linux運行r

A. linux R語言運行腳本，提示載入程輯包，運行不成功

「載入需要的程輯包：」這種提示沒什麼大不了的，實在覺得煩就在腳本里導致出現這些東西的命令外面套一層suppressMessages()函數，比如suppressMessages(library(foreach))。
關鍵是後面提示的錯誤要解決。

B. linux系統進程長時間運行r狀態會有什麼影響

linux
在設計時就是針對長期運行的，穩定性很好。linux系統經過精心配置後，可以
連續運行
數年而不用重啟的，即便是更新系統，也可以連續運行。
現在的linux好型實現了更換內核也不用重啟的功能。

C. linux伺服器怎麼運行r語言

我有點不太理解是什麼意思……Linux系統都有對應的R軟體版本，可以從R的官網下載，安裝了之後直接打開R運行就好了吧。

D. linux命令行中 -r 與 -R 有什麼區別哪些地方用大寫，哪些地方用小寫

linux命令行中 -r 與 -R 就是代表不同參數，根據需求用的參數不一樣。只是剛好用了r這個字母，其實沒有任何關聯。看參數可以用man或者後面加--help，具體用什麼參數要根據事情 決定

E. 如何在linux下後台運行.r文件

linux下，沒有文件擴展名的區分，任何擴展名的文件可能是一個shell，要在後台運行，有以下幾種情況：
1.在命令後面加上&，就可以使該命令在後台進行工作，這樣做最大的好處就是不怕被ctrl+c這個中斷指令所中斷。
2. 在後台執行的程序怎麼使它恢復到前台來運行呢？很簡單，只用執行fg這個命令，就可以了。
3.已經在前台運行的命令，我能把它放到後台去運行么？當然可以了，只要執行ctrl+z就可以做到了。
4.如果我有多個進程在後台運行，那如何恢復到前台來執行呢？這時候就要用到jobs這個命令了，通過jobs這個命令，能夠列出所有在後台執行的進程，那個中括弧（[ ]）裡面的數字就是 jobs 的代號啰 ，通過fg %number 就可以恢復指定的後台進程.
5.另外，screen可以實現類似後台運行的交互操作。

F. 如何在linux環境下使用r語言

1、下載
wget http://mirror.bjtu.e.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz

2、解壓：
tar -zxvf
R-3.0.1.tar.gz
cd R-3.0.1

3、安裝 (當然也可以跳過)
yum
install readline-devel
yum install libXt-devel
./configure

4、 配置環境並編譯安裝
#
如果使用rJava需要加上 --enable-R-shlib
(這個我不需要，所以加入到後面)
# 如果3沒安裝, 那麼後面加上： --with-readline=no
--with-x=no
./configure --prefix=/usr/R-3.0.1
make $$ make install

5、配置環境變數並生效
vi
.bash_profile
export R_HOME=/usr/R-3.0.1
export PATH=.:$R_HOME/bin:$PATH

# 試環境變數生效
source .bash_profile

6、 命令行測試
[admin@JD
software]$ R
WARNING: ignoring environment value of R_HOME

R version 3.0.1 (2013-05-16) -- "Good Sport"
Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)

R是自由軟體，不帶任何擔保。
在某些條件下你可以將其自由散布。
用'license()'或'licence()'來看散布的詳細條件。

R是個合作計劃，有許多人為之做出了貢獻.
用'contributors()'來看合作者的詳細情況
用'citation()'會告訴你如何在出版物中正確地引用R或R程序包。

用'demo()'來看一些示範程序，用'help()'來閱讀在線幫助文件，或
用'help.start()'通過HTML瀏覽器來看幫助文件。
用'q()'退出R.

> q()

7、創建腳本測試(t.R)
cd
/opt/script/R
vim t.R

#!/path/to/Rscript
#第一行
x<-c(1,2,3)
#R語言代碼
y<-c(102,299,301)
model<-lm(y~x)
summary(model)

8、測試：執行腳本
R CMD BATCH
--args /opt/script/R/t.R
more
/opt/script/R/t.Rout
#查看執行的結果
或者第二種方式
Rscript
/opt/script/R/test.R
#結果直接輸出到終端

G. LINUX命令的cp -r 和-R的區別是

cp -r 的作用是遞歸，可復制目錄，如果復制目錄必須加此選項。

cp -R的作用僅僅是復制目錄。

不過cp -r 和-R命令功能上是等價的。不加-r或者－R的時候，只輸入命令cp時只拷貝文件，不拷貝文件夾，加上後則會拷貝文件夾——包括下一級的子文件夾，以及子文件夾中的子文件夾，以此類推。

(7)linux運行r擴展閱讀：

cp命令還有以下幾種用法:

cp -p可以保留許可權、屬主、時間戳。

cp -d作用為默認鏈接文件是復制鏈接指向的源文件，-d 復制鏈接文件本身。

cp -L作用為保存鏈接所指向的文件，默認cp 就是，不需要-L。

cp -a作用為歸檔復制，常用於備份，相當於cp -dr --preserve=all。

cp -v作用為復制過程可見。

cp -s 作用為創建新的符號鏈接文件，指向原符號鏈接文件，能保證鏈接文件可以使用

cp -u作用為只復制更新的文件

H. linux 文件 r許可權可以執行哪些命令

使用sudo命令，命令格式sudo <需要root許可權的具體command>
sudo使一般用戶不需要知道超級用戶的密碼即可獲得許可權。而可以使用sudo命令的用戶則由/etc/sudoers配置文件來管理。
編輯/etc/sudoers的方法：
1. 先給root用戶/etc/sudoers文件的編輯許可權，#chmod 740 /etc/sudoers
2. #vi /etc/sudoers,進入編輯模式，找到這一 行："root ALL=(ALL) ALL"在起下面添加"xxx ALL=(ALL) ALL"(這里的xxx是你的用戶名)，然後保存退出。
3. 把/etc/sudoers文件的許可權復原，#chmod 440 /etc/sudoers
使用sudo後，需要輸入一次當前用戶的密碼進行身份驗證（此處注意，並非root用戶的密碼！），五分鍾後，再次使用sudo命令時，需要再次認證。
命令實例：
[mao@linux6 ~]$ whoami
mao
[mao@linux6 ~]$ sudo whoami
[sudo] password for mao:
root
[mao@linux6 ~]$

I. 學校Linux伺服器上如何跑R腳本

只需要在R腳本首行，加入下圖中的代碼即可：

R --no-save <mergefiles.r

nohupR[options] [< infile] [> outfile]

nohup 後台運行程序

options：

--version查看R版本；

--slave只列印R腳本的輸出，而不顯示腳本具體執行情況；

--vanilla是--no-save,--no-restore,--no-site-file,--no-init-file和--no-environ的綜合；

--args後面是需要傳遞的參數。

注意：options必須選擇--save，--no-save, --vanilla三個中的一個。

比如編輯一個mergefiles.r文件如下：

R --slave --vanilla <mergefiles.r

J. linux系統運行級別

一、Linux運行級別

• 0： 關機

• 1： 單用戶

• 2： 無網路的多用戶

• 3：命令行模式

• 4： 未用

• 5： GUI（圖形桌面 模式）

• 6 ： 重啟

• 運行級別的切換

• init 想要切換的運行級別

二、查看運行級別

• who -r ： 顯示當前運行級別以及系統當前時間 。

  [outman02@bogon ~]$ who -r
  run-level 5 2017-11-02 17:55
  

• runlevel ： 顯示前一個運行級別（無則顯示」N」） 、 當前運行級別

  [outman02@bogon ~]$ runlevel
  N 5
  

三、案例

• 案例一 ： 運行級別切換

  切換為命令行模式
  [outman02@localhost ~]$ init 3
  切換為圖形界面模式
  [outman02@localhost ~]$ init 5
  

• 案例二 ： 並不是所有的圖形界面運行級別都是5

  在案例一的基礎上（命令行模式下）執行
  [outman02@localhost ~]$ startx //在命令行級別打開GUI
  然後打開Terminal 執行級別顯示命令
  [outman02@localhost ~]$ runlevel
  5 3
  發現當前運行級別是3 ， 這是因為在startx啟動的桌面只是相當於在命令行級別 中開啟了一個進程 。 所以運行級別沒有變化 。
  
  

• 案例三 ： 不是所有的 命令行模式運行級別都是3

  在圖形界面模式下按下ctrl+alt+F2 進入命令行模式 執行
  [outman02@localhost ~]$ runlevel
  3 5 //當前級別仍然為5
  ctrl+alt+F7 回到圖形界面模式
  

• 總結： 運行界別是相對於系統而言的 ， 切換運行級別通過「init運行級別」來進行切換 。

四、運行級別的作用

• 作用：

• [outman02@localhost ~]$ reboot

• [outman02@localhost ~]$ shutdown -r now

• [outman02@localhost ~]$ init 6

• 重啟

• 伺服器一般使用運行級別 ，減少圖形 界面帶來的資源浪費

• 忘記密碼時修改密碼

• 修改啟動時默認的運行級別

• 修改啟動時默認運行級別

• [outman02@localhost ~]# vim /etc//inittab

• 進入文件後將5改為3之後 ， 保存 ， 重啟 。