seq命令

『壹』 AIX下無法使用seq這個命令

seq是個外部命令,如果你的aix沒有預安裝的話是無法找到的,如果你需要用此命令,則需要安裝進去放可使用..

『貳』 高手請進：word 2003編制論文，章節下還有多級編號，其中的一級編號如何實現自動重新開始編號

您這個用個最最簡單的SEQ域命令,不建議用自動編號,總容易錯,特別還有個位置的問題

只要捎耐心學下,以後所以編號問題都迎刃而解

在123的位置不要寫數字

在1的位置

插入-域-類別選"編號"下面選SEQ,確定就可以,

格式如下:{seq隨便起名字},同一名字的序列自己排隊

23....之後就是復制這個域粘貼即可

以後就是修改了也自動更新,

但前提是需要一定復制這個域!

更新F9

----

復雜的章節段的SEQ命令如下:

這個比較復雜~一般"項目符號和編號"對大不頭的論文編輯用處不大,因為為您不是連續輸入,而是,標題間會有很多大段的內容,而且級別很多~

比較實用的是SEQ域命令編排如圖

一1A(1)任何形式都可以選的,

要點:

1.啟用SEQ域:插入-域-編目,或者快捷鍵CTRL+F9

2.SEQ後面要空格加上名稱,如SEQa,a就是名字,統一名字的SEQ排序!,名字可以隨便命名,主要便於識別不同序列

3.SEQa只是從1開始,等差為1自動排序,結果就是123456,如果想顯示其他數字，如5.10.15,那麼只能使用數學公式計算,如{=5*{SEQA}}

4.大括弧不是鍵盤上的手工輸入

5.域需要更新,不更新不會顯示新數字,F9為更新,切換數字和域命令是ALT=F9

6.2個快關C與上一個最近的序列號,如前面排到了4,那麼加一個C,顯示的還是4,0是最近的差額:)

,是在已經有的序列中重新按r給的數字排序,如 5,那麼後面就從5之後6開始

注意一定是而不是/

7.命令之外的還是照常排序,如命名為a的序列排序-

{seqa}--1

{seqa}2

{seqa}3

{seqac}還是3,

{seqa}這個就是4了,把帶c的排除,上面是3,所以接下來就是4

{seqa 7}7,因為給了R命令從7開始

{seqa}這個顯示8,雖然還是{seqa},但因為之前重新給了序列7,所以從7開始

8.這個命令只針對數字,如第一章,兩邊漢字要自己輸入,1.1,中間的點也要自己輸入1-1,都是如此

寫論文插入章節,就復制就可以,最後F9刷新,不用自己修改的~

『叄』 linux 怎麼用seq把第一行和第二行換位置

linux下文檔替換操作命令是 sed
可以把文件的第二行輸出到新文件，然後刪除原文件的第二行，再輸出到新文件

如：
源文件 abc.txt
第二行輸出到1.txt
sed -n '2p' abc.txt > 1.txt
刪除第二行，追加到1.txt
sed -e '2d' abc.txt >> 1.txt

『肆』 oracle的自增seq.nextval能否+1 一插數據序號就+2了，怎麼才能+1

定義序列的時候，increment參數為1，那麼新調用一次就是+1的，具體定義+1序列的命令如下
CREATE SEQUENCE SEQ INCREMENT BY 1 START WITH 1 MAXVALUE 9999 NOCACHE;

『伍』 解釋seq(1,10,2)這串代碼的輸出結果，並解釋其含義

{x..y[..i]} 這種形式是bash內部的一種表達式，會生成一個空格分隔的數字序列字元串
$(cmd) 或 `cmd` 是bash的另一種表達式，表示把cmd的輸出作為一個字元串
因此可見， 使用$(seq x y)的方式系統會啟動一個新的進程運行cmd命令，相對於{x..y}的方式，速度上會有劣勢，同時內存佔用也會更多，此外還依賴/bin/seq命令的存在。

『陸』 #!/user/bin/perl -w use Bio::Seq; No command 'use' found 我初學perl，這個use命令找不到怎麼搞

這個use是perl里的關鍵字，不是系統命令。perl是一種解釋性語言，要使用這個語言，你的系統里必須安裝perl軟體包。
因為你只寫了標題，代碼在同一行，不知你實際情況如何。假設你的程序是有換行的，根據你寫的問題，可能你是在linux系統下運行，因為linux預設是有安裝perl的，那問題很可能是因為開頭的第一行，#/usr/bin/perl，而不是#/user/bin/perl。

『柒』 blast+命令求助

Blast的運行方式是先用目標序列建資料庫（這種資料庫稱為database，裡面的每一條序列稱為subject），然後用待查序列（query）在database中搜索，每一條query與database中的每一條subject都要進行雙序列比對，從而得出全部比對結果。

Blast是一個繼承的程序包，通過調用不同的比對模塊，blast實現了物種可能的序列比對方式：

blastp：蛋白序列與蛋白庫做比對。

blastx：核酸序列對蛋白庫的比對，先將核酸序列翻譯成蛋白序列（根據相位可以翻譯成6種可能的蛋白序列），然後再與蛋白庫作比對。

blastn：核酸序列對核算庫的比對。

tblastn：蛋白序列對核算庫的比對，將庫中的核酸序列翻譯成蛋白序列，然後進行比對。

tblastx：核酸序列對核算庫在蛋白級別的比對，將庫和待查序列都翻譯成蛋白序列，然後對蛋白序列進行比對。

Blast提供了核酸和蛋白序列之間所有可能的比對方式，同時具有較快的比對速度和較高的比對精度，因此在常規雙序列比對分析中應用最為廣泛，可以毫不誇張的說，blast是做比對基因組學乃至整個生物信息學研究所必須掌握的一種比對工具。

使用：

blast的運行分為兩個步驟：第一，建立目標序列的資料庫；第二，做blast比對。

1、運行建庫程序formatdb:

建庫的工程是建立目標序列的索引文件，所以程序是formatdb。程序允許的輸入格式是FASTA或者ASN.1格式，通常我們使用的FASTA格式的序列作為輸入。用於建庫的FAST序列是db.seq, formatdb的基本命令是：

formatdb –i db.seq [-options]

常用參數：

-p (T/F): -p參數的意義是選擇建庫的類型，「T」表示蛋白庫，「F」表示核算庫，預設值為「T」

-o(T/F): -o參數的意義是判斷是否分析序列名並建立序列名索引。「T」表示建立序列名索引，「F」表示不建立序列索引。預設值為「F」。

程序輸出：

如果建立的是核算庫，輸出為db.seq.nhr、db.seq.nin、db.seq.nsq，三個文件，如果選擇了「-o T」，還會同時輸出db.seq.nsd、db.seq.nsi、db.seq.nni、db.seq.nnd四個文件，一共七個。

蛋白庫和核算庫的輸出類似，相應的輸出文件為：db.seq.nhr、db.seq.nin、db.seq.nsq和db.seq.nsd、db.seq.nsi、db.seq.nni、db.seq.nnd七個文件。

除了這個結果，程序還會輸出LOG文件（默認為formatdb.log），裡面記錄了運行時間、版本號、序列數量等信息。

幾點需要注意的問題：

1）、建庫以後，做blast比對的輸入文件就是建庫所得的文件db.seq.n**或者db.seq.p**，而不是原始的FASTA序列，也就是說，建庫以後，原始序列文件是可以刪除的。

2）、如果命令行中選擇了「-o T」，並且目標序列中好友gi號重復的序列名時，程序會停止建庫並報錯。

就是說庫文件中不能出現重復的序列（標志是序列號，跟具體的序列沒有關系）。

3）、如果輸入序列不符合FASTA格式或者ASN.1格式，程序會自動退出，並報錯。

[formatdb] ERROR: Could not open db.

4）、核酸序列可以用於建核算庫和蛋白庫，但是蛋白序列不能用於建核算庫，這個是顯然的，密碼子的問題哦！

其他參數介紹：

-l : 「-l 文件名」用來改變LOG文件的命名

-n : 「-n 文件名」可以自定義生成的庫文件命名

-a : 輸入文件為ASN.1格式

2、運行比對程序blastall:

Blast的主程序是blastall。程序的輸入文件是query序列（- i參數）而和庫文件（-d 參數），比對類型的選擇（- p參數）和輸出文件（- o 參數）由用戶指定。其中「-p」參數有5中取值：

-p blastp：蛋白序列與蛋白庫做比對。

-p blastx：核酸序列對蛋白庫的比對。

-p blastn：核酸序列對核酸庫的比對。

-p tblastn：蛋白序列對核酸庫的比對。

-p tblastx：核酸序列對核酸庫在蛋白級別的比對。

這些元素就構成了 blast 的基本運行命令（以 blastn 為例）：

blastall -i query.fa -d database -o blast.out -p blastn

其中如果"-o"參數預設，則結果輸出方式為屏幕輸出。

參數：

僅僅運行blast的基本運行命令，得到的結果往往不能清晰准確的表示出有用的信息。最大的問題就是有太多的冗餘，很多很短的比對都會出現在輸出結果中，導致結果雜亂無章。為了處理雜亂無章的比對結果，滿足各種比對需求，blast設置了很多參數來限制比對的范圍和輸出的形式。一下多數結果以blastn距離，如不做特殊說明，這些參數適合於所有比對方式。

-e 參數

-e（value）參數是用來過濾比對較差的結果的，用「-e」參數指定一個實數，blast會過濾掉期望值大於這個數的比對結果（就是說這個值越小比對結果就越好）。

blastall -i query.fa -d database -o blast.out -p blastn -e 1e-10

通常情況下，對於不同物種之間的比對，期望值設在1e-5左右即可；而對於同源性較高的物種或者同種的比對，可以適度將期望值調的更小來過濾垃圾結果。比對同一物種cDNA和染色體的比對，參數可用1e-10或更高。

-F 參數

-F（T/F）參數是用來屏蔽簡單重復和低復雜度序列的。如果選「T」，程序在比對過程中會屏蔽掉query中的簡單重復和低復雜度序列；選「F」則不會屏蔽。預設值為「T」。

比較兩個結果，我們看出使用預設參數的比對結果損失了一部分信息，得到的統計結果也

出現失真，期望值和 identity 都沒有反映出真實情況。有時較長的重復序列甚至會導致比對終止。加了"-F F"就保證了比對結果的完整性。通常在大規模、低精度的比對中，往往用預設參數，這樣能避免程序把過多的時間浪費在無意義的簡單重復上，提高運行速度；而在小規模、高精度的比對中，需要加上參數"-F F"，保證比對的精確度和完整性。

-m 參數：

「-e」參數能夠做到篩選適當的比對結果，但是即使如此，blast的輸出結果仍然非常龐大並且難以處理。為了精簡輸出、節省存儲空間、實現更多功能並使結果易於處理，blast 提供了參數「-m (integer)」來設定輸出格式，可供選擇的值為 0～11 之間的整數，預設為 0。下面就通過實例逐個解析「-m」參數能夠實現的輸出功能。

-m 8 : 列表格式的比對結果。從做導游割裂的意義一次是：query名/subject名/identify/比對長度/錯配數/空位數/query比對起始坐標/query比對終止坐標/subject比對起始坐標/subject比對終止坐標/期望值/比對得分

在 m8 格式中通過 subject 的比對起止位置可以判斷出序列的比對方向。判斷方法就是：query和subject的起始和終止坐標是否一致增減。

『捌』 英語seq翻譯成漢語

sequence
英 ['siːkw(ə)ns]
美 ['sikwəns]

n. [數][計] 序列；順序；續發事件
vt. 按順序排好

『玖』 linux seq命令幫助怎麼查看

man seq

或者：

seq --help

『拾』 oracle nextval 語法

oracle?
createtablebenchmarksql.history(
hist_idintegernotnulldefaulthist_id_seq.nextval()primarykey,
h_c_idnumber,
h_c_d_idinteger,
h_c_w_idinteger,
h_d_idinteger,
h_w_idinteger,
h_datetimestamp,
h_amountdecimal(6,2),
h_datavarchar(24)
);