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hadoop壓縮配置

發布時間:2024-10-28 05:01:49

A. Hadoop 壓縮從理論到實戰

在大數據領域,無論上層計算引擎採用的是什麼,在存儲過程中,壓縮都是一個避不開的問題。合適的壓縮選擇可以降低存儲成本、減少網路傳輸I/O。而錯誤的壓縮選擇則可能讓 cpu 負荷達到瓶頸、降低並發度等等,所以是否選擇壓縮、選擇什麼壓縮格式在大數據存儲環節中都是一個至關重要的問題。

點評:壓縮時間和壓縮率之間的取捨本質上是 cpu 資源和存儲資源的取捨。是否需冊猛要支持分片也不是絕對的,如果單個文件大小均小於 splitSize,則沒必要支持分片。

點評:一階段考慮盡可能支持分片(單個文件大於 splitSize 時)。二階段考慮盡可能快的壓悄姿基縮速度。三階段根據是作為長期歸檔(幾乎不用)or 作為下一作業輸入,考慮盡可能高的壓縮能力 or 支持分片。

點評:有兩點需要注意,第一點:這里的速度和壓縮率沒有具體測試數據,而是給出了一個模糊的表達。因為即使具體測試了速度和壓縮率,也會因數據不同而結果有很大的差異。後面會給出測試的腳本,大家可以結合自己的表數據自行測試。第二點:有些壓縮格式性能參數很相似,為什麼 Hadoop 中要搞這么多種?較為直觀的一個原因是:不同存儲格式支持的壓縮是不一樣的,比如 orc 存儲格式只支持 zlib 和 snappy 兩種壓縮 [8] ,parquet 雖然支持很多壓縮格式,但是不支持 bzip2 [7]

以下摘自《Hadoop The Definitive Guide》

重點閱讀文中加粗片段。大致意思是:因為 gzip 壓縮格式使用的 DEFLATE 壓縮演算法沒辦法做到隨機任意讀取,必須同步順序讀取。也就意味著沒辦法為每一個 block 創建一個分片(split),然後為該分片啟一個 mapper 去讀取數據。所以即使 gzip 文件有很多 block,MR 程序也只會啟動一個 Mapper 去讀取所有的 block。也即 gzip 這種壓縮格式不支持分片。相反的,如果壓縮格式使用的演算法支持隨機任意讀取,那麼就可以為每一個 block 創建一個分片,同時啟動一個 mapper 去讀取數據,這樣有多少個 block 就有多少個分片,就有多少個 mapper ,這些 mapper 並行讀取數據,效率大大提升。上述涉及到幾個小概念,接下來分別進行詳述。

一句話總結: zlib、gzip 在大數據語境中都是一種 壓縮格式 ,他們使用相同的 壓縮演算法: DEFLATE,DefaultCodec 是 zlib 使用的 編解碼器 ,Gzip 使用的編解碼器是 GzipCodec

我們知道,Hadoop 在任務切分時,是按照文件的粒度進行的。即一個文件一個文件啟謹進行切分。而每一個文件切分成幾塊,取決於 splitSize 的大小。比如兩個文件,第一個文件 300M,第二個文件150M。分片大小是128M,那麼對於第一個文件將會切分成3片(128M,128M,44M),第二個文件會切分成2片(128M,22M)。共計5片。所以分片數量除了由文件數決定,另一個決定因素就是 splitSize 即分片大小。

splitSize 如何計算?

幾個前提:

影響參數:

接下來進行實際驗證:

經過了 2.4.2 中的一系列實驗,驗證了一個結論:當一個輸入格式支持分片時,mapper 數量是無限制的,反之 mapper 數量小於等於文件的數量。所以我們可以通過設置參數來試圖調小分片大小來增加 mapper 數量看其上限是否等於文件數量即可。假如輸入的文件個數只有一個,那麼當 mapper 數量大於1的時候,說明該輸入格式是支持分片的。

大家可以根據自己數據集和想測試的壓縮和存儲格式自行修改腳本。通過以上腳本跑出來的結果如下:

由 2.1 中評價壓縮的三項指標可知,壓縮率、壓縮/解壓速度、是否支持分片是衡量壓縮最重要的三項指標。3.1.1小節中只對壓縮率進行了測試。壓縮/解壓速度可以通過跑一些查詢語句進一步測試。這里就不展開測試了。業界中常用的存儲格式一般是 parquet, orc,所以上面測試除了純文本只測試了這兩種存儲格式。

我們可以通過 hive> set io.compression.codecs; 來查看當前Hadoop集群支持的壓縮,在公司的集群中查詢得到的結果是:

可以看到 lzo 有兩種編解碼器: LzoCodec 和 LzopCodec。他們之間有什麼區別呢?

如果你閱讀過關於 Hadoop 壓縮的文章,應該可以看到,絕大多數文章中對於 snappy 是否支持分片都是直接給出的否定的答案。 CDH 的文檔中也指出來 snappy 是不支持分片的。

看文中加粗片段,雖然 snappy 本身是不支持分片的,但是如果 snappy 存儲在一些特定的存儲格式比如 SequenceFile 或者 Avro 中,那麼是可以支持分片的。也就是說 snappy 是否支持分片是分情況討論的。不能說使用了 snappy 壓縮就一定不支持分片。前面提到了,業界中常用的存儲格式一般是 parquet 或者 orc,而上面 CDH 的文章中恰恰沒有提到 parquet 和 orc 是否支持,接下來以 parquet 為例,進行測試。測試內容即為 parquet + snappy 組合,是否支持分片。
首先准備數據,因為之前做壓縮率測試,已經有了 parquet + snappy 文件了,這里直接拿來用。

一共3個輸入文件,啟了6個mapper,說明輸入文件是可以分片的。即 parquet + snappy 的組合是支持分片的。在《Hadoop The Definitive Guide》中也對 parquet 是否支持分片有說明:

以 maprece.output.fileoutputformat.compress.codec 為例,這個參數可以在三個地方配置:

那麼當三者都設置時,以哪個為准呢?按照經驗來看,一定是粒度小的優先順序大於粒度大的優先順序。經過測試也驗證了這種猜測。即:表級別 > hive > hadoop

初學者往往容易混淆存儲格式和壓縮格式之間的關系,其實二者是完全獨立的。如果完整的閱讀了該篇文章,應該已經消除了這一塊理解對誤區。這里總結一下:比如 parquet, orc,他們都是常見的 存儲格式 。是否使用壓縮,使用何種壓縮都是可以設置的。而 zlib、gzip、lzo、lz4、snappy 等等這些都是常見的 壓縮格式 ,他們既可以依附於某些 存儲格式 ,比如之前提到的 parquet + snappy,orc + zlib 等等。也可以脫離特定的 存儲格式 ,比如純文本文件進行壓縮,text + parquet, text + bzip2 等等。

B. Hive優化之Hive的配置參數優化

Hive是大數據領域常用的組件之一,主要用於大數據離線數倉的運算,關於Hive的性能調優在日常工作和面試中是經常涉及的一個點,因此掌握一些Hive調優是必不可少的一項技能。影響Hive效率的主要因素有數據傾斜、數據冗餘、job的IO以及不同底層引擎配置情況和Hive本身參數和HiveSQL的執行等。本文主要從建表配置參數方面對Hive優化進行講解。

1. 創建一個普通表

table test_user1(id int, name string,code string,code_id string ) ROW FORMAT DELIMITED FIELDS TERMINATED  BY ',';

2. 查看這張表的信息

DESCRIBE FORMATTED  test_user1;

我們從該表的描述信息介紹建表時的一些可優化點。

2.1 表的文件數

numFiles表示表中含有的文件數,當文件數過多時可能意味著該表的小文件過多,這時候我們可以針對小文件的問題進行一些優化,HDFS本身提供了解決方案:

(1)Hadoop Archive/HAR:將小文件打包成大文件。

(2)SEQUENCEFILE格式:將大量小文件壓縮成一個SEQUENCEFILE文件。

(3)CombineFileInputFormat:在map和rece處理之前組合小文件。

(4)HDFS Federation:HDFS聯盟,使用多個namenode節點管理文件。

除此之外,我們還可以通過設置hive的參數來合並小文件。

(1)輸入階段合並

需要更改Hive的輸入文件格式,即參數hive.input.format,默認值是org.apache.hadoop.hive.ql.io.HiveInputFormat,我們改成org.apache.hadoop.hive.ql.io.CombineHiveInputFormat。這樣比起上面對mapper數的調整,會多出兩個參數,分別是mapred.min.split.size.per.node和mapred.min.split.size.per.rack,含義是單節點和單機架上的最小split大小。如果發現有split大小小於這兩個值(默認都是100MB),則會進行合並。具體邏輯可以參看Hive源碼中的對應類。

(2)輸出階段合並

直接將hive.merge.mapfiles和hive.merge.mapredfiles都設為true即可,前者表示將map-only任務的輸出合並,後者表示將map-rece任務的輸出合並,Hive會額外啟動一個mr作業將輸出的小文件合並成大文件。另外,hive.merge.size.per.task可以指定每個task輸出後合並文件大小的期望值,hive.merge.size.smallfiles.avgsize可以指定所有輸出文件大小的均值閾值,默認值都是1GB。如果平均大小不足的話,就會另外啟動一個任務來進行合並。

2.2 表的存儲格式

通過InputFormat和OutputFormat可以看出表的存儲格式是TEXT類型,Hive支持TEXTFILE, SEQUENCEFILE, AVRO, RCFILE, ORC,以及PARQUET文件格式,可以通過兩種方式指定表的文件格式:

(1)CREATE TABLE ... STORE AS <file_format>:在建表時指定文件格式,默認是TEXTFILE

(2)ALTER TABLE ... [PARTITION partition_spec] SET FILEFORMAT <file_format>:修改具體表的文件格式

如果要改變創建表的默認文件格式,可以使用set

hive.default.fileformat=<file_format>進行配置,適用於所有表。同時也可以使用set

hive.default.fileformat.managed = <file_format>進行配置,僅適用於內部表或外部表。

擴展:不同存儲方式的情況

TEXT,

SEQUENCE和

AVRO文件是面向行的文件存儲格式,不是最佳的文件格式,因為即便只查詢一列數據,使用這些存儲格式的表也需要讀取完整的一行數據。另一方面,面向列的存儲格式(RCFILE,

ORC, PARQUET)可以很好地解決上面的問題。關於每種文件格式的說明,如下:

(1)TEXTFILE

創建表時的默認文件格式,數據被存儲成文本格式。文本文件可以被分割和並行處理,也可以使用壓縮,比如GZip、LZO或者Snappy。然而大部分的壓縮文件不支持分割和並行處理,會造成一個作業只有一個mapper去處理數據,使用壓縮的文本文件要確保文件不要過大,一般接近兩個HDFS塊的大小。

(2)SEQUENCEFILE

key/value對的二進制存儲格式,sequence文件的優勢是比文本格式更好壓縮,sequence文件可以被壓縮成塊級別的記錄,塊級別的壓縮是一個很好的壓縮比例。如果使用塊壓縮,需要使用下面的配置:set

hive.exec.compress.output=true; set io.seqfile.compression.type=BLOCK

(3)AVRO

二進制格式文件,除此之外,avro也是一個序列化和反序列化的框架。avro提供了具體的數據schema。

(4)RCFILE

全稱是Record Columnar File,首先將表分為幾個行組,對每個行組內的數據進行按列存儲,每一列的數據都是分開存儲,即先水平劃分,再垂直劃分。

(5)ORC

全稱是Optimized Row Columnar,從hive0.11版本開始支持,ORC格式是RCFILE格式的一種優化的格式,提供了更大的默認塊(256M)

(6)PARQUET

另外一種列式存儲的文件格式,與ORC非常類似,與ORC相比,Parquet格式支持的生態更廣,比如低版本的impala不支持ORC格式。

配置同樣數據同樣欄位的兩張表,以常見的TEXT行存儲和ORC列存儲兩種存儲方式為例,對比執行速度。

TEXT存儲方式

總結: 從上圖中可以看出列存儲在對指定列進行查詢時,速度更快, 建議在建表時設置列存儲的存儲方式 。

2.3 表的壓縮

對Hive表進行壓縮是常見的優化手段,一些存儲方式自帶壓縮選擇,比如SEQUENCEFILE支持三種壓縮選擇:NONE,RECORD,BLOCK。Record壓縮率低,一般建議使用BLOCK壓縮;

ORC支持三種壓縮選擇:NONE,ZLIB,SNAPPY。我們以TEXT存儲方式和ORC存儲方式為例,查看錶的壓縮情況。

配置同樣數據同樣欄位的四張表,一張TEXT存儲方式,另外三張分別是默認壓縮方式的ORC存儲、SNAPPY壓縮方式的ORC存儲和NONE壓縮方式的ORC存儲,查看在hdfs上的存儲情況:

TEXT存儲方式

默認壓縮ORC存儲方式

SNAPPY壓縮的ORC存儲方式

NONE壓縮的ORC存儲方式

總結 :可以看到ORC存儲方式將數據存放為兩個block,默認壓縮大小加起來134.69M,SNAPPY壓縮大小加起來196.67M,NONE壓縮大小加起來247.55M,TEXT存儲方式的文件大小為366.58M,且默認block兩種存儲方式分別為256M和128M,ORC默認的壓縮方式比SNAPPY壓縮得到的文件還小,原因是ORZ默認的ZLIB壓縮方式採用的是deflate壓縮演算法,比Snappy壓縮演算法得到的壓縮比高,壓縮的文件更小。 ORC不同壓縮方式之間的執行速度,經過多次測試發現三種壓縮方式的執行速度差不多,所以建議採用ORC默認的存儲方式進行存儲數據。

2.4 分桶分區

Num Buckets表示桶的數量,我們可以通過分桶和分區操作對Hive表進行優化:

對於一張較大的表,可以將它設計成分區表,如果不設置成分區表,數據是全盤掃描的,設置成分區表後,查詢時只在指定的分區中進行數據掃描,提升查詢效率。要注意盡量避免多級分區,一般二級分區足夠使用。常見的分區欄位:

(1)日期或者時間,比如year、month、day或者hour,當表中存在時間或者日期欄位時,可以使用些欄位。

(2)地理位置,比如國家、省份、城市等

(3)業務邏輯,比如部門、銷售區域、客戶等等

與分區表類似,分桶表的組織方式是將HDFS上的一張大表文件分割成多個文件。分桶是相對分區進行更細粒度的劃分,分桶將整個數據內容按照分桶欄位屬性值得hash值進行區分,分桶可以加快數據采樣,也可以提升join的性能(join的欄位是分桶欄位),因為分桶可以確保某個key對應的數據在一個特定的桶內(文件),所以巧妙地選擇分桶欄位可以大幅度提升join的性能。通常情況下,分桶欄位可以選擇經常用在過濾操作或者join操作的欄位。

創建分桶表

create

table test_user_bucket(id int, name string,code string,code_id string )

clustered by(id) into 3 buckets ROW FORMAT DELIMITED FIELDS TERMINATED 

BY ',';

查看描述信息

DESCRIBE FORMATTED test_user_bucket

多出了如下信息

查看該表的hdfs

同樣的數據查看普通表和分桶表查詢效率

普通表

分桶表

普通表是全表掃描,分桶表在按照分桶欄位的hash值分桶後,根據join欄位或者where過濾欄位在特定的桶中進行掃描,效率提升。

本文首發於: 數棧研習社

數棧是雲原生—站式數據中台PaaS,我們在github上有一個有趣的開源項目: FlinkX

FlinkX是一個基於Flink的批流統一的數據同步工具,既可以採集靜態的數據,比如MySQL,HDFS等,也可以採集實時變化的數據,比如MySQL

binlog,Kafka等,是全域、異構、批流一體的數據同步引擎,大家如果有興趣,歡迎來github社區找我們玩~

C. 壓縮包在root用戶下解壓過了,怎麼才能把它刪除然後在hadoop用戶下再解壓

如果需要刪除在root用戶下解壓的壓縮包,再在hadoop用戶下解壓,可以按照以下步驟進行:

1. 以root身份登錄系統,找到需要刪除的壓縮包所在目錄,刪除該文件,可以使用命令:sudo rm -f 壓縮包名稱。

2. 切換至hadoop用戶,並切換至需要解壓的目錄。

3. 用hadoop用戶許可權再次下載需要解壓的壓縮包,可以使用cp或wget等命令。

4. 解壓該文件,可以使用unzip或tar等命令進行解壓操作。

需要注意的是,對於需要維護的高級操作,應該充分理解相關命令的用法,避免誤操作誤操作造成不必要的麻煩。

D. 如何在Scala中讀取Hadoop集群上的gz壓縮文件

(1)一個從文件創建的Scala對象,或(2)一個並行切片(分布在各個節點之間),或(3)從其他RDD轉換得來,或(4)改變已有RDD的持久性,如請求將已有RDD緩存在內存中。Spark應用稱為driver,實現單個節點或一組節點上的操作。

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