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r编译安装

发布时间:2022-02-21 17:42:57

Ⅰ 如何在linux下安装RStudio

第一步:用Xshell登陆服务器,cd命令进入你要存放R.tar.gz压缩包的路径,cd ~/software,进入~/software路径才开始下载R压缩包。然后wget +url(R文件网址)获取R-3.0.0.tar.gz。

第二步,先解压R-3.0.0.tar.gz,然后cd R-3.0.0打开R-3.0.0文件夹

第三步,先make,然后 make install。make命令后出现Error 1和Error 2,我没有弄明白错误原因。

第四步,vim ~/.bash_profile,vim打开此文件后在PATH中修改环境变量PATH=/home/luokai/software/R/bin:$PATH(也就是你mkdir后面的路径)。vim打开文件后有三种模式:一般模式(打开后就是此模式),编辑模式以及命令行模式。在编辑模式下修改PATH后输入:wq(保持后退出)退出vim。

第五步,source ~/.bash_profile,然后R,打开R可以看见一些描述信息。R装好了。

1、R运行环境装好后,下载需要的R包,可以用较方便的install.packages命令。这里的dependencies设置为TRUE,可以自动下载你所装包“mpMap”所需要的其他依赖包。
2、加载R包,用包前需要先加载。有两种加载方法,实现加载的两个函数是:library和require。两者之间存在细微差别,后者会返回一个布尔值(TRUE或FALSE)来表示是否加载成功。

Ⅱ 请教如何在linux/centos的服务器下安装R

Linux软件的二进制分发是指事先已经编译好二进制形式的软件包的发布形式,其优点是安装使用容易,缺点则是缺乏灵活性,如果该软件包是为特定的硬件平台编译的,那它就不能在另外的平台或环境下正确执行。1、*.rpm形式的二进制软件包安装:rpm -ivh *.rpm
卸载:rpm -e packgename
说明:RPM(RedHat Packge
Manager)是RedHat公司出的软件包管理器,使用它可以很容易地对rpm形式的软件包进行安装、升级、卸载、验证、查询等操作,安装简单,而卸
载时也可以将软件安装在多处目录中的文件删除干净,因此推荐初学者尽可能使用rpm形式的软件包。rpm的参数中-i是安装,-v是校验,-h是用散列符
显示安装进度,*.rpm是软件包的文件名(这里的*.rpm特指*.src.rpm以外的以rpm为后缀的文件);参数-e是删除软件
包,packgename是软件包名,与软件包的文件名有所区别,它往往是文件名中位于版本号前面的字符串,例如apache-3.1.12-
i386.rpm和apache-devel-3.1.12-i386.rpm是软件包文件名,它们的软件包名称分别是apache和apache-
devel.更多的rpm参数请自行参看手册页:man rpm.
如果你不喜欢在字符界面下安装或卸载这些软件包,完全可以在X-Window下使用图形界面的软件包管理程序。现在这些做的非常好了。
2、*.tar.gz/*.tgz、*.bz2形式的二进制软件包
安装:tar zxvf *.tar.gz 或 tar yxvf *.bz2
卸载:手动删除
说明:*.tar.gz/*.bz2形式的二进制软件包是用tar工具来打包、用gzip/bzip2压缩的,安装时直接解包即可。对于解压后
只有单一目录的软件,卸载时用命令"rm -rf
软件目录名";如果解压后文件分散在多处目录中,则必须一一手动删除(稍麻烦),想知道解压时向系统中安装了哪些文件,可以用命令"tar ztvf
*.tar.gz"/"tar ytvf
*.bz2"获取清单。tar的参数z是调用gzip解压,x是解包,v是校验,f是显示结果,y是调用bzip2解压,t是列出包的文件清单。更多的参
数请参看手册页:man tar.
如果你更喜欢图形界面的操作,可以到Ubuntu上看看他的包管理,超级方便。
3、提供安装程序的软件包
这类软件包已经提供了安装脚本或二进制的安装向导程序(setup、install、install.sh等),只需运行它就可以完成软件的安
装;而卸载时也相应地提供了反安装的脚本或程序。例如SUN公司的StarOffice办公软件套件就使用名为setup的安装程序,而且在软件安装后提
供反安装的功能,目前这种类型的软件包还比较少,因其安装与卸载的方式与Windows软件一样,所以就无需多讲了。

Ⅲ 如何将写好的代码在r软件里装包运行

编译 运行后 在你的工作目录下面找到一个同名的.exe文件,然后把它带着走,到哪里都可以用 当然,如果你程序中用到了配置文件 资源文件或者dll文件 也请一并打包带走 如果程序比较大,可以到网上搜一下打包安装包的,可以制作安装包 值得一。

Ⅳ 如何在windows下使用Rtools生成包,并安装包

1、下载Rtools
Rtools的下载点是:
Please choose a CRAN mirrornear you, and follow the "Download R for Windows" link to
< CRAN mirror>/bin/windows/Rtools
找到CRAN镜像的网址:
China
http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN/ CTEX.ORG
http://cran.csdb.cn/ Computer Network Information Center, CAS, Beijing
http://mirror.bjtu.e.cn/cran Beijing Jiaotong University, Beijing
http://cran.dataguru.cn Dataguru (a, Guangzhou
http://mirrors.ustc.e.cn/CRAN/ University of Science and Technology of China
http://mirrors.xmu.e.cn/CRAN/ Xiamen University

在网址后面添加/bin/windows/Rtools 即可
比如: http://cran.csdb.cn/bin/windows/Rtools/
我们下载最新版:Rtools215.exe

2、安装Rtools
安装的过程很傻瓜,不过有一点要注意:这个选项必须要选中,否则不会自动添加环境变量的

安装完成之后,打开一个cmd窗口,输入gcc --help,无误则说明环境变量设置正确。有的时候需要重启计算机,环境变量才生效
注意:我安装的Rtools是没有perl和TeX的

3、编写包

假设我们有自定义函数f1和f2以及数据矩阵d1,将其做成package,名字为test1,使用package.skeleton会在工作路径下自动生成package的框架。如下所示:
setwd("D:/RData/workdir")
f1 <- function(aa){return (aa)}
f2 <- function(aa){return(aa+2)}
d1 <- matrix(1:6,2,3)
package.skeleton(name="test1", list=c("f1","f2","d1"))

我们会在D:\RData\workdir内发现新生成了文件夹test1,里面包含data、man和R三个子文件夹以及DESCRIPTION和Read-and-delete-me这两个文件。其中Read-and-delete-me可以通过文本工具打开阅读后删除,DESCRIPTION可以参照标准的规范进行修改后保存(不做修改也不影响正常运行)。data文件夹保存数据(本例中对应d1),R文件夹保存函数(本例中对应f1和f2),man文件夹存放.Rd文件,用来生成帮助文件。我们只需要修改每个.Rd文件就行,用文本工具打开并定位到“title”开头这一行,写入该函数或者数据的名称即可(比如d1),保存关闭。其实按照标准的做法,下面的description和examples之类的都要补全,但是只有title是必须补全的,否则编译会出错。

修改title这块:
原始数据是:
\title{
What the package does (short line)
~~ package title ~~
}
我修改为:
\title{
my test r package
}

4、编译包

打开CMD,定位到D:\RData\workdir,进行编译,如下所示:
D:
cd D:\RData\workdir
Rcmd build test1
注意:如果没有把R语言的路径添加到环境变量中,运行Rcmd是会报错的,这时有两个办法:
A。把Rcmd.exe所在路径添加到系统路径中
B。运行时添加Rcmd.exe的全路径,比如:
"C:\Program Files\R\R-2.15.0\bin\i386\Rcmd.exe" build test1

运行之后,查看D:\RData\workdir 目录下多了一个文件:
test1_1.0.tar.gz
(注意,按照之前帖子里的说法是运行Rcmd build --binary test1 之后会生成zip文件,但是我添加了--binary参数之后报错,最终生成的也是tar.gz格式的,不知道是为什么)
tar.gz格式的无法RGui环境中直接添

Ⅳ 如何在linux环境下使用r语言

1、下载
wget http://mirror.bjtu.e.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz

2、解压:
tar -zxvf
R-3.0.1.tar.gz
cd R-3.0.1

3、安装 (当然也可以跳过)
yum
install readline-devel
yum install libXt-devel
./configure

4、 配置环境并编译安装
#
如果使用rJava需要加上 --enable-R-shlib
(这个我不需要,所以加入到后面)
# 如果3没安装, 那么后面加上: --with-readline=no
--with-x=no
./configure --prefix=/usr/R-3.0.1
make $$ make install

5、配置环境变量并生效
vi
.bash_profile
export R_HOME=/usr/R-3.0.1
export PATH=.:$R_HOME/bin:$PATH

# 试环境变量生效
source .bash_profile

6、 命令行测试
[admin@JD
software]$ R
WARNING: ignoring environment value of R_HOME

R version 3.0.1 (2013-05-16) -- "Good Sport"
Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)

R是自由软件,不带任何担保。
在某些条件下你可以将其自由散布。
用'license()'或'licence()'来看散布的详细条件。

R是个合作计划,有许多人为之做出了贡献.
用'contributors()'来看合作者的详细情况
用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。

用'demo()'来看一些示范程序,用'help()'来阅读在线帮助文件,或
用'help.start()'通过HTML浏览器来看帮助文件。
用'q()'退出R.

> q()

7、创建脚本测试(t.R)
cd
/opt/script/R
vim t.R

#!/path/to/Rscript
#第一行
x<-c(1,2,3)
#R语言代码
y<-c(102,299,301)
model<-lm(y~x)
summary(model)

8、测试:执行脚本
R CMD BATCH
--args /opt/script/R/t.R
more
/opt/script/R/t.Rout
#查看执行的结果
或者第二种方式
Rscript
/opt/script/R/test.R
#结果直接输出到终端

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