蛋白质组学pdf

❼ 蛋白质的结构层次区分

蛋白质的结构层次：一级结构、二级结构、超二级结构、结构域、三级结构、四级结构.。 1、一级结构：即蛋白质的共价结构或平面结构，核心内容就是aa的排列顺序，它的改变涉及到蛋白质共价键的破坏和重建。
一级结构的全部内容包括：肽链的个数、aa的顺序、二硫键的位置、非aa成分。 2、二级结构的定义：肽链主干在空间的走向。主干指的是肽平面与α-C构成的链子， 2.1二级结构的内容：空间走向以及维持这种走向的力量：氢键和R基团的影响（离子键、疏水键、空间障碍等）
2.2二级结构的描述：ф角：肽平面绕N-Cα单键旋转的角度
ψ角：肽平面绕Cα-C羧基单键旋转的角度，至于+-方向的规定，0度角的规定太复杂，不作要求。
这样，一个肽平面的空间位置可以被2个二面角来确定，如果每个肽链的两个二面角（ф，ψ）都相同，则构成了规则的空间走向，所以可以用（ф，ψ）来描述肽链的二级结构。 3、超二级结构：空间相邻的几个2级结构形成的更复杂的结构，其类型有： 1、左手超螺旋：3根α-右手螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋，如头发中的角蛋白， 2、右手超螺旋：3根左手螺旋拧到一起形成一个右手超螺旋，如胶原蛋白，
3、αα：相邻的2根α-右手螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋，
4、β×β：一个连接链连着2个β折叠，平行式，这个连接链可以很长。
5、βαβ：3段β折叠和2段α螺旋相间形成，
6、βββ：以2段U-型回折连接着的3段β折叠，反平行式。
4.、结构域：长肽链（多于150个aa），在二级结构的基础上通过多次折叠，在空间上形成一些半独立的球状结构，叫结构域，它是三级结构的一部分，结构域之间靠无规卷曲连接。也就是说将三级结构拆开后首先看到的结构。. 5、三级结构：即蛋白质的三维结构、构象，指其中所有原子的空间排布，是结构域再经过卷曲和折叠后形成的。如果蛋白质是单条肽链，则三级结构就是它的最高级结构，三级结构由二硫键和次级键（氢键、疏水键、离子键、范德华力）维持。P99是肌红蛋白的三级结构。
6、四级结构：多条肽链通过非共价键（氢键、疏水键、离子键、范德华力）形成的聚合体的结构就是四级结构，注意，由二硫键连接的几条肽链不具有四级结构。每条肽链都有自己的三级结构，称为亚基或亚单位，一般情况下，具有四级结构的蛋白质含有的肽链不会太多，故称这类蛋白质为寡聚蛋白，如寡聚酶等。

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