① linux快速入門第八章：Shell基礎
我們平時所說的 Shell 可以理解為 Linux 系統提供給用戶的使用界面。Shell 為用戶提供了輸入命令和參數並可得到命令執行結果的環境。當一個用戶登錄 Linux 之後，系統初始化程序 init 就根據 /etc/passwd 文件中的設定，為每個用戶運行一個被稱為 Shell（外殼）的程序。
確切地說，Shell 是一個命令行解釋器，它為用戶提供了一個向 Linux 內核發送請求以便運行程序的界面系統級程序，用戶可以用 Shell 來啟動、掛起、停止甚至編寫一些程序。
Shell 處在內核與外層應用程序之間，起著協調用戶與系統的一致性、在用戶與系統之間進行交互的作用。圖 1 是 Linux 系統層次結構圖，Shell 接收用戶輸入的命令，並把用戶的命令從類似 abed 的 ASCII 碼解釋為類似 0101 的機器語言，然後把命令提交到系統內核處理；當內核處理完畢之後，把處理結果再通過 Shell 返回給用戶。
換句話說：
Shell 是一個用 C 語言編寫的程序，它是用戶使用 Linux 的橋梁。Shell 既是一種命令語言，又是一種程序設計語言。
Shell 是指一種應用程序，這個應用程序提供了一個界面，用戶通過這個界面訪問操作系統內核的服務。
Ken Thompson 的 sh 是第一種 Unix Shell，Windows Explorer 是一個典型的圖形界面 Shell。
Shell 與其他 Linux 命令一樣，都是實用程序，但它們之間還是有區別的。一旦用戶注冊到系統後，Shell 就被系統裝入內存並一直運行到用戶退出系統為止；而一般命令僅當被調用時，才由系統裝入內存執行。
與一般命令相比，Shell 除了是一個命令行解釋器，同時還是一門功能強大的編程語言，易編寫，易調試，靈活性較強。作為一種命令級語言，Shell 是解釋性的，組合功能很強，與操作系統有密切的關系，可以在 Shell 腳本中直接使用系統命令。大多數 Linux 系統的啟動相關文件（一般在 /etc/rc.d 目錄下）都是使用 Shell 腳本編寫的。
同傳統的編程語言一樣，Shell 提供了很多特性，這些特性可以使 Shell 腳本編程更為有用，如數據變數、參數傳遞、判斷、流程式控制制、數據輸入和輸出、子程序及中斷處理等。
說了這么多，其實我們在 Linux 中操作的命令行界面就是 Linux 的 Shell，也就是 Bash，但是我們的圖形界面是 Shell 嗎？其實從廣義講，圖形界面當然也是 Shell，因為它同樣用來接收用戶的操作，並傳遞到內核進行處理。不過，這里的 Shell 主要指的是 Bash。
Shell 腳本
Shell 腳本（shell script），是一種為 shell 編寫的腳本程序。
業界所說的 shell 通常都是指 shell 腳本，但讀者朋友要知道，shell 和 shell script 是兩個不同的概念。
由於習慣的原因，簡潔起見，本文出現的 "shell編程" 都是指 shell 腳本編程，不是指開發 shell 自身。
Shell的分類
目前 Shell 的版本有很多種，如 Bourne Shell、C Shell、Bash、ksh、tcsh 等，它們各有特點，下面簡要介紹一下。
最重要的 Shell 是 Bourne Shell，這個命名是為了紀念此 Shell 的發明者 Steven Bourne。從 1979 年起，UNIX 就開始使用 Boume Shell。Bourne Shell 的主文件名為 sh，開發人員便以 sh 作為 Bourne Shell 的主要識別名稱。
雖然 Linux 與 UNIX 一樣，可以支持多種 Shell，但 Boume Shell 的重要地位至今仍然沒有改變，許多 UNIX 系統中仍然使用 sh 作為重要的管理工具。它的工作從開機到關機，幾乎無所不包。在 Linux 中，用戶 Shell 主要是 Bash，但在啟動腳本、編輯等很多工作中仍然使用 Bourne Shell。
C Shell 是廣為流行的 Shell 變種。C Shell 主要在 BSD 版的 UNIX 系統中使用，發明者是柏克萊大學的 Bill Joy。C Shell 因為其語法和 C 語言類似而得名，這也使得 UNIX 的系統工程師在學習 C Shell 時感到相當方便。
Bourne Shell 和 C Shell 形成了 Shell 的兩大主流派別，後來的變種大都吸取這兩種 Shell 的特點，如 Korn、 tcsh 及 Bash。
Bash Shell 是 GNU 計劃的重要工具之一，也是 GNU 系統中標準的 Shell。Bash 與 sh 兼容，所以許多早期開發出來的 Bourne Shell 程序都可以繼續在 Bash 中運行。現在使用的 Linux 就使用 Bash 作為用戶的基本 Shell。
Bash 於 1988 年發布，並在 1995-1996年推出Bash 2.0。在這之前，廣為使用的版本是1.14，Bash 2.0增加了許多新的功能，以及具備更好的兼容性。表 2 中詳細列出了各版本的具體情況。
注意，Shell 的兩種主要語法類型有 Bourne 和 C，這兩種語法彼此不兼容。Boume 家族主要包括 sh、ksh、Bash、psh、zsh；C 家族主要包括 csh、tcsh（Bash 和 zsh 在不同程序上支持 csh 的語法）。
本章講述的腳本編程就是在 Bash 環境中進行的。不過，在 Linux 中除了可以支持 Bash，還可以支持很多其他的 Shell。我們可以通過 /etc/shells 文件來査詢 Linux 支持的 Shell。命令如下：
在 Linux 中，這些 Shell 是可以任意切換的，命令如下：
用戶信息文件 /etc/passwd 的最後一列就是這個用戶的登錄 Shell。命令如下：
大家可以看到，root 用戶和其他可以登錄系統的普通用戶的登錄 Shell 都是 /bin/bash，也就是 Linux 的標准 Shell，所以這些用戶登錄之後可以執行許可權允許范圍內的所有命令。不過，所有的系統用戶（偽用戶）因為登錄 Shell 是 /sbin/ndogin，所以不能登錄系統。
筆記：
sh/bash/csh/Tcsh/ksh/pdksh等shell的區別
② Linux如何編寫shell腳本
一般以#!/bin/sh開頭（不是必須要寫，但一定要單獨一行），指定執行這個腳本的shell程序（也可以用#!/bin/zsh或其他），然後就是堆命令了。
Linux的shell腳本支持很多功能，加上Linux高度模塊化的命令，完全可以用shell腳本寫出復雜的程序。
以上只是簡單介紹如何開始寫shell腳本，如果要寫復雜的腳本，還需要深入學習相關知識（如if——fi、case——esac等結構）。
當然，還需要給腳本加上可執行許可權(chmod +x ./file.sh），否則可以用sh ./file.sh方式執行腳本（這里的sh是執行腳本所需shell，命令也可以是zsh ./file.sh或其他）。
整個shell腳本，其實就相當於你在終端輸入的一系列命令，如果想在shell里做什麼，就先想想在終端可以做什麼吧，字元的的連接，就是直接用 "" 雙引號，輸出，變數定義無 $ 符號，但是使用時一定要加上 $ 符號。
"=" 賦值符號，兩邊一定不能有空格，這和其他語言有區別，尤其是你還有自己代碼美觀風格時特別注意，否則會報語法錯誤！
for 中的數組內容是以 " " 空格分隔，而非 "," 逗號分格。
條件判斷 [ true ] 中括弧 後面需要有一個空格，但是兩個中括弧之間不能有空格如 [[ true ]]。
while 條件判斷可以用 () 括弧，也可以用 [[ ]] 中括弧。
如果用windows寫shell,一定要注意換行符格式 而非 ， 需要藉助一些編輯器(如notepad++)更改換行符格式！
③ Linux裡面基本的shell腳本編寫有哪些
shell腳本就是一些命令的集合。
舉個例子，我想實現這樣的操作：
1）進入到/tmp/目錄；
2）列出當前目錄中所有的文件名；
3）把所有當前的文件拷貝到/root/目錄下；
4）刪除當前目錄下所有的文件。
簡單的4步在shell窗口中需要你敲4次命令，按4次回車。這樣是不是很麻煩？當然這4步操作非常簡單，如果是更加復雜的命令設置需要幾十次操作呢？那樣的話一次一次敲鍵盤會很麻煩。所以不妨把所有的操作都記錄到一個文檔中，然後去調用文檔中的命令，這樣一步操作就可以完成。其實這個文檔呢就是shell腳本了，只是這個shell腳本有它特殊的格式。《linux 就該這么學》
Shell腳本通常都是以.sh 為後綴名的，這個並不是說不帶.sh這個腳本就不能執行，只是大家的一個習慣而已。所以，以後你發現了.sh為後綴的文件那麼它一定會是一個shell腳本了。test.sh中第一行一定是 「#! /bin/bash」 它代表的意思是，該文件使用的是bash語法。如果不設置該行，那麼你的shell腳本就不能被執行。』#』表示注釋，在前面講過的。後面跟一些該腳本的相關注釋內容以及作者和創建日期或者版本等等。當然這些注釋並非必須的，如果你懶的很，可以省略掉，但是筆者不建議省略。因為隨著你工作時間的增加，你寫的shell腳本也會越來越多，如果有一天你回頭查看你寫的某個腳本時，很有可能忘記該腳本是用來干什麼的以及什麼時候寫的。所以寫上注釋是有必要的。另外系統管理員並非你一個，如果是其他管理員查看你的腳本，他看不懂豈不是很郁悶。該腳本再往下面則為要運行的命令了。
④ 學生信的那些事兒之七 - Linux基礎之Shell腳本編程
沿著前面的軌跡，接下來是Linux中shell腳本的學習。這對於生信工程師後續處理大量 (海量更合適些) 數據是非常非常脊碼重要的，但是同樣的，作為一個有點古板的人，對於"腳本"是什麼意思我都死磕了好久。主要覺得有些抽象，尤其是跟生信的同事討論項目分析部分的問題時，他們經常會說道這個詞，在他們意識里這是個不言自明的術語，殊不知對外行人而言 (比如我)，那簡直就是無情的"知識的詛咒"。經常是我假裝聽懂了，然後繼續討論下面的問題，形成一個模糊的印象。
網路上的解釋是：腳本（Script）是一種批處理文件的延伸，是一種純文本保存的程序，一般來說的計算機腳本程序是確定的一系列控制計算機進行運算操作動作的組合，在其中可以實現一定的邏輯分支等。不知道你能不能看懂，反正我開始的時候真是一知半解。
鳥哥私房菜的解釋是：shell script是利用 shell 的功能所寫的一個"程序"，這個程序是使用純文本文件，將一些shell的語法與命令(含外部命令)寫在裡面，搭配正則表達式、管道命令與數據流重定向等功能，以達到我們所想要的處理的目的。不明覺厲，好像更看不懂了···
Jude 的簡單粗暴大白話解釋是：腳本就是Linux中很多命令按照一定規則的組合，以實現某個特定的功能。Linux中有很多簡單的命令，往往只是進行了簡單的對話，比如 cd 就是進入到某個目錄，簡單直接。但是如果我想進入某個目錄A，然後在目錄A中創建目錄B，再在目錄B中創建文本C呢？當然可以一步一步操作，如果想要一步到位呢，那就可以用腳本，把三個命令寫在一起，一起執行。好像有點啰嗦···
或者從英語的角度去理解，腳本的對應英文是Script，而這個單詞的中文釋義中還有劇本的意思。劇本就好理解了啊，劇本就是導演(生信工程師)基於某個主旨(要實現的目標)按照一定的手法(規則)所寫的一個故事。不管是哪個演員，都得按照劇本演。所以，學好英語對於生信也是有幫助的~
按照腳本的復雜程度可以分為：
這個無需多說，其實就是若干個簡單命令的順序排列，執行腳本後會按照命令的前後關系從前往後一一執行。
相對於簡單的基本腳本，結構化的命令腳本可以施加邏輯流程式控制制，從而改變程序(命令)執行的順序。基本腳本中的命令就是從上往下執行，但兄野迅是結構化的命令腳本可以根據邏輯判斷重復或者跳過某些命令。
常用的結構化命令(語句)有：
後面還有什麼嵌套循環啊啥的，不過我覺得上面的7中命令學到家了，應該可以應付大部分在生信分析裡面的應用了。
記得高中的時候，物理老師(也是班主任)在給我們講解習題時有個有意思的套路：不管什麼難題現在下面寫個"答："，以示自己解決問題的決心，也是一種正向的心理暗示。腳本編寫也是有套路的，不過總的來說還是比較簡單。
對於簡單的腳本(超級簡單的那種)，直接幾個命令連在一起即可，中間用"；"隔開。
對於更長更復雜的腳本，一般需要創建一個文本，並在裡面編輯。這就涉及到了文本編輯器，比較常用和簡單的一般有nano和vim，實在羨此很簡單，規則也容易理解，教程隨手可得，不多說。
比如用vim創建了一個腳本之後，具體的語法(套路)：
ok，腳本寫完了，怎麼讓腳本開始工作呢？這有涉及到之前講過的環境變數和相對路徑、絕對路徑了。方法有三：
就這么多吧，應該有點感覺到了，剩下的就是狂練狂練了~
⑤ linux shell腳本執行命令詳解
在Linux下，如果你需要執行shell腳本，那麼應該使用那個命令呢?下面由我為大家整理了linux shell腳本執行命令的相關知識，希望對大家有幫助!
linux shell腳本執行
linux shell腳本執行方法一： 切換到shell腳本所在的目錄(此時，稱為工作目錄)執行shell腳本：
cd /data/shell
./hello.sh
./的意思是說在當前的工作目錄下執行hello.sh。如果不加上./，bash可能會響應找到不到hello.sh的錯誤信息。因為目前的工作目錄(/data/shell)可能不在執行程序默認的搜索路徑之列,也就是說，不在環境變數PASH的內容之中。查看PATH的內容可用 echo $PASH 命令。現在的/data/shell就不在環境變數PASH中的，所以必須加上./才可執行。
linux shell腳本執行方法二： 以絕對路徑的方式去執行bash shell腳本：
/data/shell/hello.sh
linux shell腳本執行方法三： 直接使用bash 或sh 來執行bash shell腳本：
cd /data/shell
bash hello.sh
或
cd /data/shell
sh hello.sh
注意，若是以方法三的方式來執行，那麼，可以不必事先設定shell的執行許可權，甚至都不用寫shell文件中的第一行(指定bash路徑)。因為方法三是將hello.sh作為參數傳給sh(bash)命令來執行的。這時不是hello.sh自己來執行，而是被人家調用執行，所以不要執行許可權。那麼不用指定bash路徑自然也好理解了啊。
linux shell腳本執行方法四： 在當前的shell環境中執行bash shell腳本：
cd /data/shell
. hello.sh
或
cd /data/shell
source hello.sh
前三種方法執行shell腳本時都是在當前shell(稱為父shell)開啟一個子shell環境，此shell腳本就在這個子shell環境中執行。shell腳本執行完後子shell環境隨即關閉，然後又回到父shell中。而方法四則是在當前shell中執行的。
⑥ 如何在Windows下運行linux shell腳本
1、首先電腦中需要安裝的是git的應用程序，安裝完成之後，可以在開始菜單進行查看。
2、並需要配置好git的bin，配置環境變數，把bin的絕對路徑復制到環境變數中path。
3、配置git的環境變數之後，在任意文件進行創建一個為mkdir.sh，文件名可以是隨意的結尾需要為.sh。
4、然後在sh的文件中進行輸入#!/bin/shtoucha.txtsleep10echo"testtesttesttest">>a.txt
創建一個為txt文件後testtesttesttest寫入到txt文件中。
5、然後進行雙擊.sh的文件，會彈出git的命令窗口，根據代弊毀碼的執行的時間窗口顯示多久。
6、然後就會自動生成一個檔旦a.txt的文件。
7、並會在a.txt文件中寫入為「testtesttesttest」的一段文字，即代表運行linuxshell腳本成功。租蠢備
⑦ 每天三分鍾搞定linux shell腳本24 後台模式運行
當運行腳本的時候在最後加上符號 & ，則對應的腳本在 後台運行 。建立腳本為，
輸入 ./test.sh & 運行
運行後1.txt文件會不斷增加內容，但是腳本以後台運行不會在終端佔用。運行結果為：
輸入 jobs 可以看到這個後台進程：
這個時候如果輸入exit，不會提示有後台進程在運行，而且後台進程也會退出。因為終端會話退出的時候會給這個後台進程發送一個 SIGHUP信號 。如果想要終端退出之後，進程不退出，可以讓進程捕獲SIGHUP信號。當然還有另一個方法，使用 nohup 指令運行腳本，比如輸入：
當用 nohup 並使用後台模式運行之後，即使退出終端，進程也不會收到SIGHUP信號。並且nohup會自動把標准輸出和標准錯誤重定向到nohup.out的文件中。
一個 運行的進程或者暫停的進程 都是一個作業，使用 jobs 命令可以查看當前的作業狀態。輸入：
我當前的輸出為：
（上面的作業2是輸入 ctrl+z 後暫停的進程）
其中， + 號被當作是默認作業，每個作業的前面有自己的序號。如果後續操作不加序號，那麼就被當做是在操作默認作業。比如使用 fg 指令前台運行作業，就是把27652這個進程前台運行，如果輸入 fg 1 ，那麼就是操作作業 1 了。帶-號的表示下一個默認作業。
輸入 bg 1 把 1號作業 後台運行，輸入 fg 2 把 2號作業 前台運行。
⑧ Linux shell有哪些類型Linux基礎教程
shell是一門腳本語言，即shell腳本，shell也是解釋執行的腳本語言，可直接調用Linux命令，所以它在Linux系統中有著非常重襲激旅要的作用。那麼Linux
shell有哪些類型?我們來看看吧。
shell腳本語言是弱類型語言，無需定義變數的類型就可使用，主要有兩大類：bourne shell、C shell。
第一種：Bourne shell
Bourne shell又包括Bourne shell (sh)、Korn shell (ksh)、Bourne Again
Shell(bash)三種類型。
Bourne shell (sh)由AT&T的Steve Bourne開發，是標準的拍凳UNIX Shell，很多UNIX系統都配有sh。
Korn shell (ksh)由David Korn開發，是Bourne
shell(sh)的超集合，並且添加了csh引入的新功能，是目前很多UNIX系統標准配置的Shell，在這些系統上的/bin/sh往往是指向/bin/ksh的符號鏈接。
Bourne Again
Shell即bash由GNU項目組開發，主要目標是與POSIX標準保持一致，同時兼顧對sh的兼容，bash從csh和ksh借鑒了很多功能，是各種Linux發行版默認配置的Shell，在Linux系統上的/bin/sh往往是指向/bin/bash的符號鏈接。雖然如此，bash和sh還是有很多的不同，一方面，bash擴展了一些命令和參數，另一方面，bash並不完全和sh兼容，它們有些行為並不一致，但大多數企業運維的情況下區別不大，特殊場景可以使用bash替代sh。
第二種：C shell
C shell又包括csh、tcsh兩種類型。
csh由Berkeley大學開發，隨BSD UNIX發布，它的流程式控制制語句很像C語言，支持很多Bourne
Shell所不支持的功能，例如：作業控制、別名、系統算術、命令歷史、命令行編輯等。
tcsh是csh的增強版，加入了命令補全等功能，在FreeBSD、Mac OS X等系統上替代了csh。
以上介紹的這些Shell中，較為通用的是標準的Bourne shell (sh)和C shell (csh)。其中Bourne shell
(sh)已經被Bourne Again shell (bash) 取代。
可通過以下命令查看CentOS7系統的Shell支持情鉛舉況。
[root@oldboy ~]# cat /etc/shells
/bin/sh #<==這是Linux里常用的Shell，指向/bin/bash。
/bin/bash #<==這是Linux里常用的Shell，也是默認使用的Shell。
/usr/bin/sh
/usr/bin/bash
Linux系統中的主流Shell是bash，bash是由Bourne
Shell(sh)發展而來的，但bash還包含了csh和ksh的特色，但大多數腳本都可以不加修改地在sh上運行，如果你使用sh後發現結果和預期有差異，那麼可以嘗試使用bash替代sh。