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rstudio中rm命令

發布時間:2022-12-27 03:48:20

❶ r語言包,如何修改裡面的東西

可以試下ComplexHeatmap package在這裡面可以修改

支持各種heatmap編輯方式,包括字體,標注,分類,多圖比較,甚至可以交互選取部分樣本進行比較。

YouTube 使用教程:

Plotting in R for Biologists -- Lesson 8: Heatmapswww.youtube.com/watch?v=gu9pTq9U2iU&t=211s

.

打開R語言,輸入命令刪除其他一切數據:rm(list=ls(all=TRUE)),並且輸入命令CTRL和L,刪除不必要的顯示的信息。

2.

加法運算 加法運算的主體可以是數字,也可以是復雜的向量。 例如,輸入2+5,可以馬上得到結果!

3.

加法運算: 同加法運算很相似、如:要得到7-2的結果,直接在控制台中輸入 7-2 回車可以得到結果5

4.

乘法運算 在R語言中,乘號用"*"代替。如計算2乘以4的結果在控制台中輸入 2*4 回車後得到8

❷ 如何在rstudio中清洗對象集合

1、首先,打開RStudio並創建一個新的文件腳本,[File]—[NewScript]。

❸ r語言的下移命令

1.getwd()#查看當前工作目錄

2.setwd('E:graation-design/OC/sctransform')#設置工作路徑,引號內的內容是一個例子,注意路徑最好不要有中文和特殊符號。

3.install.packages.('包')#下載包

4.library(包)#載入包

5.update.packages(包)# 可以更新已經安裝的包。

6.help(package = "包") # 獲取該R包的幫助文件

7.head(object) #查看對象的前6行

8.tail()#查看對象的後6行

9.[,1]#訪問數據的第一列

10.rm(object) #刪除對象

11.save.image("myfile") #保存工作空間到文件myfile中(默認值為.RData)

12.example("foo")#函數foo的使用示例(引號可以省略)

13.class(object) #顯示某個對象的類或類型

14.c()#定義向量

15.print() #展示數據

16.mode() # 查看數據類型

17.na.rm = TRUE# 去除缺失值

18.is.na() #檢查是否有缺失值

19.na.omit() # 刪除包含缺失值的行

20.nchar() #統計字元串長度

21.substr(x = ,start = 1, stop = 3) # 提取字元串(首字母大寫)

22.toupper()#將字元串都轉化成大寫

23.tolower() #將字元串都轉化成小寫

24.gsub("^(\\w)","\\U\\1",tolower(temp),perl = T) #首字母大寫

25.gsub("^(\\w)","\\L\\1",upper(temp),perl = T) #首字母小寫

26.Sys.Date() # 顯示目前系統的時間

27.read.table("c:/路徑",seq = "") # 讀取excel

28.read.table(網址) #讀取網站內容

29.read.table("clipboard")#讀取剪切板中的文件

30.read.table(gzfile("文件")) #讀取壓縮文件

31.write(x,file = "x,txt") #輸出文本

32.write.table(x,gzfile("文件名"))# 輸出壓縮文件

❹ 如何解決RStudio Server: R is taking longer to start than usual

Rstudio server 在運行的時候自己斷掉了,重新登錄提示:
RStudio Server: R is taking longer to start than usual

搜索之後仍然沒有解決
RStudio Server: R is taking longer to start than usual
rstudio - Hosted R Studio hangs when trying to open - Stack Overflow

最後再nicker老師的幫助下成功解決:

(2條消息) rstudio-server dead伺服器上一個用戶的rstudio打不開 刪不掉殺不死進程_鄧飛----育種數據分析之放飛自我-CSDN博客 https://blog.csdn.net/yijiaobani/article/details/87858472

r - Fresh new session for rstudio-server - Stack Overflow https://stackoverflow.com/questions/15351405/fresh-new-session-for-rstudio-server

總結:刪除session- 文件 + kill r
1、 rm -rf ~/.rstudio/sessions/active/session-
2、ps -u userid 查看自己賬戶下的運行程序,再去kill 掉rsession
問題就解決了
大神一句話,菜鳥十年功!哈哈

</article>

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R

linux伺服器安裝R語言及Rstudio server

在linux伺服器上使用R語言及Rstudio server
cat /etc/redhat-release: 查看伺服器系統版本

wget https://mirrors.tuna.tsinghua.e.cn/CRAN/src/base/R-3/R-3.6.1.tar.gz

checking for rl_callback_read_char in -lreadline... no
configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available

configure: WARNING: you cannot build info or HTML versions of the R manuals
configure: WARNING: you cannot build PDF versions of the R manuals
configure: WARNING: you cannot build PDF versions of vignettes and help pages

6.安裝
make
make install
安裝成功!

R #在命令行直接輸入「R」即可進入R 編輯。
q() ##退出R編輯
7.安裝R-studio-server
wget https://download2.rstudio.org/server/centos6/x86_64/rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpm

yum install rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpm
8.R-studio-server的一些命令
rstudio-server start ##啟動 rstudio
rstudio-server stop ## 關閉rstudio
rstudio-server status ## 查看rstudio 運行狀態
運行rstudio-server status出現 「Active: active (running) 」 表示rstudio 已啟動
rstudio-server verify-installation ## 查看rstudio 安裝錯誤
rstudio-server restart ##重啟

ifconfig ##查看伺服器ip地址。
查看運行中R進程
rstudio-server active-sessions
指定PID,停止運行中的R進程
rstudio-server suspend-session <pid>
停止所有運行中的R進程
rstudio-server suspend-all
強制停止運行中的R進程,優先順序最高,立刻執行
rstudio-server force-suspend-session <pid>
rstudio-server force-suspend-all
RStudio Server臨時下線,不允許web訪問,並給用戶友好提示
rstudio-server offline
RStudio Server臨時上線
rstudio-server online

8.rstudio-server系統設置
主要有兩個配置文件,默認文件不存在(非必要,可不做修改)
/etc/rstudio/rserver.conf
/etc/rstudio/rsession.conf

vi /etc/rstudio/rserver.conf
www-port=8080#監聽埠,默認是8787,可以不做修改
www-address=127.0.0.0#允許訪問的IP地址,默認0.0.0.0

rstudio-server restart

vi /etc/rstudio/rsession.conf
session-timeout-minutes=30#會話超時時間
r-cran-repos= http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN #CRAN資源庫
rsession-which-r=/usr/local/bin/R ## 如果非root安裝,更改R所在目錄。
9.通過瀏覽器連接Rstudio-server
直接打開瀏覽器,輸入http://<伺服器ip>:8787 ## 如果修改過rserver.conf文件,後面的8787埠改為相應的埠即可。

這里需要我們輸入用戶名和密碼。關於用戶名有2點注意事項:
(1).不允許使用system 用戶登陸,即用戶ids小於100的用戶。只能用普通用戶登錄
(2).用戶的認證可以使用RSA。
如果沒有普通用戶,可以添加:

useradd newname # 添加一個名為newname的用戶
passwd newname ###給新用戶newname 設置密碼,密碼需是復雜密碼,否則可能通不過。
usermod -G happy newname ####將新用戶newname添加到happy 用戶組中,
在用useradd添加用戶之後,在默認的情況下,該賬號是暫時被封鎖的, 也就是說,該賬號是無法登錄,須要用passwd命令來給新創建的用戶設置密碼之後才可以使用。

10可能存在的問題
10.1如果你的rstudio-server沒有啟動 很大程度是安裝有誤,這里我將我遇到的錯誤分享出來
rstudio-server verify-installation

There is a libR.so in /usr/lib/R/lib, but (weirdly) ls -l reveals that
it dates from the my previous install of R-3.5.1 for which I did not
configure with --enable-R-shlib.
這里就提到無法找到libR.so文件,原因是配置R語言文件時,沒有加參數--enable-R-shlib.
這就必須要重新安裝R語言。使用make uninstall 刪除之前的安裝,最好也刪除R-3.6.1所在的文件夾,用「rm -r -f R-3.6.1".

使用rm 命令 -r 參數表示全部刪除, -f 參數表示強制刪除,不會提醒。 同時使用這兩個參數要小心。
10.2 普通用戶無法啟動rstudio-server
sudo rstudio-server start## 以管理員方式執行命令
這時會需要輸入密碼並提示
xxx is not in the sudoers file.This incident will be reported.
如果不想出現上面的提示,就是給該用戶提高許可權,添加用戶使用sudo的權利。

su root ###切換到root用戶,如果有root許可權的話。
chmod u+w /etc/sudoers ###添加sudo文件的寫許可權
vi /etc/sudoers ###編輯sudoers文件,添加許可權。
找到這行 root ALL=(ALL) ALL,在他下面添加xxx ALL=(ALL) ALL (這里的xxx是你的用戶名)

youuser ALL=(ALL) ALL
%youuser ALL=(ALL) ALL
youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL
%youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL

chmod u-w /etc/sudoers ##撤銷sudoers文件寫許可權

❻ 在r語言中如何刪除某一列數據,急急急,求詳細操作

數據Datatest

Datatest = Datatest[,-1]就刪除第一列

-2就刪除第二列

依次類推

例如:

用iris數據集

data(iris)

datatest <- iris

(6)rstudio中rm命令擴展閱讀:

R具有很強的互動性。除了圖形輸出是在另外的窗口處,它的輸入輸出窗口都是在同一個窗口進行的,輸入語法中如果出現錯誤會馬上在窗口口中得到提示,對以前輸入過的命令有記憶功能,可以隨時再現、編輯修改以滿足用戶的需要。

輸出的圖形可以直接保存為JPG,BMP,PNG等圖片格式,還可以直接保存為PDF文件。另外,和其他編程語言和資料庫之間有很好的介面。

❼ r語言中出現的rm是什麼意思比如na.rm。

rm是remove的意思,例如你指定na.rm=T,就會移除na數據

❽ rstudio怎麼減

1、首先需要打開Rstudio,新建文件腳本,【File】——【New Script】。
2、其次會發現,global environment這里之前代碼留下的代碼數據集非常麻煩,清除方法如下。
3、然後寫入 rm(A),即可清除相應object的數據(rm=remove)。
4、最後對比即可發現,之前的object已經被清除了。

❾ rstudio的tab鍵顯示箭頭

tab鍵用來Rstudio的自動補齊,方向鍵選擇
2、D:\Program Files\R\R-4.1.2\etc這個目錄下的Rprofile.site好像是啟動設置文件

3、內置數據集是粉色
4、數據化是一個表格
5、函數是藍色
6、Ctrl+上箭頭可以查看歷史
7、esc可以中斷當前操作。
8、alt+shift+k顯示所有快捷鍵操作。
9、 list.files()
dir()顯示當前工作目錄下面的文件
10、 <<-的意思是強制賦值給一個全局變數,而不是一個局部變數
11、 y <- sum(1,2,3,4,5)
12、 ls()顯示已經賦值的變數
13、 ls.str()顯示已經賦值的變數的詳細信息
14、 str()顯示變數的詳細信息
15、 ls(all.names = TRUE)顯示所有變數,包括.開頭的
16、 rm()刪除某個對象,
17、 rm{}多個對象
18、 刪除空間中所有對象rm(list=ls())
19、 history(25)顯示25條歷史記錄
20、 ctrl+L清楚屏幕
21、 save.image()保存在當前工作空間下,但是繪圖不會保存
22 、 安裝包install.packages()
23 、 一次載入多個R包,利用一個R的向量來進行
install.packages(c(「ggplot2」 「forgein」))
24、update.packages()用來更新包
25、 .libPaths()庫 的路徑
26、 library()和require()來載入包
2

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