RAR
和
ZIP
兩種格式均支持加密功能。
若要加密文件，在壓縮之前你必須先指定密碼，或直接在
壓縮文件名和參數
對話框中指定。
在
命令行
模式時使用開關
-p[密碼]。
而在
WinRAR
圖形界面時，要輸入密碼你可以按下
Ctrl+P
或者是在
文件菜單
選擇「設置默認密碼」命令。
另一種方式是單擊
WinRAR
窗口底部左下角的鑰匙圖標。在
壓縮文件名和參數對話框
里的「高級選項」組中按下「設置密碼」按鈕輸入密碼。
和
ZIP
不同，RAR
格式不只允許數據，而且其它的可感知的壓縮文件區域：文件名、大小、屬性、注釋和其它塊都可加密。如果你希望這樣做，你需要在密碼對話框中設置「加密文件名」
選項，或在命令行模式使用
-p[密碼]
的開關
-hp[密碼]。以這種方式加密的文件，如果沒有密碼甚至不可能查看文件列表。
當不再需要的時候，別忘了將輸入的密碼刪除。不然你或許又加密了別的壓縮文件，但卻不希望使用同一組密碼。要刪除密碼時，只需要輸入空字元串來替換原先的密碼，或者先關閉
WinRAR
並重新啟動一次。當有密碼存在時，鑰匙的圖標是紅色的，否則它是黃色的。而且，當你使用密碼開始壓縮操作時，標題欄
壓縮文件名和參數對話框
也會閃爍兩次。
如果你在
壓縮文件名和參數
對話框直接輸入它，你不需要刪除密碼。這不同於其它方式，此類密碼僅在單一壓縮操作有效，並在完成後它會自動刪除。
當解壓加密的文件時，開始操作之前你也可以不需要事先輸入密碼。如果
WinRAR
遇到加密的文件，而解壓之前未先輸入密碼的話，它便會提示用戶輸入密碼。
WinRAR
支持
ZIP
2.0
格式使用私有加密演算法。
RAR
壓縮文件使用更強大的
AES-128
標准加密。如果你需要加密重要的信息，選擇
RAR
壓縮文件格式會比較好一些。為了確實的安全性，密碼長度請最少要
8
個字元。不要使用任何語言的單詞作為密碼，最好是任意的隨機組合字元和數字，並且要注意密碼的大小寫。請記住，如果你遺失你的密碼，你將無法取出加密的文件，就算是
WinRAR
的作者本身也無法解壓加密過的文件。