r升級linux

A. linux中升級更新命令yum upgrade和yum update的區別

1、作用

都是系統升級命名。

2、升級內容

yum -y update：升級所有包同時也升級軟體和系統內核；

yum -y upgrade：只升級所有包，不升級軟體和系統內核。

3、使用范圍

yum -y update：需要更新內核；

yum -y upgrade：更新系統時，軟體和內核保持原樣。

(1)r升級linux擴展閱讀：

安裝軟體(以foo-x.x.x.rpm為例）：yum install foo-x.x.x.rpm

刪除軟體：yum remove foo-x.x.x.rpm或者yum erase foo-x.x.x.rpm

升級軟體：yum upgrade foo或者yum update foo

查詢信息：yum info foo

搜索軟體（以包含foo欄位為例）：yum search foo

顯示軟體包依賴關系：yum deplist foo

常用功能：

• -q 靜默執行
  

• -t 忽略錯誤
  

• -R[分鍾] 設置等待時間
  

• -y 自動應答yes
  

• --skip-broken 忽略依賴問題
  

• --nogpgcheck 忽略GPG驗證

B. linux伺服器安裝R語言及Rstudio server

在linux伺服器上使用R語言及Rstudio server
cat /etc/redhat-release: 查看伺服器系統版本

wget https://mirrors.tuna.tsinghua.e.cn/CRAN/src/base/R-3/R-3.6.1.tar.gz

checking for rl_callback_read_char in -lreadline... no
configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available

configure: WARNING: you cannot build info or HTML versions of the R manuals
configure: WARNING: you cannot build PDF versions of the R manuals
configure: WARNING: you cannot build PDF versions of vignettes and help pages

6.安裝
make
make install
安裝成功！

R #在命令行直接輸入「R」即可進入R 編輯。
q() ##退出R編輯
7.安裝R-studio-server
wget https://download2.rstudio.org/server/centos6/x86_64/rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpm

yum install rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpm
8.R-studio-server的一些命令
rstudio-server start ##啟動 rstudio
rstudio-server stop ## 關閉rstudio
rstudio-server status ## 查看rstudio 運行狀態
運行rstudio-server status出現 「Active: active (running) 」 表示rstudio 已啟動
rstudio-server verify-installation ## 查看rstudio 安裝錯誤
rstudio-server restart ##重啟

ifconfig ##查看伺服器ip地址。
查看運行中R進程
rstudio-server active-sessions
指定PID，停止運行中的R進程
rstudio-server suspend-session <pid>
停止所有運行中的R進程
rstudio-server suspend-all
強制停止運行中的R進程，優先順序最高，立刻執行
rstudio-server force-suspend-session <pid>
rstudio-server force-suspend-all
RStudio Server臨時下線，不允許web訪問，並給用戶友好提示
rstudio-server offline
RStudio Server臨時上線
rstudio-server online

8.rstudio-server系統設置
主要有兩個配置文件，默認文件不存在（非必要，可不做修改）
/etc/rstudio/rserver.conf
/etc/rstudio/rsession.conf

vi /etc/rstudio/rserver.conf
www-port=8080#監聽埠,默認是8787，可以不做修改
www-address=127.0.0.0#允許訪問的IP地址，默認0.0.0.0

rstudio-server restart

vi /etc/rstudio/rsession.conf
session-timeout-minutes=30#會話超時時間
r-cran-repos= http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN #CRAN資源庫
rsession-which-r=/usr/local/bin/R ## 如果非root安裝，更改R所在目錄。
9.通過瀏覽器連接Rstudio-server
直接打開瀏覽器，輸入http://<伺服器ip>:8787 ## 如果修改過rserver.conf文件，後面的8787埠改為相應的埠即可。

這里需要我們輸入用戶名和密碼。關於用戶名有2點注意事項：
（1）.不允許使用system 用戶登陸，即用戶ids小於100的用戶。只能用普通用戶登錄
（2）.用戶的認證可以使用RSA。
如果沒有普通用戶，可以添加：

useradd newname # 添加一個名為newname的用戶
passwd newname ###給新用戶newname 設置密碼，密碼需是復雜密碼，否則可能通不過。
usermod -G happy newname ####將新用戶newname添加到happy 用戶組中，
在用useradd添加用戶之後，在默認的情況下，該賬號是暫時被封鎖的， 也就是說，該賬號是無法登錄，須要用passwd命令來給新創建的用戶設置密碼之後才可以使用。

10可能存在的問題
10.1如果你的rstudio-server沒有啟動 很大程度是安裝有誤，這里我將我遇到的錯誤分享出來
rstudio-server verify-installation

There is a libR.so in /usr/lib/R/lib, but (weirdly) ls -l reveals that
it dates from the my previous install of R-3.5.1 for which I did not
configure with --enable-R-shlib.
這里就提到無法找到libR.so文件，原因是配置R語言文件時，沒有加參數--enable-R-shlib.
這就必須要重新安裝R語言。使用make uninstall 刪除之前的安裝，最好也刪除R-3.6.1所在的文件夾，用「rm -r -f R-3.6.1".

使用rm 命令 -r 參數表示全部刪除， -f 參數表示強制刪除，不會提醒。 同時使用這兩個參數要小心。
10.2 普通用戶無法啟動rstudio-server
sudo rstudio-server start## 以管理員方式執行命令
這時會需要輸入密碼並提示
xxx is not in the sudoers file.This incident will be reported.
如果不想出現上面的提示，就是給該用戶提高許可權，添加用戶使用sudo的權利。

su root ###切換到root用戶，如果有root許可權的話。
chmod u+w /etc/sudoers ###添加sudo文件的寫許可權
vi /etc/sudoers ###編輯sudoers文件，添加許可權。
找到這行 root ALL=(ALL) ALL,在他下面添加xxx ALL=(ALL) ALL (這里的xxx是你的用戶名)

youuser ALL=(ALL) ALL
%youuser ALL=(ALL) ALL
youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL
%youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL

chmod u-w /etc/sudoers ##撤銷sudoers文件寫許可權