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sparkkmeanspython

發布時間:2022-08-07 04:41:43

① kmeans演算法python怎麼實現

1、從Kmeans說起
Kmeans是一個非常基礎的聚類演算法,使用了迭代的思想,關於其原理這里不說了。下面說一下如何在matlab中使用kmeans演算法。
創建7個二維的數據點:

復制代碼代碼如下:
x=[randn(3,2)*.4;randn(4,2)*.5+ones(4,1)*[4 4]];

使用kmeans函數:

復制代碼代碼如下:
class = kmeans(x, 2);

x是數據點,x的每一行代表一個數據;2指定要有2個中心點,也就是聚類結果要有2個簇。 class將是一個具有70個元素的列向量,這些元素依次對應70個數據點,元素值代表著其對應的數據點所處的分類號。某次運行後,class的值是:

復制代碼代碼如下:

2
2
2
1
1
1
1

這說明x的前三個數據點屬於簇2,而後四個數據點屬於簇1。 kmeans函數也可以像下面這樣使用:

復制代碼代碼如下:

>> [class, C, sumd, D] = kmeans(x, 2)

class =
2
2
2
1
1
1
1
C =
4.0629 4.0845
-0.1341 0.1201
sumd =
1.2017
0.2939
D =
34.3727 0.0184
29.5644 0.1858
36.3511 0.0898
0.1247 37.4801
0.7537 24.0659
0.1979 36.7666
0.1256 36.2149

class依舊代表著每個數據點的分類;C包含最終的中心點,一行代表一個中心點;sumd代表著每個中心點與所屬簇內各個數據點的距離之和;D的每一行也對應一個數據點,行中的數值依次是該數據點與各個中心點之間的距離,Kmeans默認使用的距離是歐幾里得距離(參考資料[3])的平方值。kmeans函數使用的距離,也可以是曼哈頓距離(L1-距離),以及其他類型的距離,可以通過添加參數指定。
kmeans有幾個缺點(這在很多資料上都有說明):
1、最終簇的類別數目(即中心點或者說種子點的數目)k並不一定能事先知道,所以如何選一個合適的k的值是一個問題。
2、最開始的種子點的選擇的好壞會影響到聚類結果。
3、對雜訊和離群點敏感。
4、等等。
2、kmeans++演算法的基本思路
kmeans++演算法的主要工作體現在種子點的選擇上,基本原則是使得各個種子點之間的距離盡可能的大,但是又得排除雜訊的影響。 以下為基本思路:
1、從輸入的數據點集合(要求有k個聚類)中隨機選擇一個點作為第一個聚類中心
2、對於數據集中的每一個點x,計算它與最近聚類中心(指已選擇的聚類中心)的距離D(x)
3、選擇一個新的數據點作為新的聚類中心,選擇的原則是:D(x)較大的點,被選取作為聚類中心的概率較大
4、重復2和3直到k個聚類中心被選出來
5、利用這k個初始的聚類中心來運行標準的k-means演算法
假定數據點集合X有n個數據點,依次用X(1)、X(2)、……、X(n)表示,那麼,在第2步中依次計算每個數據點與最近的種子點(聚類中心)的距離,依次得到D(1)、D(2)、……、D(n)構成的集合D。在D中,為了避免雜訊,不能直接選取值最大的元素,應該選擇值較大的元素,然後將其對應的數據點作為種子點。
如何選擇值較大的元素呢,下面是一種思路(暫未找到最初的來源,在資料[2]等地方均有提及,筆者換了一種讓自己更好理解的說法): 把集合D中的每個元素D(x)想像為一根線L(x),線的長度就是元素的值。將這些線依次按照L(1)、L(2)、……、L(n)的順序連接起來,組成長線L。L(1)、L(2)、……、L(n)稱為L的子線。根據概率的相關知識,如果我們在L上隨機選擇一個點,那麼這個點所在的子線很有可能是比較長的子線,而這個子線對應的數據點就可以作為種子點。下文中kmeans++的兩種實現均是這個原理。
3、python版本的kmeans++
在http://rosettacode.org/wiki/K-means%2B%2B_clustering 中能找到多種編程語言版本的Kmeans++實現。下面的內容是基於python的實現(中文注釋是筆者添加的):

復制代碼代碼如下:

from math import pi, sin, cos
from collections import namedtuple
from random import random, choice
from import

try:
import psyco
psyco.full()
except ImportError:
pass
FLOAT_MAX = 1e100
class Point:
__slots__ = ["x", "y", "group"]
def __init__(self, x=0.0, y=0.0, group=0):
self.x, self.y, self.group = x, y, group
def generate_points(npoints, radius):
points = [Point() for _ in xrange(npoints)]
# note: this is not a uniform 2-d distribution
for p in points:
r = random() * radius
ang = random() * 2 * pi
p.x = r * cos(ang)
p.y = r * sin(ang)
return points
def nearest_cluster_center(point, cluster_centers):
"""Distance and index of the closest cluster center"""
def sqr_distance_2D(a, b):
return (a.x - b.x) ** 2 + (a.y - b.y) ** 2
min_index = point.group
min_dist = FLOAT_MAX
for i, cc in enumerate(cluster_centers):
d = sqr_distance_2D(cc, point)
if min_dist > d:
min_dist = d
min_index = i
return (min_index, min_dist)
'''
points是數據點,nclusters是給定的簇類數目
cluster_centers包含初始化的nclusters個中心點,開始都是對象->(0,0,0)
'''
def kpp(points, cluster_centers):
cluster_centers[0] = (choice(points)) #隨機選取第一個中心點
d = [0.0 for _ in xrange(len(points))] #列表,長度為len(points),保存每個點離最近的中心點的距離
for i in xrange(1, len(cluster_centers)): # i=1...len(c_c)-1
sum = 0
for j, p in enumerate(points):
d[j] = nearest_cluster_center(p, cluster_centers[:i])[1] #第j個數據點p與各個中心點距離的最小值
sum += d[j]
sum *= random()
for j, di in enumerate(d):
sum -= di
if sum > 0:
continue
cluster_centers[i] = (points[j])
break
for p in points:
p.group = nearest_cluster_center(p, cluster_centers)[0]
'''
points是數據點,nclusters是給定的簇類數目
'''
def lloyd(points, nclusters):
cluster_centers = [Point() for _ in xrange(nclusters)] #根據指定的中心點個數,初始化中心點,均為(0,0,0)
# call k++ init
kpp(points, cluster_centers) #選擇初始種子點
# 下面是kmeans
lenpts10 = len(points) >> 10
changed = 0
while True:
# group element for centroids are used as counters
for cc in cluster_centers:
cc.x = 0
cc.y = 0
cc.group = 0
for p in points:
cluster_centers[p.group].group += 1 #與該種子點在同一簇的數據點的個數
cluster_centers[p.group].x += p.x
cluster_centers[p.group].y += p.y
for cc in cluster_centers: #生成新的中心點
cc.x /= cc.group
cc.y /= cc.group
# find closest centroid of each PointPtr
changed = 0 #記錄所屬簇發生變化的數據點的個數
for p in points:
min_i = nearest_cluster_center(p, cluster_centers)[0]
if min_i != p.group:
changed += 1
p.group = min_i
# stop when 99.9% of points are good
if changed <= lenpts10:
break
for i, cc in enumerate(cluster_centers):
cc.group = i
return cluster_centers
def print_eps(points, cluster_centers, W=400, H=400):
Color = namedtuple("Color", "r g b");
colors = []
for i in xrange(len(cluster_centers)):
colors.append(Color((3 * (i + 1) % 11) / 11.0,
(7 * i % 11) / 11.0,
(9 * i % 11) / 11.0))
max_x = max_y = -FLOAT_MAX
min_x = min_y = FLOAT_MAX
for p in points:
if max_x < p.x: max_x = p.x
if min_x > p.x: min_x = p.x
if max_y < p.y: max_y = p.y
if min_y > p.y: min_y = p.y
scale = min(W / (max_x - min_x),
H / (max_y - min_y))
cx = (max_x + min_x) / 2
cy = (max_y + min_y) / 2
print "%%!PS-Adobe-3.0\n%%%%BoundingBox: -5 -5 %d %d" % (W + 10, H + 10)
print ("/l {rlineto} def /m {rmoveto} def\n" +
"/c { .25 sub exch .25 sub exch .5 0 360 arc fill } def\n" +
"/s { moveto -2 0 m 2 2 l 2 -2 l -2 -2 l closepath " +
" gsave 1 setgray fill grestore gsave 3 setlinewidth" +
" 1 setgray stroke grestore 0 setgray stroke }def")
for i, cc in enumerate(cluster_centers):
print ("%g %g %g setrgbcolor" %
(colors[i].r, colors[i].g, colors[i].b))
for p in points:
if p.group != i:
continue
print ("%.3f %.3f c" % ((p.x - cx) * scale + W / 2,
(p.y - cy) * scale + H / 2))
print ("\n0 setgray %g %g s" % ((cc.x - cx) * scale + W / 2,
(cc.y - cy) * scale + H / 2))
print "\n%%%%EOF"
def main():
npoints = 30000
k = 7 # # clusters
points = generate_points(npoints, 10)
cluster_centers = lloyd(points, k)
print_eps(points, cluster_centers)
main()

上述代碼實現的演算法是針對二維數據的,所以Point對象有三個屬性,分別是在x軸上的值、在y軸上的值、以及所屬的簇的標識。函數lloyd是kmeans++演算法的整體實現,其先是通過kpp函數選取合適的種子點,然後對數據集實行kmeans演算法進行聚類。kpp函數的實現完全符合上述kmeans++的基本思路的2、3、4步。

② python kmeans聚類怎麼確定k的個數

需要選擇一個k值,也就是我們希望把數據分成多少類,這里k值的選擇對結果的影響很大,Ng的課說的選擇方法有兩種一種是elbow method,簡單的說就是根據聚類的結果和k的函數關系判斷k為多少的時候效果最好。
另一種則是根據具體的需求確定,比如說進行襯衫尺寸的聚類你可能就會考慮分成三類(L,M,S)等!

③ spark kmeans 怎麼算到中心點的距離

[Idx,C,sumD,D]=Kmeans(data,3,』dist』,』sqEuclidean』,』rep』,4) 等號右邊: kmeans:K-均值聚類 data是你自己的輸入數據 3 是你要聚成3類 dist sqEuclidean 這2個參數,表示距離函數為歐式距離。

④ k-means聚類演算法python實現,導入的數據集有什麼要求

一,K-Means聚類演算法原理
k-means 演算法接受參數 k
;然後將事先輸入的n個數據對象劃分為
k個聚類以便使得所獲得的聚類滿足:同一聚類中的對象相似度較高;而不同聚類中的對象相似度較小。聚類相似度是利用各聚類中對象的均值所獲得一個「中心對
象」(引力中心)來進行計算的。
K-means演算法是最為經典的基於劃分的聚類方法,是十大經典數據挖掘演算法之一。K-means演算法的基本思想是:以空間中k個點為中心進行聚類,對最靠近他們的對象歸類。通過迭代的方法,逐次更新各聚類中心的值,直至得到最好的聚類結果。

⑤ spark機器學習-聚類

spark機器學習-聚類
聚類演算法是一種無監督學習任務,用於將對象分到具有高度相似性的聚類中,聚類演算法的思想簡單的說就是物以類聚的思想,相同性質的點在空間中表現的較為緊密和接近,主要用於數據探索與異常檢測,最常用的一種聚類演算法是K均值(K-means)聚類演算法

演算法原理
kmeans的計算方法如下:
1 選取k個中心點
2 遍歷所有數據,將每個數據劃分到最近的中心點中
3 計算每個聚類的平均值,並作為新的中心點
4 重復2-3,直到這k個中線點不再變化(收斂了),或執行了足夠多的迭代
演算法的時間復雜度上界為O(n*k*t), 其中k為輸入的聚類個數,n為數據量,t為迭代次數。一般t,k,n均可認為是常量,時間和空間復雜度可以簡化為O(n),即線性的
spark ml編碼實踐
可在spark-shell環境下修改參數調試以下代碼,可以用實際的業務數據做測試評估,業務數據一般是多列,可以把維度列用VectorAssembler組裝成向量列做為Kmeans演算法的輸入列,考慮現實的應用場景,比如做異常數據檢測,正常數據分為一類,異常數據分為幾類,分別統計正常數據與異常數據的數據量,求百分比等
<span style="font-size:18px;">import org.apache.spark.ml.clustering.KMeans
import org.apache.spark.mllib.linalg.Vectors

val dataset = sqlContext.createDataFrame(Seq(
(1, Vectors.dense(0.0, 0.0, 0.0)),
(2, Vectors.dense(0.1, 0.1, 0.1)),
(3, Vectors.dense(0.2, 0.2, 0.2)),
(4, Vectors.dense(9.0, 9.0, 9.0)),
(5, Vectors.dense(1.1, 1.1, 0.1)),
(6, Vectors.dense(12, 14, 100)),
(6, Vectors.dense(1.1, 0.1, 0.2)),
(6, Vectors.dense(-2, -3, -4)),
(6, Vectors.dense(1.6, 0.6, 0.2))
)).toDF("id", "features")

// Trains a k-means model
val kmeans = new KMeans().setK(3).setMaxIter(20).setFeaturesCol("features").setPredictionCol("prediction")
val model = kmeans.fit(dataset)

// Shows the result
println("Final Centers: ")
model.clusterCenters.foreach(println)
model.clusterCenters.zipWithIndex.foreach(println)

val myres = model.transform(dataset).select("features","prediction")
myres.show()</span>
聚類演算法是一類無監督式機器學習演算法,聚類效果怎麼評估,模型訓練參數怎麼調優,是否能用管道來訓練模型來比較各種不同組合的參數的效果,即網格搜索法(gridsearch),先設置好待測試的參數,MLLib就會自動完成這些參數的不同組合,管道搭建了一條工作流,一次性完成了整個模型的調優,而不是獨立對每個參數進行調優,這個還要再確認一下,查看SPARK-14516好像目前還沒有一個聚類效果通用的自動的度量方法
像這種代碼(不過現在這個代碼有問題):
<span style="font-size:18px;">import org.apache.spark.ml.clustering.KMeans
import org.apache.spark.mllib.linalg.Vectors
import org.apache.spark.ml.tuning.{ ParamGridBuilder, CrossValidator }
import org.apache.spark.ml.{ Pipeline, PipelineStage }

val dataset = sqlContext.createDataFrame(Seq(
(1, Vectors.dense(0.0, 0.0, 0.0)),
(2, Vectors.dense(0.1, 0.1, 0.1)),
(3, Vectors.dense(0.2, 0.2, 0.2)),
(4, Vectors.dense(9.0, 9.0, 9.0)),
(5, Vectors.dense(1.1, 1.1, 0.1)),
(6, Vectors.dense(12, 14, 100)),
(6, Vectors.dense(1.1, 0.1, 0.2)),
(6, Vectors.dense(-2, -3, -4)),
(6, Vectors.dense(1.6, 0.6, 0.2))
)).toDF("id", "features")

val kmeans = new KMeans().setK(2).setMaxIter(20).setFeaturesCol("features").setPredictionCol("prediction")
//主要問題在這里,沒有可用的評估器與label列設置
val evaluator = new BinaryClassificationEvaluator().setLabelCol("prediction")
val paramGrid = new ParamGridBuilder().addGrid(kmeans.initMode, Array("random")).addGrid(kmeans.k, Array(3, 4)).addGrid(kmeans.maxIter, Array(20, 60)).addGrid(kmeans.seed, Array(1L, 2L)).build()
val steps: Array[PipelineStage] = Array(kmeans)
val pipeline = new Pipeline().setStages(steps)

val cv = new CrossValidator().setEstimator(pipeline).setEvaluator(evaluator).setEstimatorParamMaps(paramGrid).setNumFolds(10)
// Trains a model
val pipelineFittedModel = cv.fit(dataset)</span>

⑥ python有沒有內置kmeans函數

1、從Kmeans說起
Kmeans是一個非常基礎的聚類演算法,使用了迭代的思想,關於其原理這里不說了。下面說一下如何在matlab中使用kmeans演算法。
創建7個二維的數據點:

復制代碼 代碼如下:
x=[randn(3,2)*.4;randn(4,2)*.5+ones(4,1)*[4 4]];

使用kmeans函數:

復制代碼 代碼如下:
class = kmeans(x, 2);

x是數據點,x的每一行代表一個數據;2指定要有2個中心點,也就是聚類結果要有2個簇。 class將是一個具有70個元素的列向量,這些元素依次對應70個數據點,元素值代表著其對應的數據點所處的分類號。

⑦ Python Kmeans聚類如何檢驗所得結果最優

需要選擇一個k值,也就是我們希望把數據分成多少類,這里k值的選擇對結果的影響很大,Ng的課說的選擇方法有兩種一種是elbow method,簡單的說就是根據聚類的結果和k的函數關系判斷k為多少的時候效果最好。

⑧ python代碼如何應用系統聚類和K-means聚類法進行聚類分析 然後選擇變數,建立適當的模型

-Means聚類演算法
k-means演算法以k為參數,把n個對象分成k個簇,使簇內具有較高的相似度,而簇間的相似度較低。

隨機選擇k個點作為初始的聚類中心。
對於剩下的點,根據其與聚類中心的距離,將其歸入最近的簇。
對每個簇,計算所有點的均值作為新的聚類中心。
重復2,3直到聚類中心不再發生改變

Figure 1

K-means的應用
數據介紹:
現有1999年全國31個省份城鎮居民家庭平均每人全年消費性支出的八大主要變數數據,這八大變數分別是:食品、衣著、家庭設備用品及服務、醫療保健、交通和通訊、娛樂教育文化服務、居住以及雜項商品和服務。利用已有數據,對31個省份進行聚類。

實驗目的:
通過聚類,了解1999年各個省份的消費水平在國內的情況。

技術路線:
sklearn.cluster.Kmeans

數據實例:

⑨ 如何利用spark實現kmeans聚類演算法

用spark做kmeans演算法的例子,里邊導入的數據總是有sample_linear_regression_data.txt sample_svm_data。

⑩ 如何在hadoop上運行 k-means演算法

可以自己嘗試寫一個分布式的kmeans,也可以部署spark,使用spark-mllib裡面的kmeans
如果對python比較熟悉,可以使用pyspark的mllib
如果只是hadoop,找找mahout演算法包

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