心的距離(如歐式距離),離哪個質心近,就劃分到那個質心所屬的集合。
4、把所有數據歸好集合後,一共有k個集合。然後重新計算每個集合的質心。
5、如果新計算出來的質心和原來的質心之間的距離小於某一個設置的閾值(表示重新計算的質心的位置變化不大,趨於穩定,或者說收斂),我們可以認為聚類已經達到期望的結果,演算法終止。
6、如果新質心和原質心距離變化很大,需要迭代3~5步驟。
4. 演算法步驟圖解
上圖a表達了初始的數據集,假設k=2。在圖b中,我們隨機選擇了兩個k類所對應的類別質心,即圖中的紅色質心和藍色質心,然後分別求樣本中所有點到這兩個質心的距離,並標記每個樣本的類別為和該樣本距離最小的質心的類別,如圖c所示,經過計算樣本和紅色質心和藍色質心的距離,我們得到了所有樣本點的第一輪迭代後的類別。此時我們對我們當前標記為紅色和藍色的點分別求其新的質心,如圖d所示,新的紅色質心和藍色質心的位置已經發生了變動。圖e和圖f重復了我們在圖c和圖d的過程,即將所有點的類別標記為距離最近的質心的類別並求新的質心。最終我們得到的兩個類別如圖f。
K-means術語:
簇:所有數據的點集合,簇中的對象是相似的。
質心:簇中所有點的中心(計算所有點的中心而來)
5. K-means演算法優缺點
優點:
1、原理比較簡單,實現也是很容易,收斂速度快。
2、當結果簇是密集的,而簇與簇之間區別明顯時, 它的效果較好。
3、主要需要調參的參數僅僅是簇數k。
缺點:
1、K值需要預先給定,很多情況下K值的估計是非常困難的。
2、K-Means演算法對初始選取的質心點是敏感的,不同的隨機種子點得到的聚類結果完全不同 ,對結果影響很大。
3、對噪音和異常點比較的敏感。用來檢測異常值。
4、採用迭代方法,可能只能得到局部的最優解,而無法得到全局的最優解。