linux基本命令總結

A. linux命令分類總結

禁止在線上伺服器使用

實例：

uniq命令可以去除排序過的文件中的重復行，因此uniq經常和sort合用。也就是說，為了使uniq起作用，所有的重復行必須是相鄰的。

在一個指定的時間執行一個指定任務，只能執行一次，且需要開啟atd進程

crond是linux下用來周期性的執行某種任務或等待處理某些事件的一個守護進程

將任務打入後台
示例：

vmstat是Linux中監控內存的常用工具，可對操作系統的虛擬內存、進程、CPU等的整體情況進行監視.

sar（System Activity Reporter系統活動情況報告）是目前 Linux 上最為全面的系統性能分析工具之一，可以從多方面對系統的活動進行報告，包括：文件的讀寫情況、系統調用的使用情況、磁碟I/O、CPU效率、內存使用狀況、進程活動及IPC有關的活動等

常用：

Ping命令通過發送Internet控制消息協議（ICMP）回響請求消息來驗證與另一台TCP/IP計算機的IP級連接

ss與netstat命令作用相同，但比netstat更高效，採用的是tcp協議棧中tcp_diag.
使用方法參考netstat，且基本參數相同

traceroute追蹤網路數據包的路由途徑

nslookup命令用於查詢DNS的記錄，查看域名解析是否正常，在網路故障的時候用來診斷網路問題

B. Linux文本操作常用命令

在Linux系統里常用於文本查看、操作、統計的命令：

通過多敲鍵盤，形成手感 肌肉記憶 ，熟練掌握這些命令，在以後生信分析中游刃有餘。以下是每個命令的詳細的介紹（主要是跟著 生信技能樹小郭老師 學習做的筆記）

接下來通過示例把10個命令的常用參數和用法展示出來：

參數的用法介紹：

注意事項：

用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 編輯文本 ，編輯文本要加 > 符號，退出時，另起一行，按 control C 退出

zcat可以查看壓縮的文本文件，tac逆向查看

結合 管道符| 使用

head / tail -n :查看文件的前 / 後 n 行，默認 10 行 （在R語言里head和tail默認是前6行）。

less命令用得最多 ，more命令用得比較少

3.1 less命令

less [參數] 文件名

less命令重要的補充用法1 ：

需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q鍵

less命令重要的補充用法2 ：

參數用法：

less命令 不加參數 查看文件：

less命令加 -N參數 查看文件：顯示行號

less命令加 -S參數 查看文件：單行顯示，非常規整

對比：less和cat命令顯示文本行號的用法：less -N，cat -n

3.2 more命令

**more ** 逐頁查看，按空格翻頁，按回車換行 ，more命令一般很少用，熟練掌握less命令就好

查看壓縮文件

wc 統計字元是也把換行符統計進去，但是別的命令不一定會把換行符算進去，。

常見參數:

切記：用less命令，按q退出

cut命令是按關鍵詞來切的

常見參數:

排列前：

排列後：

解釋：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。

命令行查看一個表格結構時，因為製表符對齊的原因，出現一個錯位的現象。還有 字典排序 可能和我們平時的認知不一樣，所以 加上-n參數 ， 讓數值有數學意義上的大小來排序 。

uniq命令去重，只有兩行出現重復，而且是相鄰的兩行，如果不相鄰，即使出現兩行一模一樣，不會去重。

uniq命令通常和sort命令搭配使用

換其它文件試試

總之，uniq命令使用時經常和sort一起

常見參數:

常見用法1：

paste file1 file2

-s :按行合並 演示

常見用法2 : paste - -

常見參數:

要養成一個好習慣，原始數據不要輕易修改，修改的東西另外保存，文本保存用> (重定向)或是 >>(追加)

1. 用 less 查看 example.gtf ，然後管道符傳遞給 wc

2. 截取 example.gtf 第 9 列的內容

3. 在第2步的基礎上截取分號分割的第1列

4. 在第3步的基礎上排序、去重復並統計

5. 在第4步的基礎上，將空格替換成製表符

補充小知識 ：

清屏 ：control L

查看歷史（輸入過的）命令 ：history

C. Linux/超算中PBS常用命令

新手，純純搬運工【出處引用自： https://www.guanjihuan.com 】

1. Linux常用命令

最常用：

ls（英文全拼：list files）：列出目錄及文件名

ls -l：列出目錄及文件名，可查看更多

ls -al：可以看到隱藏文件

cd（英文全拼：change directory）：切換目錄

cd .. ：返回上一級

cd 文件夾名：進入目錄

pwd（英文全拼：print work directory）：顯示目前的目錄

mkdir 文件夾名（英文全拼：make directory）：創建一個新的目錄

rmdir 文件夾名（英文全拼：remove directory）：刪除一個空的目錄

cp xxx xxx（英文全拼： file）: 復制文件或目錄

mv xxx xxx（英文全拼：move file）: 移動文件或目錄，或修改文件或目錄的名稱

rm（英文全拼：remove）: 刪除文件

rm -r 文件夾名：遞歸刪除某目錄

clear：清空terminal的所有內容（或者使用Ctrl+L）

tab按鍵：補充完整文件名或文件夾名

次常用：

vim/vi 某文件 （編輯文件）

nano 某文件 （編輯文件）

touch 文件 （新建空文件）

sudo -s （切換到root模式）

exit （退出root模式等）

sudo chmod -R 755 文件名/文件夾名 （獲取文件/文件夾的755許可權）

chown [用戶] [文件或目錄] （改變文件或目錄的所有者）

chgrp [用戶組] [文件或目錄] （改變文件或目錄的所屬組）

make （編譯成.exe）

解壓/解包：

tar文件 （註：tar是打包，不是壓縮！）

解包：tar xvf FileName.tar

打包：tar cvf FileName.tar DirName

.gz文件

解壓1：gunzip FileName.gz

解壓2：gzip -d FileName.gz

壓縮：gzip FileName

.tar.gz 和 .tgz文件

解壓：tar zxvf FileName.tar.gz

壓縮：tar zcvf FileName.tar.gz DirName

安裝和卸載deb軟體包：

安裝：sudo dpkg -i deb文件

查看：sudo dpkg -l

卸載：sudo dpkg -r 軟體名

參考資料：

[1]  Linux 教程

[2]  Linux常用命令

[3]  linux中tar命令的用法

[4]  全網最全Linux命令總結

2. vim/vi里的操作

:q 退出

:wq 保存並退出

:w 保存

:q! 強行退出（不保存退出）

:w! 強行保存

i 進入編輯，轉為輸入模式（游標前面）

a 進入編輯，轉為輸入模式（游標後面）

o 進入編輯，轉為輸入模式（游標下方新建一行）

Esc 退出i（插入）命令

3. 超算中PBS常用命令

pbsnodes （查看所有節點）

pbsnodes -l free （查看空閑節點）

pbsnodes 某節點 （查看某節點狀態）

ssh 某節點 （轉到某節點）

exit （離開節點）

qsub 文件名.pbs/sh （提交任務）

qstat （列出狀態）

qstat -q （列出隊列）

qstat -n （列出隊列中使用的節點）

qstat -f jobid （查看jobid任務的詳細信息）

qdel jobid （取消任務）

4. 其他

（1）Linux開機自啟

sh文件中包含：

#!/bin/bash#chkconfig: 2345 80 90#description:auto_run

sh文件移動到/etc/init.d後，分別輸入命令：

chkconfig --add xxx.sh

chkconfig --list   

chkconfig xxx.sh on 

service xxx.sh start

參考資料： linux 開機啟動 .sh 文件 - 自己的太陽 - 博客園

（2）Linux環境變數

方法1：臨時使用環境變數：export PATH="/home/www/anaconda3/bin:$PATH"

方法2：修改.bashrc文件

參考資料： Linux PATH 作用以及查看和修改方法_haozhepeng的專欄

（3）兩個sh文件

a.sh文件（用於提交任務，執行a.py文件）

#!/bin/sh#PBS -N task#PBS -l nodes=1:ppn=1#PBS -q scorecd $PBS_O_WORKDIRexport OMP_NUM_THREADS=1python a.py

a.sh文件（用於提交任務，執行a.exe文件）

#!/bin/sh#PBS -N task#PBS -l nodes=1:ppn=1#PBS -q scorecd $PBS_O_WORKDIRexport OMP_NUM_THREADS=1./a.exe

（4）一個makefile文件

makefile文件（用於編譯Fortran文件）

INC := -I/public/software/compiler/intel/composer_xe_2015.2.164/mkl/include/intel64/lp64

LIB := -L/public/software/compiler/intel/composer_xe_2015.2.164/mkl/lib/intel64

mpi:= -I/public/software/mpi/mpich/3.1.4/intel/include /public/software/mpi/mpich/3.1.4/intel/lib -lmpich -limf -lsvml -lintlc

src:=Console1exec:=a

all: $(src).f90

ifort  $(src).f90  $(INC) $(LIB) -openmp -lmkl_intel_lp64 -Wl,--start-group -lmkl_intel_thread -lmkl_lapack95_lp64 -lmkl_core -lmkl_blas95_lp64  -Wl,--end-group -liomp5 -lpthread -O2 -o $(exec).exe

D. Linux第二章-Linux常用命令

當我們關機或者重啟時，都應該先執行以下 sync 指令，把內存的數據寫入磁碟，防止數據丟失。

命令： cd [相對路徑或絕對路徑]

命令： ls [-al]

命令： mkdir [-p] 目錄
-p 父目錄不存在情況下先生成父目錄

命令： rm [-rf] 目錄
-r 遞歸 -f 強制
兩個一起用你可以刪掉世界（很暴力很血腥，危險的命令）

命令： echo [選項] [輸出內容]

命令： head 文件

tail ：指定行數或者動態查看

命令： touch 文件名

命令： rm -rf 文件名

vi是linux中最經典的文本編輯器，vi一共有3種工作模式，分別是正常模式，編輯模式(插入模式)，命令行模式：
- 命令： vi 文件名 或 vim 文件名 都可進入vi編譯器進行文件的編譯

---首先輸入 vi 文件名 進入的是正常模式
---正常模式-->編輯模式：按 i o a 任意一個鍵
---正常模式-->命令行模式：按 :
---編輯模式-->命令行模式：按 Esc

vi編譯器快捷鍵的使用
1.拷貝當前行 yy,拷貝當前行向下的5行 5yy,並粘貼 p;
2.刪除當前行 dd,刪除當前行向下的5行 5dd;
3.在文件中查找某個單詞（命令行模式下）/關鍵字 ，回車進行查找，輸入 n 查找下一個
4.設置文件的行號，取消文件的行號（命令行模式下） :set nu 和 :set nonu
5.編輯 /etc/profile 文件，使用快捷鍵到底文檔的最末行[G]和最首行[gg],注意這些都是在正常模 式下執行的。
6.在一個文件中輸入 "hello" ,然後又撤銷這個動作，再正常模式下輸入 u

文件的查看命令： cat more less tail

cat ：由第一行開始顯示文件內容

more ：百分比顯示

less ：翻頁查看

tail ：指定行數或者動態查看

命令： chmod -R 許可權設置 需要更改許可權的文件夾名

grep ：查找字元串

grep命令通常要和管道命令進行連用：

Linux壓縮包的兩種後綴格式：
- xxx.tar 打包，大小不會進行壓縮
- xxx.tar.gz 打包並壓縮文件大小

命令： tar

命令： -h /目錄

命令： ifconfig

命令： netstat [-anp]

命令： ping ip地址

命令： ps [-ef]

命令： kill -9 PID號

命令： service 服務名 [start | stop | restart | reload | status]
在 CentOS7.0 後 不再使用 service ,而是下面這個命令
service [start | stop | restart | reload | status] 服務名

命令： top [選項]

命令： rpm -e rpm包的名稱

命令： rpm -ivh rpm包全路徑名稱

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E. linux常用的20個命令

Linux中最常用的20個命令如下:

1. ls - 列出目錄內容
2. cd - 改變目錄
3. pwd - 顯示當前目錄
4. mkdir - 創建目錄
5. rm - 刪除文件或目錄
6. rmdir - 刪除空目錄
7. touch - 創建空文件
8. cat - 顯示或連接文件
9. cp - 復制文件或目錄
10. mv - 移動或重命名文件或目錄
11. less - 分頁顯示文件內容
12. head/tail - 顯示文件頭部/尾部內容
13. echo - 顯示字元串
14. ps - 顯示進程狀態
15. top - 實時顯示進程狀態
16. kill - 終止進程
17. df - 顯示磁碟空間使用情況
18. - 顯示目錄和文件大小
19. ping - 測試網譽培絡連接
20. ifconfig/ip - 配置或顯示網路介面信息

這20個命令可以完成大多數Linux文件操作、進程管理和網路配置任務。熟練掌握它們是成為Linux高手的基礎。

如果要進一步了解每個命令的功能和參數,可以通過以下方式學習:

1. 在終端直接輸入命令名並按派虛褲回車,會顯示命令語法和簡要說明。

2. 在終端輸入man 命令名,會顯示對應命令的手冊頁,裡麵包含詳細說明、參數和示例。

3. 搜索網路教程和手冊,如菜鳥教程、Linux命令大全等,這些網站上有每個命令的詳盡教程。

4. 實踐並多使用這些命令,熟練掌握語法塵簡和常用功能的參數。實踐出真知。

如果您對Linux命令或其它知識有任何疑問,歡迎與我聯系。我會提供詳細的解答、參考資料和練習方案,幫助您系統和深入地學習。覺得這份Linux常用命令liste對您有用的話,也請不吝賜教,我會持續完善和優化。

F. linux常用的20個命令

linux常用命令如下：

1、查看內核版本：uname-a。

2、控制台-》圖形界面：init5或者startx。

3、圖形界面-》控制台:init3或者直接注銷。

4、如何查看ip地址：ifconfig。

5、配置ip:ifconfigeth0ip地址。

6、重啟：reboot或者shutdown-rnow。

7、普通用戶切換到系統用戶:su。

8、注銷用戶指令：logout。

Linux，全稱GNU/Linux，是一種免費使用和自由傳播的類UNIX操作系統，其內核由林納斯·本納第克特·托瓦茲於1991年10月5日首次發布顫鄭寬，它主要受到Minix和Unix思想的啟發，是一個基於POSIX的多用戶、多任務、支持多線程和多CPU的操作系統。

linux的學習技巧：

如果你想系統的學習Linux，你必需清楚的茄亮認識到這一點。如果你真正想系統的學習linux，想用Linux有叢裂所作為，那麼請忘記Windows的思維方式，思想性的轉變比暫時性的技術提高更有用。

而思想上的改變往往是受到我們行動所影響的，有不懂的問題就自己思考，查資料，實在不會再去找別人的電腦去查，這樣就加深了我每次對問題的理解，慢慢感受和習慣Linux的操作方式。

G. linux常用命令

linux常用命令及用法包括登陸、重啟、關機、添加／刪除用戶、切換用戶等。

一、登陸

1、＃和＄

＃表示為root用戶，＄表示普通用戶。

2、／和～

其中／和～的區別在於，／表示頂級目錄，～表示根目錄；普通用戶的家目錄在／home/下老腔，root用戶的家目錄在／root/。