sed簡介：流編輯工具，用來對文本進行過濾與替換操作。
sed流程：sed通過一次僅讀取一行內容來對某些指令進行處理後輸出。
1、sed通過文件或管道讀取文件內容，但sed默認並不直接修改源文件，而是將讀入的內容復制到緩沖區中，稱之為模式空間。
2、所有的指令操作都是在模式空間找那個進行
3、sed根據相應的指令對模式空間中的內容進行處理並輸出結果，默認輸出至標准輸出（即屏幕上）。
sed基本語法格式：
用法：sed[選項]...{腳本指令}[輸入文件]...
選項： -version 顯示sed版本
-help ：顯示幫助文檔
-n,-quiet,-silent靜默輸出，默認情況下，sed程序在所有的腳本指令執行完畢後，將自動列印模式空間中的內容。
-e script允許多個腳本指令被執行
-f script-file從文件中讀取腳本指令，對編寫自動化腳本程序很實用
-i ,-in-place 該選項直接修改源文件
-l N 該選項指定l指令可以輸出的行長度，l指令為輸出非列印字元。
-posix 禁用GNU sed擴展功能。
-r 在腳本指令中使用擴展正則表達式。
-s，-separate 默認情況下，sed將把輸入的多個文件名作為一個長的連續的輸入流。而GNU sed則允許把它們當作單獨的文件。
-u，-unbuffered 最低限度的緩存輸入與輸出
a，append表示追加指令；
i，insert表示插入指令；
d，delete表示刪除指令；
s，substitution表示替換指令。
sed腳本指令的基本格式是：
[地址,即路徑]命令（有些命令僅可以對一行操作，有些可以對多行操作），命令也可以用花括弧進行組合，使命令序列可以作用於同一個地址。
address{
command1
command2
command3
}
sed的基本工作方式是：
sed的替換命令s：
1、全局替換 ： s/old/new/g ，其中g為全局替換，用於替換所有出現的次數； /如果和正則匹配的內容沖突可以使用其他符號，如 ： s@old@new@g
2、標志位
為什麼要有多行模式: 配置文件一般有單行出現，但也有使用json或XML格式的配置文件，為多行出現。
多行模式處理命令N、D、P
❷ Linux sed 命令詳解
sed命令行格式：sed [options] 'command' file(s)
options常用選項：
-n或--quiet或——silent：僅顯示script處理後的結果;
-e：以選項中的指定的script來處理輸入的文本文件;
-f：以選項中指定的script文件來處理輸入的文本文件;
-r∶sed 的動作支援的是延伸型正規表示法的語法;
-i∶直接修改讀取的檔案內容，而不是由螢幕輸出;
-h或--help：顯示幫助;
-V或--version：顯示版本信息。
Command常用命令：
a：新增，a 的後面可以接字元串，而這些字元串會在新的一行出現(目前的下一行);
c：取代，c 的後面可以接字元串，這些字元串可以取代 n1,n2 之間的行;
d：刪除，d 後面通常不接任何字元串;
i：插入，i 的後面可以接字元串，而這些字元串會在新的一行出現(目前的上一行);
p：列印，亦即將某個選擇的資料印出。通常 p 會與參數 sed -n 一起運作;
s：取代，可以直接進行取代的工作，通常與正規表達式搭配使用。
實例說明：
新增操作：a命令
sed '/^bird/a\test' file將test追加到 以bird開頭的行後面
刪除操作：d命令
sed '/^$/d' file #刪除空白行;
sed '2d' file #刪除第二行;
sed '2,$d' file #刪除第2行到最後一行;
sed '$d' file #刪除最後一行;
sed '/^bird/'d file #刪除所有開頭是bird的行;
插入操作：i命令
sed -i '3i\bird ' bird.conf #在bird.conf文件第3行之前插入bird
替換文本中的字元串：s命令
sed 's/bird/birds/' file #將文本中的bird替換成birds;
sed -i 's/ bird / birds /g' file #將file文件中每一行的第一個bird替換為birds;
❸ Linux文本操作常用命令
在Linux系統里常用於文本查看、操作、統計的命令：
通過多敲鍵盤，形成手感 肌肉記憶 ，熟練掌握這些命令，在以後生信分析中游刃有餘。以下是每個命令的詳細的介紹（主要是跟著 生信技能樹小郭老師 學習做的筆記）
接下來通過示例把10個命令的常用參數和用法展示出來：
參數的用法介紹：
注意事項：
用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 編輯文本 ，編輯文本要加 > 符號，退出時，另起一行，按 control C 退出
zcat可以查看壓縮的文本文件，tac逆向查看
結合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 後 n 行，默認 10 行 （在R語言里head和tail默認是前6行）。
less命令用得最多 ，more命令用得比較少
3.1 less命令
less [參數] 文件名
less命令重要的補充用法1 ：
需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q鍵
less命令重要的補充用法2 ：
參數用法：
less命令 不加參數 查看文件：
less命令加 -N參數 查看文件：顯示行號
less命令加 -S參數 查看文件：單行顯示，非常規整
對比：less和cat命令顯示文本行號的用法：less -N，cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐頁查看，按空格翻頁，按回車換行 ，more命令一般很少用，熟練掌握less命令就好
查看壓縮文件
wc 統計字元是也把換行符統計進去，但是別的命令不一定會把換行符算進去，。
常見參數:
切記：用less命令，按q退出
cut命令是按關鍵詞來切的
常見參數:
排列前：
排列後：
解釋：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。
命令行查看一個表格結構時，因為製表符對齊的原因，出現一個錯位的現象。還有 字典排序 可能和我們平時的認知不一樣，所以 加上-n參數 ， 讓數值有數學意義上的大小來排序 。
uniq命令去重，只有兩行出現重復，而且是相鄰的兩行，如果不相鄰，即使出現兩行一模一樣，不會去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
換其它文件試試
總之，uniq命令使用時經常和sort一起
常見參數:
常見用法1：
paste file1 file2
-s :按行合並 演示
常見用法2 : paste - -
常見參數:
要養成一個好習慣，原始數據不要輕易修改，修改的東西另外保存，文本保存用> (重定向)或是 >>(追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ，然後管道符傳遞給 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的內容
3. 在第2步的基礎上截取分號分割的第1列
4. 在第3步的基礎上排序、去重復並統計
5. 在第4步的基礎上，將空格替換成製表符
補充小知識 ：
清屏 ：control L
查看歷史（輸入過的）命令 ：history
❹ Linux環境下文本處理，提取需要的內容
linux 文本編輯器有這個功能，可以進行游標的調整來獲取你要的內容。很方便的！