蛋白質組學pdf

❼ 蛋白質的結構層次區分

蛋白質的結構層次：一級結構、二級結構、超二級結構、結構域、三級結構、四級結構.。 1、一級結構：即蛋白質的共價結構或平面結構，核心內容就是aa的排列順序，它的改變涉及到蛋白質共價鍵的破壞和重建。
一級結構的全部內容包括：肽鏈的個數、aa的順序、二硫鍵的位置、非aa成分。 2、二級結構的定義：肽鏈主幹在空間的走向。主幹指的是肽平面與α-C構成的鏈子， 2.1二級結構的內容：空間走向以及維持這種走向的力量：氫鍵和R基團的影響（離子鍵、疏水鍵、空間障礙等）
2.2二級結構的描述：ф角：肽平面繞N-Cα單鍵旋轉的角度
ψ角：肽平面繞Cα-C羧基單鍵旋轉的角度，至於+-方向的規定，0度角的規定太復雜，不作要求。
這樣，一個肽平面的空間位置可以被2個二面角來確定，如果每個肽鏈的兩個二面角（ф，ψ）都相同，則構成了規則的空間走向，所以可以用（ф，ψ）來描述肽鏈的二級結構。 3、超二級結構：空間相鄰的幾個2級結構形成的更復雜的結構，其類型有： 1、左手超螺旋：3根α-右手螺旋擰到一起形成一個左手超螺旋，如頭發中的角蛋白， 2、右手超螺旋：3根左手螺旋擰到一起形成一個右手超螺旋，如膠原蛋白，
3、αα：相鄰的2根α-右手螺旋擰到一起形成一個左手超螺旋，
4、β×β：一個連接鏈連著2個β折疊，平行式，這個連接鏈可以很長。
5、βαβ：3段β折疊和2段α螺旋相間形成，
6、βββ：以2段U-型回折連接著的3段β折疊，反平行式。
4.、結構域：長肽鏈（多於150個aa），在二級結構的基礎上通過多次折疊，在空間上形成一些半獨立的球狀結構，叫結構域，它是三級結構的一部分，結構域之間靠無規捲曲連接。也就是說將三級結構拆開後首先看到的結構。. 5、三級結構：即蛋白質的三維結構、構象，指其中所有原子的空間排布，是結構域再經過捲曲和折疊後形成的。如果蛋白質是單條肽鏈，則三級結構就是它的最高級結構，三級結構由二硫鍵和次級鍵（氫鍵、疏水鍵、離子鍵、范德華力）維持。P99是肌紅蛋白的三級結構。
6、四級結構：多條肽鏈通過非共價鍵（氫鍵、疏水鍵、離子鍵、范德華力）形成的聚合體的結構就是四級結構，注意，由二硫鍵連接的幾條肽鏈不具有四級結構。每條肽鏈都有自己的三級結構，稱為亞基或亞單位，一般情況下，具有四級結構的蛋白質含有的肽鏈不會太多，故稱這類蛋白質為寡聚蛋白，如寡聚酶等。

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