① 名偵探柯南中關於柯南、灰原和FBI的集數！
128 黑暗組織10億元搶劫事件講述了灰原的姐姐宮野明美被琴酒所殺的情節茄團嫌，為之後灰原出現作鋪墊。
129 來自黑暗組織的女子 大學教授殺人事件，組織代號SHERRY的宮野志保因姐姐被殺以停止APTX4869研究的方式表示抗議，結果被組織囚禁在瓦斯室。絕望的她服下了藏著的APTX4969想要自殺，沒想到與新一一樣沒被或槐毒死而身體縮小成兒童時期模樣，得以掙脫了手銬從垃圾信道逃了出來。新一成了她唯一的希望，疲憊的她倒在新一家門口，被隔壁的阿笠博士所救，並寄住博士家裡，以一名轉校生的身份成為了柯南的同班同學和少年偵探團成員。柯南因此得知了導致他變小的葯的名字和大概信息，不過灰原卻暗示此葯原本的用途不是毒葯。兩人取回了錯寄在廣田教授家的存有葯物資料的軟盤正要查看時，不料電腦卻被軟盤里的暗夜男爵病毒感染，結果資料全毀。灰原雖然隱藏了起來，但是組織卻沒有放棄尋找叛徒的努力，柯南與灰原也就從此捲入了對組織偵查與反偵察的大戲中。
170-171黑暗中的死角，新出智明的父親被其繼母殺害，乍看與主線毫無關系，之後的劇情卻表明這里是青山歷時兩年的一個大伏筆。日後也被朱蒂用來指證貝爾摩得假扮的新出智明。
176-178 與黑暗組織的再會，柯南和灰原意外發現了GIN停在路邊的車子，於是柯南在車上裝上了發信器與竊聽器想獲得組織的情報，雖然得知了黑衣組織成員之一PISCO將在杯戶飯店暗殺吞口議員的計劃，但是竊聽器被Gin發現並毀掉，而且他也通過遺留在車里的茶色頭發聯想到了SHERRY，並肯定她會在酒店現場出現.柯南與灰原潛入宴會想阻止暗殺計劃，不料非但沒有來得及，而且灰原也不幸被PISCO識破身份並綁架囚禁在酒窖中。柯南一方面利用警察拖住嫌疑犯PISCO，一方面提醒灰原喝下白乾成功恢復為SHERRY從壁爐逃出。不料GIN正在屋頂守株待兔，並開槍向SHERRY射擊，在這千鈞一發的時刻，柯南攜變聲器出現用麻醉針射中了GIN，SHERRY得以趁機從煙囪逃生，並恢復成了灰原。PISCO這時也來到酒窖想殺死灰原，卻被柯南揭破了身份，結果PISCO被GIN滅口，死前也沒來得及說出灰原＝SHERRY的秘密。GIN在與柯南的對決中被麻醉針所傷，也發現SHERRY有騎士保護。這一集我們的得到了很多信息，通過PISCO的話，我們的得知灰原研究的葯不是單純的毒葯（「進展到了這個階段」），而且她是繼承了父母的研究。從後來GIN與VERMOUTH的對話中，我們比柯南更早得知了VERMOUTH就是當時的在場的美國超人氣女星克里斯賓雅德，是她將紫色手帕分給PISCO想替他掩蓋罪行。後來柯南懷疑當時PISCO有同夥也是基於此。VERMOUTH在事件後熄影並在日本隱居下來，不過從她的話中卻看不出是接受了組織尋找灰原的任務，而是要「弄清楚一直擔心的事。VERMOUTH決定從小蘭入手尋找新一，因此她盯上了新出智明的身份，決心殺死他並冒充他的身份當上帝丹高中的校醫進行秘密偵查。VERMOUTH利用女星克里斯賓雅德的身份頻繁出入新出的診所，調查新出的生活習慣和人際關系，准備顫手伺機取而代之。這時從美國尾隨她而來的FBI朱蒂等人也洞察到了VERMOUTH的舉動，便設下騙局，使真正的新出在她面前「事故死去」，其實將之秘密轉移，並且開始監視新出的診所。VERMOUTH看見新出一家在自己眼前出了事故，雖然有些疑惑，但還是假扮成新出出現
188-193危命的復活，在這一系列中，VERMOUTH假扮的新出已經當上了帝丹高中和帝丹小學的校醫。吃了灰原研製的解葯後柯南短暫的變回了新一，並化妝成黑衣騎士與蘭見面，卻被化身為新出的VERMOUTH發現，而且被VERMOUTH偷偷拍下了照片，這一點可以從後來在朱蒂老師復制的照片那裡得到佐證。VERMOUTH這時確認了新一沒有死，但是由於當時灰原假扮的柯南也在場，因此還沒猜到柯南=新一。有人說朱蒂這時也在場，照片有可能就是朱蒂拍的。朱蒂當時卻是在場，從227格鬥游戲的陷阱（後篇），她對蘭誇獎舞會上的新一「SO COOL」來看，那天她一定見過新一。（這時朱蒂就已經潛進了學校這件事本身也證明了另一個事實，這時的新出就已經是VERMOUTH假扮的了。）可是除了那時有心調查新一的VERMOUTH會特別拍下照片外，都不知道新一是何方神聖的朱蒂怎麼會特別拍下這個素未謀面的小子的照片呢？因此，照片還是VERMOUTH拍的
226-227格鬥游戲的陷阱，朱蒂與柯南相識，並注意到他藉助園子破案，因此她發現了柯南不簡單，在臨走時COPY了VERMOUTH在照片上對柯南的稱呼――COOL GUY事後朱蒂打電話給同伴時，給VERMOUTH取了「腐爛的蘋果」的代號。但她表示她的監視對象「換了個身份，正在上學」在當時也給了我們她監視的就是柯南的誤導
230-231迷一樣的乘客，剛開始時VERMOUTH與GIN的一段戲就表明了本集和主線有關，我們不但得到了VERMOUTH精於易容的信息，而且知道了她的目的是在日本尋找什麼人，她的口頭禪是A SECRET MAKES A WOMAN WOMAN。少年偵探團和博士一行在公車上遇到一起去美術館的朱蒂和新出，這時哀感到車上有組織的成員變得非常害怕，後來公車被強盜劫持，雖然最後在眾人的努力下強盜被抓，但是哀留在快爆炸的車上想一死了之，最後被柯南所救。朱蒂和赤井都是在監視VERMOUTH，好在在柯南的掩護下無論是朱蒂或是VERMOUTH都沒有發現到哀。本集也是赤井秀一的第一次正式登場，不過他由於偽裝感冒蒙著臉，灰原也因為柯南的保護沒有露臉，所以兩人都沒有發現對方。當被制服的劫匪問朱蒂到底是誰時，她竟然也爆出了一句"A SECRER MAKES A WOMAN WOMAN"! 難道朱蒂老師的真實身份便是VERMOUTH？這一集灰原的感覺使我們找出了三個嫌疑人，朱蒂，赤井和新出，另外值得一提的是新出（VERMOUTH）在車上有維護柯南的舉動。少年偵探團在車上說，感謝新出醫生前幾天幫他們做內科檢查，但是灰原缺席。因此她開始採取一系列誤導和利用FBI的措施，首先她故意偷走了與毛利相關的所有案卷，在《269-270犯罪的紀念品》可以知道。
258-259來自芝加哥的男人，FBI頭頭登場。柯南等人認識了來自芝加哥的老男人「詹姆士 布萊克」，後來他被誤認為是某名人而遭綁架，其實是將計就計，試試柯南的本事。柯南破解出熊貓車的暗號，救出了布萊克。布萊克最後竟然也稱呼柯南為COOL GUY，說明了他和朱蒂是一夥的。赤井接布萊克走的時候說他被戀人甩了，所以剪短了頭發。PS：這一集赤井的長發和點煙的樣子甚至讓人懷疑他和GIN是同一人！赤井駕車出現時被柯南和灰原瞥了一眼，灰原有奇怪的反應。柯南說布萊克先生不是壞人，只是對詹姆斯這個名字與莫利亞蒂教授相同有些在意（與詹姆斯 莫利亞蒂――福爾摩斯的宿敵同名），同時懷疑赤井。
266-268情人節的真相，京極真也帶著黑色針織帽，被人看見，柯南以為是赤井，十分緊張。而小蘭則說她可能認識這個帶黑色針織帽的男人，引起了柯南的注意。
269-270犯罪的紀念品，破獲錄像帶殺人事件的時候，從高木那裡得知公車劫持案那天，毛利小五郎相關的案卷被偷，後又被送回來，暗示有人在調查他們，弄得柯南相當緊張。（後來據VERMOUTH說，偷竊毛利小五郎相關的所有案卷是讓人不知道她其實是在找新出一個案子的記錄，她找新出案件的資料是為了瞞柯南等人，雖然FBI已經知曉她的真實身份，但為了不在與小蘭，柯南等歷經了案件的人的接觸中露出馬腳，她還是要掌握案件的資料，但沒想到是被改過的。再送回來是誤導FBI讓他們以為她留在日本的目的是與毛利偵探有關，從而讓FBI監視毛利事務所來暴露身份。）故事的最後有赤井監視毛利偵探所的畫面，表明了FBI果然將注意力轉向毛利，但給人以赤井監視柯南的的誤導。還有柯南本來想問蘭關於帶黑色針織帽的男人的事，但是最終沒有說出口。
271-272急忙掩飾的忽略，柯南又一次在朱蒂面前破案。從朱蒂提醒蘭有無人跟蹤看，案卷被竊引起了FBI的警覺，朱蒂懷疑黑衣組織將對毛利不利。朱蒂在談話中用鴕鳥一詞來形容柯南小孩卻有大人的智慧，並且提到了bureaus（事務所）代指FBI。（好像和後面出來的COMPANY代指CIA有點對應啊）本集結束時朱蒂說到了收割蘋果的時候了，暗示FBI要對VERMOUTH採取行動了。VERMOUTH發郵件給GIN，提到了「久藏」雪利酒，並且向打了叉的宮野志保的照片發飛鏢，旁邊還有柯南和蘭的照片
277-278英語教師VS西部名偵探，博士得知毛利小五郎相關的案卷被偷，後又被送回來，於是請來平次幫助柯南。兩人分析偷盜案卷的人是想把某個人引出來的圈套，然後柯南又回顧了PISCO案件，懷疑克里斯是他的同夥，並進一步懷疑朱蒂=克里絲。雖然兩人長相完全不同，但柯南知道克里斯精於化裝。於是兩人去朱蒂的公寓試探，並拜託博士在網上調查克里斯的資料。在雙方接觸過程中發生命案，案子雖然解決，但是對朱蒂的試探未果。這一集的重點就是最後在朱蒂的浴室的鏡子後面出現的柯南，蘭和舞會上的新一的照片，並且照片上的字跡和VERMOUTH的一模一樣。按照後來的說法，這是朱蒂曾潛入新出醫院，發現相關的照片後復制的。不過當時這些照片的出現，顯然給了我們朱蒂=貝爾摩的的很大的誤導，還有她最喜歡喝雪莉酒的提示更是使之雪上加霜。另外柯南最後說的除朱蒂外的另兩個可疑人物應該是赤井和新出。
279-280迷宮的陰暗，博士應柯南的要求去克里斯的網站上查過信息，發現她就是美國已故大明星莎隆賓亞德的女兒。在母親的葬禮上，她才第一次面對媒體。面對記者的追問，克里斯曾神秘的回答道：A SECRET MAKES A WOMAN WOMAN。另外，日本的前超人氣女明星也出現在了莎隆的葬禮中，從畫面看正是有希子。（我認為正是基於這個證據，柯南推理出了莎龍和克里斯其實是一個人。）
284-285中華街雨中的似曾相識，
286-288工藤新一NY事件，承接前面蘭回憶起的「帶黑色針織帽的男子」，通過蘭在發燒病倒時的回憶倒述了去紐約經歷的黃金蘋果事件。還交代了新一和蘭和莎龍的初次見面，以及他們對銀發殺人魔的救命之恩。最後提到真殺人魔其實是別人滅口的，後來得知假殺人魔正是VERMOUTH所扮，這次計劃本來是將秀一引出並殺死，但是沒有成功。
309-311與黑暗組織接觸，案子的開頭柯南和蘭遇到了赤井秀一，在談話中赤井提到了一個表面堅強、暗地流淚的女孩。（估計應該是指宮野明美，他的女朋友。）有人提到，對赤井說蘭「經常」哭感到難以理解，其實這是因為赤井曾經監視過毛利偵探所，因此多次看見蘭暗暗哭泣。另外藉此，柯南也了解到了當年蘭和赤井相遇的事情，獲知了赤井FBI的身份，赤井的嫌疑大大降低。通過閱讀板倉的日記得知，黑衣組織委託其開發一種危害人類的軟體，但他並未最終完成。柯南誘騙VODKA改時間交易，試圖冒充板倉與VODKA接頭，從而想得到他的指紋和行蹤的情報，不料即將成功之際，卻由於GIN的忽然出現而功虧一簣，柯南還險些被發現，最後躲在儲物櫃里才僥幸得脫。最後柯南和哀離開的時候，在附近的赤井和哀好像對彼此都有所感覺。
335-336東都顯影所的秘密，有希子回到日本，接偵探團去東都顯影所看電影。在路上有希子和柯南發現他們正在被人跟蹤，柯南認為跟蹤者不是沖著他就是沖著灰原來的，並且很有可能就是黑衣組織的人。其實後來得知是赤井手下的人在監視柯南等人，結尾處赤井還拍下了少年偵探團的照片，還看著哀說太像了，說明了FBI已經中了VERMOUTH的圈套，幫助她找到了變小的SHERRY。但是當時卻讓人覺得赤井很可疑。
338-339 4輛保時捷，開頭處柯南奇怪的騙博士說新出不在家，為什麼不對博士老實說出對新出的懷疑？但後來不明情況的博士還是找來了新出給小哀看病，VERMOUTH假扮的新出就正式確認了哀就是SHERRY，並且在博士家裝了竊聽器，但是朱蒂同時也在場，所以那時我們將所有的懷疑都加到了朱蒂身上。結尾處VERMOUTH冷笑著用打火機燒掉了SHERRY的照片，並得意地自言自語道：「找到了……你准備好了嗎？我來找你了！」VERMOUTH要准備採取行動了，真是山雨欲來風滿樓啊。
340-341廁所隱藏的秘密，柯南、灰原和博士去了灰原的父親宮野博士生前工作過的事物所，想從那裡得到一些黑衣組織的資料以及灰原父母的行蹤。結果他們在廁所中找到了宮野明美放在那裡的灰原媽媽留給灰原的磁帶。這一集透露了很多內容，開頭處柯南說了句「如果我的推理正確的話，我們應該已經不在人世了」，證明他已經知道新出是克里斯假扮的，而且明白灰原和他的身份已經暴露，正是不知道她為什麼還沒有採取行動。灰原找到了明美藏起來的錄音帶，她的母親的面目也浮出水面，「Hell Angle」由此而來。在她母親留給她的18歲生日末尾的話語中應該提到了某件驚人的事情，但是青山並沒有說明。結尾處，VERMOUTH邊從飛機場出來邊用手機通著電話，從談話中我們得知，她找來了一個叫Calvados（蘋果酒）的組織成員，似乎是為她下一步要採取的行動做的一個重要部署。另外值得一提的是，在灰原的夢中，青山已經給出了VERMOUTH究竟裝扮成了何人的暗示，眼睛沒問題的話，一定就可以發現了。
343-344便利店的陰謀，柯南發現工藤宅子有人來過的痕跡，而且不是小蘭。朱蒂老師突然間辭去了帝丹高中英文教師的工作，說是想回美國了。（其實是要對VERMOUTH採取行動了）在告別派對上，小蘭無意間在朱蒂的衛生間的鏡子後面發現了朱蒂藏著的自己與柯南，灰原等人的照片，不禁疑雲頓生。這也促使她下一集中偷偷躲在朱蒂後車廂里想調查她究竟想做什麼。
345與黑衣組織直面對決滿月之夜的二元推理,柯南收到了VERMOUTH寄來的邀請新一去參加化妝舞會的信件，稱呼竟然是江戶川柯南！柯南知道自己的身份已經暴露並且決定開始行動，他一方面邀請服部假扮新一去參加化妝舞會，另一方面用麻醉針麻醉灰原後假扮成她的樣子准備獨闖組織。來接他的不是VERMOUTH假扮的新出，而是朱蒂！原來FBI也有自己的計劃，他們准備先VERMOUTH一步接走灰原，引誘VERMOUTH跟蹤至碼頭，然後實施抓捕。（柯南這時應該不確定朱蒂和新出誰是VERMOUTH，而且他倆還有可能是一夥的，所以他帶上了竊聽器）朱蒂在車上表明了FBI的身份後，柯南告訴了她新出一案（170-171黑暗中的死角）的真相，要求她利用此來揭穿VERMOUTH，以取得自己的信任。朱蒂揭穿了VERMOUTH同時是克里斯賓雅德和莎龍賓雅德，但在她招呼同伴要抓捕VERMOUTH時，不料卻被埋伏的Calvados擊傷。原來VERMOUTH棋高一著，她早就知道了FBI的抓捕計劃，提前化妝成朱蒂來到碼頭，命令埋伏的FBI探員撤退了。而且VERMOUTH對FBI監視新出診所也早已知曉，偷走案卷是為了引誘FBI暴露身份，貼出宮野志保的照片是利用FBI尋找目標。正當朱蒂形勢危及時，另一邊化妝的服部解決了舞會上的案子扯下了偽裝，柯南也撕下面具用麻醉針控制住了VERMOUTH，柯南的籌劃終於笑到了最後。但是這時風雲突變，擔心柯南安危的灰原利用備用的追蹤眼鏡忽然找來，反而破壞了柯南的大好計劃，VERMOUTH趁機用麻醉針射中了柯南，並把手槍對准了灰原！就在這形勢失控的時候，小蘭忽然從朱蒂車子的後備箱跳出保護了灰原，赤井也及時出現迫使VERMOUTH不得不以柯南為人質逃離了碼頭。正當VERMOUTH向BOSS發郵件報告時，忽然發現柯南身上有發信器，原來柯南留了一手，他早料到VERMOUTH找到灰原後一定會向BOSS報告。VERMOUTH不得不承認放棄SHERRY，為了避免BOSS的郵件地址和身份泄露，VERMOUTH不得不使用了催眠瓦斯，並且朝自己開了一槍以保持清醒，毀掉發信器後狼狽逃離了現場。
425 Black impact！被組織的魔掌觸碰的瞬間，通過忘記取回的竊聽器，柯南卻發現了驚天的大秘密！原來電視台主持人水無憐奈也是黑衣組織的成員，柯南竊聽到了她和GIN等人的暗殺計劃，並成功阻止。不料琴酒發現水無鞋底的竊聽器，小五郎反而受到他們懷疑，危在旦夕。好在秀一及時出現，擊傷了GIN，將裝竊聽器的勾當攬到了FBI身上。VERMOUTH也又再次保護了毛利等人。代號KIR的水無憐奈在行動中受傷昏迷，被FBI送入杯戶中央醫院控制了起來。另外這一集中柯南得知了布萊克也是FBI的人。
429-430無法回到從前的兩個人，小蘭的倒霉同學本堂英佑出場，眼睛長的和水無很像，好像注意到了柯南通過毛利破案，這讓柯南感覺很不安，對本堂的身份產生了懷疑。
462黑衣組織的影子 年幼的目擊者，一個孩子目擊某歌星被人從橋上扔下，本堂用和水無一樣的摸脈搏測謊術，引起了柯南的懷疑。
463.黑衣組織的影子 奇怪的照明，本堂數次想讓毛利等人想起水無的事情來獲取信息，但是都被柯南看出並把話題岔開。
464 黑衣組織的影子 謎樣的高額報酬，本堂故意引誘毛利注意到一個小孩家發生的奇怪事件，這個小孩正是目擊水無憐奈受傷的小孩，他說他的母親生前曾經和奇怪的外國女人對話，打聽水無憐奈的去向。
465.黑衣組織的影子 珍珠流星，在那個小孩就要說出摔下摩托車的就是主持人水無憐奈時，柯南及時用假面超人將話題岔了開去。柯南通過外國女人對孩子的回答"A SECRER MAKES A WOMAN WOMAN"推測出這個女人就是VERMOUTH。另外本集GIN所說的水無取得BOSS信任的事件也表明她與一個叫本堂的卧底的死有很大關系。
484-485黑色照片的去向，服部調查水無未果，但意外發現本堂及其父親在大阪生活的情況，因為瑛佑小時候曾經和父親一起去大阪的燒烤屋吃燒烤，其父和店長很談得來。然而店長已經去世，所以柯南、阿笠博士和灰原決定造訪住在東京的店長的孫子家，想從他那裡得到些本堂及其父親的情報。不料在這個模型愛好者西郡家裡遭遇了盜竊案件，成功解決後柯南他們終於看到了瑛佑無意間照的照片，照片上看到了瑛佑的父親，並了解到瑛佑的父親常和黑西裝的外國人打交道，並在Company（＝CIA）工作，曾打入過黑衣組織。
491 紅與黑的碰撞 開始
柯南將取得了本堂瑛佑小時候和父親的照片一事，及本堂的父親等人的會話內容在電話里告知了平次。2人覺得本堂的父親與黑色組織之間似乎有某些關聯。電話後，柯南與小蘭、園子一起前往西米花醫院看望初中時的同學。探望後出來，園子在醫院的走廊看見了本堂。本堂手持水無憐奈的照片向護士打聽著什麼…。
492 紅與黑的碰撞 血緣
柯南等人在看到了本堂姐姐的照片，庵野也只能確認自己只見過憐奈年輕的時候。庵野用舊影像資料進行了確認。那個錄像是報導工廠發生爆炸事故的現場節目。由於要輸血，護士在尋找AB型的人，當聽到需AB型的話時，憐奈作出了要去獻血的舉動。因此，本堂作出了憐奈不是自己姐姐的結論。此時，柯南打算讓本堂告訴大家，他和自己姐姐之間有關血型的事情…。
493 紅與黑的碰撞 疾呼
小五郎接到作為父親的奧平角藏希望復查於1年前身亡的兒子鍛吾的事件的委託。角藏認為家中某人就是犯人。當天，角藏和妻子詠子，女傭人菊代，管家瀨川從晚上7點到12點在起居室觀看錄像帶。其間，鍛吾在自家泳池溺斃。根據推斷，死亡時間為晚9點至10點之間。聞聽此言，小五郎便做出不可能是家人犯案的結論，然而…。
494 紅與黑的碰撞 冥土
上吊致死的角藏的腳邊，放著一本名為《來自黃泉的殺手》的書。封面上的「黃泉」兩個字沾有大量血跡，而且還有用血寫成的像是平假名「こ」的字。目暮警官等人認為這是死者留下的死亡訊息，於是推斷兇手便是死者家中的某一人。就在警官一一確認眾人的不在場證明時，柯南留意到了桌上角藏的便條本…。
495 紅與黑的碰撞 昏睡
柯南向灰原講述了本堂瑛佑的姐姐和水無憐奈並不是同一個人。柯南回家後蘭告訴他，自從放寒假就聯系不到本堂了，並且說在寒假之前好像聽到本堂說過在杯子戶中央醫院發現了什麼線索，柯南以為是水無憐奈所在的醫院被本堂找到了。但其實本堂所講的線索是指他音信皆無的父親，他好像是找到了他父親公司的同事…。
496 紅與黑的碰撞 入侵
杯戶中央醫院的護士雅江告訴柯南，本堂瑛佑在別家醫院里動過手術一事。據說本堂曾患白血病，在搬來大阪前動了手術。隨後，FBI成員James前來報告，潛伏在醫院的黑衣組織成員就在右腳骨折的新木張太郎、頸椎扭傷的楠田陸道和急性腰痛的西矢忠吾這3人之中。James等人尋思著如何找出那人…。
497 紅與黑的碰撞 覺醒
深夜，打算尋找組織同夥的楠田潛入了護士值班室。朱蒂等人雖打算進行抓捕，但是楠田趁亂逃走。隨後，楠田駕車逃跑途中，發覺被赤井跟蹤，遂自殺。朱蒂對組織調查憐奈病房的事情，沒有成功稍感安心，但GIN，Vodka等人已經察覺Kir（憐奈）就在杯戶中央醫院一事。GIN為了營救出Kir，而在制訂著下一步計劃…。
498 紅與黑的碰撞 攪亂
醫院附近相繼發生突發集體食物中毒，奇怪氣味引發的人員騷動，火災等3件大事。之後，在醫院的問訊處接到了給James的包裹。郵件委託人是已經自殺的組織同夥楠田，包裹內是一盆稱作樓鬥草的花。此後，捲入之前3起事件的傷者、病人蜂擁而至，接待大廳FBI無法進行例行搜查，不久便陷入混亂。其間，赤井發現花盆中被放置了炸彈…。
499 紅與黑的碰撞 偽裝
在裝有杯戶中央醫院的患者們的慰問品中，發現大約有60枚炸彈也混了進來。搜查官們在收繳炸彈的時候發現電視上居然出現了穿著住院服的水無憐奈。搜查官們奔向憐奈的病房，但看到的卻是躺在床上的憐奈。原來電視上的影像是利用以前的資料進行剪輯處理合成的。組織根據炸彈的中放入的發信器，鎖定了憐奈的病房。察覺到這點的James決定採取最後的手段…。
500 紅與黑的碰撞 遺言
FBI制定了使用3輛車子進行掩護，轉移Kir（憐奈）的計劃。GIN准確判斷出Kir（憐奈）乘坐的是3號車。組織決定跟蹤3號車。駕駛車輛的CAMEL打算甩掉跟蹤，卻突然遭到裝炸彈的盒子的襲擊，3號車隨之撞上護欄停了下來。隨後，憐奈從副駕駛位置上跳了下來。之後，基安蒂打算解決掉CAMEL的時候，突然3號車發生了爆炸…！？
501 紅與黑的碰撞 嫌疑
柯南與元太、步美、光彥、阿笠博士，灰原等人一同前往新米花旅館吃自助餐。途中，柯南向灰原講述了之前的事情。到達後，看到高木刑警的巡邏車也開了過來。據說是旅館發生了殺人事件。被害人是租住在旅館39樓的以培養外國演員為主的經濟公司的社長。秘書說看到社長的上半身被手槍數次擊中的話，被柯南聽到了…。
502 紅與黑的碰撞 潔白
嫌疑犯是托比·凱恩斯，哈魯·巴庫那，FBI的CAMEL探員三人中的一人。隨後，千葉刑警在屋頂的用具里雨衣、手套、手槍後，秘書伊莉娜也成了嫌疑犯中的一人。調查遺體後，柯南決定從似乎握著什麼的右手著眼調查。隨後發現桌子上的備忘錄用紙和鋼筆桿。而此時，GIN為了消除疑慮，向Kir傳達了讓赤井秀一從這個世界上消失的命令。
503 紅與黑的碰撞 決死
須內被殺案的搜查停滯不前、沒有進展。等待破案期間，嫌疑人哈魯和伊莉娜回到了各自的工作崗位，托比對這兩人如此看重工作而倍感驚訝。隨後，柯南留意到犯人拿走了記事本，於是告知目暮警官有關辨別犯人的方法。他說只要准備與嫌疑人人數相同的椅子，然後嘴裡說出某種咒語，便可以知道犯人是誰。於是，目暮警官把4人召集到房內，讓他們站在椅子前，並開始念起柯南教他的咒語
504 紅與黑的碰撞 殉職
赤井和kir在來葉山路碰面了。此後，kir用手槍射穿了赤井的肺部。通過攝像機查看情況的GIN，向kir下達了繼續行刺的命令。手捂腹部的kir用手槍向赤井的額頭開了一槍。之後，由於巡邏車的出現，kir將赤井的遺體橫放在了車上，並安置了定時炸彈後，乘車離去。隨後，巡邏車在開到赤井的車附近的瞬間，炸彈爆炸了…。
至於最新的就貌似沒啥了，就只有一些小小的片段，有興趣的話看看開頭就還了。
希望你喜歡~~這個還是以前我自己的回答呢
支持柯南，支持哀，
永遠~~~~