⑴ 从并行计算的角度对比,MPI 与 OpenMP 有什么区别
OpenMP和MPI是并行编程的两个手段,对比如下:
OpenMP:线程级(并行粒度);共享存储;隐式(数据分配方式);可扩展性差。
MPI:进程级;分布式存储;显式;可扩展性好。OpenMP采用共享存储,意味着它只适应于SMP,DSM机器,不适合于集群。MPI虽适合于各种机器,但它的编程模型复杂。
需要分析及划分应用程序问题,并将问题映射到分布式进程集合。需要解决通信延迟大和负载不平衡两个主要问题。
延伸论述:
我认为,要理解OpenMP和MPI,首先要有一些操作系统知识和系统编程基础——OpenMP对应的实际上是单进程多线程的并发编程模型,可以将一个单线程的程序按for循环拆分成多线程——相当于pthread_create。
对于同一个进程的多个线程来说,由于它们只是独占自己的栈内存,堆内存是共享的,因此数据交换十分地容易,直接通过共享变量就可以进行交换,编程模型非常简单易用,并且对于操作系统来说,线程的上下文切换成本也比进程低很多。
然而另一方面,由于线程不能脱离进程独立存在,而一个进程不能存在于多台机器上,所以OpenMP只适用于拥有多个CPU核心的单台电脑。并且多线程编程存在临界区(Critical Section),需要你自己去加锁,解决Race Condition问题,否则的话很容易导致不可预知的后果。
而MPI则是多进程的并发编程模型,相当于你自己调用fork——每一个进程的内存地址空间都是独立的,它们彼此之间几乎什么都不共享,只能通过进程间通信(IPC)来交换彼此的数据,因此编程难度明显要大很多。
MPI有一个非常显着的优点,那就是对于一个分布式系统来说,进程是可以在分布式系统的每一台电脑之间转移的,因此对于拥有多台电脑的分布式系统来说,其并发性要明显好于OpenMP。
⑵ 用OpenMP并行编程计算sum=1+2+3+.....N 用MPI并行编程计算sum=1+2+3+......N
OpenMP:
#include"omp.h"
constintN=100;
voidmain()
{
intsum=0;
#pragmaompparallelfor
for(inti=0;i<N;i++)
sum+=i;
print("Resultofadding1to%dis:%d",N,sum);
}
MPI:
#include<iostream>
#include<mpi.h>
intmain(intargc,char**argv){
intmynode,numnodes;
intsum,startval,endval,accum;
MPI::Statusstatus;
MPI::Init(argc,argv);
numnodes=MPI::COMM_WORLD.Get_size();
mynode=MPI::COMM_WORLD.Get_rank();
sum=0;
startval=1000*mynode/numnodes+1;
endval=1000*(mynode+1)/numnodes;
for(inti=startval;i<=endval;++i){
sum=sum+i;
}
if(mynode!=0){
MPI::COMM_WORLD.Send(&sum,1,MPI::INT,0,1);
}
else{
for(intj=1;j<numnodes;++j){
MPI::COMM_WORLD.Recv(&accum,1,MPI::INT,j,1,
status);
sum=sum+accum;
}
}
if(mynode==0)
std::cout<<"Thesumfrom0to1000is:"<<sum
<<std::endl;
MPI::Finalize();
}
⑶ 吐血整理:C++编程语言资源汇总
关于 C++ 框架、库和资源的一些汇总列表,内容包括:标准库、Web应用框架、人工智能、数据库、图片处理、机器学习、日志、代码分析等。有需要的小伙伴可以收藏一下!
C++标准库,包括了STL容器,算法和函数等。
C++ Standard Library:是一系列类和函数的集合,使用核心语言编写,也是C++ISO自身标准的一部分。
Standard Template Library:标准模板库
C POSIX library : POSIX系统的C标准库规范
ISO C++ Standards Committee :C++标准委员会
C++通用框架和库
Apache C++ Standard Library:是一系列算法,容器,迭代器和其他基本组件的集合
ASL :Adobe源代码库提供了同行的评审和可移植的C++源代码库。
Boost :大量通用C++库的集合。
BDE :来自于彭博资讯实验室的开发环境。
Cinder:提供专业品质创造性编码的开源开发社区。
Cxxomfort:轻量级的,只包含头文件的库,将C++ 11的一些新特性移植到C++03中。
Dlib:使用契约式编程和现代C++ 科技 设计的通用的跨平台的C++库。
EASTL :EA-STL公共部分
ffead-cpp :企业应用程序开发框架
Folly:由Facebook开发和使用的开源C++库
JUCE :包罗万象的C++类库,用于开发跨平台软件
libPhenom:用于构建高性能和高度可扩展性系统的事件框架。
LibSourcey :用于实时的视频流和高性能网络应用程序的C++11 evented IO
LibU : C语言写的多平台工具库
Loki :C++库的设计,包括常见的设计模式和习语的实现。
MiLi :只含头文件的小型C++库
openFrameworks :开发C++工具包,用于创意性编码。
Qt :跨平台的应用程序和用户界面框架
Reason :跨平台的框架,使开发者能够更容易地使用Java,.Net和Python,同时也满足了他们对C++性能和优势的需求。
ROOT :具备所有功能的一系列面向对象的框架,能够非常高效地处理和分析大量的数据,为欧洲原子能研究机构所用。
STLport:是STL具有代表性的版本
STXXL:用于额外的大型数据集的标准模板库。
Ultimate++ :C++跨平台快速应用程序开发框架
Windows Template Library:用于开发Windows应用程序和UI组件的C++库
Yomm11 :C++11的开放multi-methods.
btsk : 游戏 行为树启动器工具
Evolving Objects:基于模板的,ANSI C++演化计算库,能够帮助你非常快速地编写出自己的随机优化算法。
Neu:C++11框架,编程语言集,用于创建人工智能应用程序的多用途软件系统。
Boost.Asio:用于网络和底层I/O编程的跨平台的C++库。
libev :功能齐全,高性能的时间循环,轻微地仿效libevent,但是不再像libevent一样有局限性,也修复了它的一些bug。
libevent :事件通知库
libuv :跨平台异步I/O。
音频,声音,音乐,数字化音乐库
FMOD :易于使用的跨平台的音频引擎和音频内容的 游戏 创作工具。
Maximilian :C++音频和音乐数字信号处理库
OpenAL :开源音频库—跨平台的音频API
Opus:一个完全开放的,免版税的,高度通用的音频编解码器
Speex:免费编解码器,为Opus所废弃
Tonic: C++易用和高效的音频合成
Vorbis: Ogg Vorbis是一种完全开放的,非专有的,免版税的通用压缩音频格式。
生物信息,基因组学和生物技术
libsequence:用于表示和分析群体遗传学数据的C++库。
SeqAn:专注于生物数据序列分析的算法和数据结构。
Vcflib :用于解析和处理VCF文件的C++库
Wham:直接把联想测试应用到BAM文件的基因结构变异。
压缩和归档库
bzip2:一个完全免费,免费专利和高质量的数据压缩
doboz:能够快速解压缩的压缩库
PhysicsFS:对各种归档提供抽象访问的库,主要用于视频 游戏 ,设计灵感部分来自于Quake3的文件子系统。
KArchive:用于创建,读写和操作文件档案(例如zip和 tar)的库,它通过QIODevice的一系列子类,使用gzip格式,提供了透明的压缩和解压缩的数据。
LZ4 :非常快速的压缩算法
LZHAM :无损压缩数据库,压缩比率跟LZMA接近,但是解压缩速度却要快得多。
LZMA :7z格式默认和通用的压缩方法。
LZMAT :及其快速的实时无损数据压缩库
miniz:单一的C源文件,紧缩/膨胀压缩库,使用zlib兼容API,ZIP归档读写,PNG写方式。
Minizip:Zlib最新bug修复,支持PKWARE磁盘跨越,AES加密和IO缓冲。
Snappy :快速压缩和解压缩
ZLib :非常紧凑的数据流压缩库
ZZIPlib:提供ZIP归档的读权限。
并发执行和多线程
Boost.Compute :用于OpenCL的C++GPU计算库
Bolt :针对GPU进行优化的C++模板库
C++React :用于C++11的反应性编程库
Intel TBB :Intel线程构件块
Libclsph:基于OpenCL的GPU加速SPH流体仿真库
OpenCL :并行编程的异构系统的开放标准
OpenMP:OpenMP API
Thrust :类似于C++标准模板库的并行算法库
HPX :用于任何规模的并行和分布式应用程序的通用C++运行时系统
VexCL :用于OpenCL/CUDA 的C++向量表达式模板库。
C++ B-tree :基于B树数据结构,实现命令内存容器的模板库
Hashmaps: C++中开放寻址哈希表算法的实现
Bcrypt :一个跨平台的文件加密工具,加密文件可以移植到所有可支持的操作系统和处理器中。
BeeCrypt:
Botan: C++加密库
Crypto++:一个有关加密方案的免费的C++库
GnuPG: OpenPGP标准的完整实现
GnuTLS :实现了SSL,TLS和DTLS协议的安全通信库
Libgcrypt
libmcrypt
LibreSSL:免费的SSL/TLS协议,属于2014 OpenSSL的一个分支
LibTomCrypt:一个非常全面的,模块化的,可移植的加密工具
libsodium:基于NaCI的加密库,固执己见,容易使用
Nettle 底层的加密库
OpenSSL : 一个强大的,商用的,功能齐全的,开放源代码的加密库。
Tiny AES128 in C :用C实现的一个小巧,可移植的实现了AES128ESB的加密算法
数据库,SQL服务器,ODBC驱动程序和工具
hiberlite :用于Sqlite3的C++对象关系映射
Hiredis: 用于Redis数据库的很简单的C客户端库
LevelDB: 快速键值存储库
LMDB:符合数据库四大基本元素的嵌入键值存储
MySQL++:封装了MySql的C API的C++ 包装器
RocksDB:来自Facebook的嵌入键值的快速存储
SQLite:一个完全嵌入式的,功能齐全的关系数据库,只有几百KB,可以正确包含到你的项目中。
调试库, 内存和资源泄露检测,单元测试
Boost.Test:Boost测试库
Catch:一个很 时尚 的,C++原生的框架,只包含头文件,用于单元测试,测试驱动开发和行为驱动开发。
CppUnit:由JUnit移植过来的C++测试框架
CTest:CMake测试驱动程序
googletest:谷歌C++测试框架
ig-debugheap:用于跟踪内存错误的多平台调试堆
libtap:用C语言编写测试
MemTrack —用于C++跟踪内存分配
microprofile- 跨平台的网络试图分析器
minUnit :使用C写的迷你单元测试框架,只使用了两个宏
Remotery:用于web视图的单一C文件分析器
UnitTest++:轻量级的C++单元测试框架
Cocos2d-x :一个跨平台框架,用于构建2D 游戏 ,互动图书,演示和其他图形应用程序。
Grit :社区项目,用于构建一个免费的 游戏 引擎,实现开放的世界3D 游戏 。
Irrlicht :C++语言编写的开源高性能的实时#D引擎
Polycode:C++实现的用于创建 游戏 的开源框架(与Lua绑定)。
CEGUI : 很灵活的跨平台GUI库
FLTK :快速,轻量级的跨平台的C++GUI工具包。
GTK+: 用于创建图形用户界面的跨平台工具包
gtkmm :用于受欢迎的GUI库GTK+的官方C++接口。
imgui:拥有最小依赖关系的立即模式图形用户界面
libRocket :libRocket 是一个C++ HTML/CSS 游戏 接口中间件
MyGUI :快速,灵活,简单的GUI
Ncurses:终端用户界面
QCustomPlot :没有更多依赖关系的Qt绘图控件
Qwt :用户与技术应用的Qt 控件
QwtPlot3D :功能丰富的基于Qt/OpenGL的C++编程库,本质上提供了一群3D控件
OtterUI :OtterUI 是用于嵌入式系统和互动 娱乐 软件的用户界面开发解决方案
PDCurses 包含源代码和预编译库的公共图形函数库
wxWidgets C++库,允许开发人员使用一个代码库可以为widows, Mac OS X,Linux和其他平台创建应用程序
bgfx:跨平台的渲染库
Cairo:支持多种输出设备的2D图形库
Horde3D 一个小型的3D渲染和动画引擎
magnum C++11和OpenGL 2D/3D 图形引擎
Ogre 3D 用C++编写的一个面向场景,实时,灵活的3D渲染引擎(并非 游戏 引擎)
OpenSceneGraph 具有高性能的开源3D图形工具包
Panda3D 用于3D渲染和 游戏 开发的框架,用Python和C++编写。
Skia 用于绘制文字,图形和图像的完整的2D图形库
urho3d 跨平台的渲染和 游戏 引擎。
Boost.GIL:通用图像库
CImg :用于图像处理的小型开源C++工具包
CxImage :用于加载,保存,显示和转换的图像处理和转换库,可以处理的图片格式包括 BMP, JPEG, GIF, PNG, TIFF, MNG, ICO, PCX, TGA, WMF, WBMP, JBG, J2K。
FreeImage :开源库,支持现在多媒体应用所需的通用图片格式和其他格式。
GDCM:Grassroots DICOM 库
ITK:跨平台的开源图像分析系统
Magick++:ImageMagick程序的C++接口
MagickWnd:ImageMagick程序的C++接口
OpenCV : 开源计算机视觉类库
tesseract-ocr:OCR引擎
VIGRA :用于图像分析通用C++计算机视觉库
VTK :用于3D计算机图形学,图像处理和可视化的开源免费软件系统。
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⑷ 求MPI的主要实现和各主要实现的优缺点
OpenMP(Open Multi-Processing)是一套支持跨平台共享内存方式的多线程并发的编程API,使用C,C++和Fortran语言,可以在大多数的处理器体系和操作系统中运行,包括Solaris, AIX, HP-UX, GNU/Linux, Mac OS X, 和Microsoft Windows。包括一套编译器指令、库和一些能够影响运行行为的环境变量。OpenMP采用可移植的、可扩展的模型,为程序员提供了一个简单而灵活的开发平台,从标准桌面电脑到超级计算机的并行应用程序接口[1]。
消息传递界面/接口(英语:Message Passing Interface,缩写MPI)是一个并行计算的应用程序接口(API),常在超级电脑、电脑簇等非共享内存环境程序设计[2]。
下面是我在使用他们的过程中,对这两种API优缺点的认识。
OpenMP的优点:
- OpenMP相对于MPI而言更容易使用。
- OpenMp对原串行代码改动较小,可以保护代码原貌。
- 代码更容易理解和维护
- 允许渐进式并行化
OpenMP的缺点 :
- 所有线程共享内存空间,硬件制约较大
- 目前主要针对循环并行化
MPI的优点:
- 无论硬件是否共享内存空间,都可以使用。(但是线程间不共享内存空间)
- 与OpenMP相比,可以处理规模更大的问题
- 每个线程有自己的内存和变量,这样不用担心
MPI的缺点:
- 算法上经常有较大改动(建立communication等)
- 较难使用
- 性能上会受到通信网络的影响
⑸ 中如下的编译选项什么意思
1.编译目标文件
icc -c -offload-attribute-target=mic -O3 -openmp -std=c99 -DMKL_ILP64 -I/opt/intel/composer_xe_2013_sp1.1.106/mkl/include fft.c -o fft_new.o
2.连接产生可执行文件
icc fft_new.o -openmp -Wl,--start-group /opt/intel/composer_xe_2013_sp1.2.144/mkl/lib/intel64/libmkl_intel_ilp64.a /opt/intel/composer_xe_2013_sp1.2.144/mkl/lib/intel64/libmkl_intel_thread.a /opt/intel/composer_xe_2013_sp1.2.144/mkl/lib/intel64/libmkl_core.a -Wl,--end-group -Ip-offload-option,mic,compiler,"-Wl,--start-group /opt/intel/composer_xe_2013_sp1.2.144/mkl/lib/mic/libmkl_intel_ilp64.a /opt/intel/composer_xe_2013mkl/lib/mic/libmkl_intel_thread.a /opt/intel/composer_xe_2013_sp1.2.144/mkl/lib/mic/libmkl_core.a -Wl,--end-group" -o fft_new.out
这里的东西较多,看上去比较复杂。
1.对于第一步,编译出目标文件。这里面的几个编译选项:
-O3 :表示最大可能优化级别。各种循环优化都执行了,并且各种文件级性质也用来改善性能
-openmp:采用了openmp并行编程
-std=c99:ANSI C是89年成为了标准,被ISO认证。之后99年ISO更新了新的C标准。所以-std用来指明编译的C标准。在某些情况下,如果使用GCC,可能在有冲突的时候使用其他标准,比如:-std=gnu89
-DMKL_ILP64:这个是intel提供的编译选项,主要是一个平台的指示。
-I:指定头文件目录
-o:重命名。
2.对于第二步,链接过程。其中几个编译选项:
-openmp:同上
-Wl:Wl选项告诉编译器将后面的参数传递给链接器。
--start-group 和--stop-group:库文件参数传递的开始和结束。
--offload-option,mic:使用offload方式使用协处理器进行运算
转自CSDN社区beglorious的专栏