‘壹’ auc 论文里的 怎么计算 python svm
利用Python画ROC曲线,以及AUC值的计算\
前言
ROC(Receiver Operating Characteristic)曲线和AUC常被用来评价一个二值分类器(binary classifier)的优劣。这篇文章将先简单的介绍ROC和AUC,而后用实例演示如何python作出ROC曲线图以及计算AUC。
AUC介绍
AUC(Area Under Curve)是机器学习二分类模型中非常常用的评估指标,相比于F1-Score对项目的不平衡有更大的容忍性,目前常见的机器学习库中(比如scikit-learn)一般也都是集成该指标的计算,但是有时候模型是单独的或者自己编写的,此时想要评估训练模型的好坏就得自己搞一个AUC计算模块,本文在查询资料时发现libsvm-tools有一个非常通俗易懂的auc计算,因此抠出来用作日后之用。
AUC计算
AUC的计算分为下面三个步骤:
1、计算数据的准备,如果模型训练时只有训练集的话一般使用交叉验证的方式来计算,如果有评估集(evaluate)一般就可以直接计算了,数据的格式一般就是需要预测得分以及其目标类别(注意是目标类别,不是预测得到的类别)
2、根据阈值划分得到横(X:False Positive Rate)以及纵(Y:True Positive Rate)点
3、将坐标点连成曲线之后计算其曲线下面积,就是AUC的值
直接上python代码
#! -*- coding=utf-8 -*-
import pylab as pl
from math import log,exp,sqrt
evaluate_result="you file path"
db = [] #[score,nonclk,clk]
pos, neg = 0, 0
with open(evaluate_result,'r') as fs:
for line in fs:
nonclk,clk,score = line.strip().split('\t')
nonclk = int(nonclk)
clk = int(clk)
score = float(score)
db.append([score,nonclk,clk])
pos += clk
neg += nonclk
db = sorted(db, key=lambda x:x[0], reverse=True)
#计算ROC坐标点
xy_arr = []
tp, fp = 0., 0.
for i in range(len(db)):
tp += db[i][2]
fp += db[i][1]
xy_arr.append([fp/neg,tp/pos])
#计算曲线下面积
auc = 0.
prev_x = 0
for x,y in xy_arr:
if x != prev_x:
auc += (x - prev_x) * y
prev_x = x
print "the auc is %s."%auc
x = [_v[0] for _v in xy_arr]
y = [_v[1] for _v in xy_arr]
pl.title("ROC curve of %s (AUC = %.4f)" % ('svm',auc))
pl.xlabel("False Positive Rate")
pl.ylabel("True Positive Rate")
pl.plot(x, y)# use pylab to plot x and y
pl.show()# show the plot on the screen
输入的数据集可以参考svm预测结果
其格式为:
nonclk \t clk \t score
其中:
1、nonclick:未点击的数据,可以看做负样本的数量
2、clk:点击的数量,可以看做正样本的数量
3、score:预测的分数,以该分数为group进行正负样本的预统计可以减少AUC的计算量
运行的结果为:
如果本机没安装pylab可以直接注释依赖以及画图部分
注意
上面贴的代码:
1、只能计算二分类的结果(至于二分类的标签随便处理)
2、上面代码中每个score都做了一次阈值,其实这样效率是相当低的,可以对样本进行采样或者在计算横轴坐标时进行等分计算
‘贰’ python matplotlib怎么用
使用python的包matplotlib来画图
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更新:
2015-10-24 22:10
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分步阅读
python中的matplotlib可以很快的帮助我们作出图,
为此我们给出matplotlib的安装步骤和一个小例子来展示其功能
工具/原料
python3.4
numpy包
matplotlib包
依赖包:pyparsing、dateutil、scipy
方法/步骤
python安装(之前写过一篇关于python的安装,这里不重复介绍)
(1) 如何下载?网络---> Python官网
(2) 版本:python-3.4.3.amd64 exe文件直接点哦
(3) 目录:D:\Python34
为python配置了环境变量:D:\Python34\Scripts;D:\Python34
(4) 命令行输入:python 有反应表示成功
说明:matplotlib还没有匹配python3.5的版本,我的电脑为64位
0Python安装学习指南
软件包下载:
因为涉及到众多包的下载,以及其中的版本和电脑位数问题特介绍如下( 注意加粗的字体):
(1) numpy numpy-1.10.1+mkl-cp34-none-win_amd64.whl
(2) matplotlib matplotlib-1.4.3.win-amd64-py3.4b/matplotlib-1.4.3/windows/
(3) 依赖包:pyparsing、dateutil、scipy
声明:以上软件地址可自行网络搜索
附注:图一为matplotlib 、图二为numpy 下载界面的选择
软件包numpy的安装:
1 命令行输入【完整的路径=numpy 在你电脑的绝对路径】
pip install 完整的路径\numpy -1.10.1+mkl-cp34-none-win_amd64.
2 验证:python编辑下 python>>
from numpy import *
安装matplotlib:
matplotlib-1.4.3.win-amd64-py3.4
因为下载的是exe文件,点击一路执行即可
依赖包的安装:
在命令行里逐行输入如下命令:软件包的绝对路径
1 pip install 绝对路径\pyparsing-2.0.3-py3-none-any.whl
2 pip install 绝对路径\python_dateutil-2.4.2-py2.py3-none-any.whl
3 pip install 绝对路径\matplotlib依赖\scipy-0.16.0-cp34-none-win_amd64.whl
验证是否安装成功:
1 在python编辑状态下导入安装的包:
import matplotlib
import numpy
import scipy
import pyparsing
import matplotlib.pyplot as plt
2 如果缺少six
在安装完毕scipy之后把../Python34/Lib/site-packages/scipy/lib中的six.py six.pyc six.pyo三个文件拷贝到.../Python34/Lib/site-packages
案例1:
import matplotlib.pyplot as plt
x = [0, 1, 2, 3, 4, 5]
y = [0.1, 0.2, 0.2, 0.3, 0.2, 0.1]
y2 = [0.2, 0.2, 0.3, 0.2, 0.3, 0]
plt.plot(x, y, 'b', x, y2, 'g')
plt.show()
案例2:
import matplotlib.pyplot as plt
import math
x=[]
y=[]
num=0.0
while num < math.pi * 4:
y.append(math.sin(num))
x.append(num)
num += 0.1
plt.plot(x, y, 'b')
plt.show()
如果
‘叁’ python一共有多少库
导读:本篇文章首席CTO笔记来给大家介绍有关python一共有多少库的相关内容,希望对大家有所帮助,一起来看看吧。
python库有哪些Python比较常见的库有:Arrow、Behold、Click、Numba、Matlibplot、Pillow等:
1、Arrow
Python中处理时间的库有datetime,但是它过于简单,使用起来不够方便和智能,而Arrow可以说非常的方便和智能。它可以轻松地定位几个小时之前的时间,可以轻松转换时区时间,对于一个小时前,2个小时之内这样人性化的信息也能够准确解读。
2、Behold
调试程序是每个程序员必备的技能,对于脚本语言,很多人习惯于使用print进行调试,然而对于大项目来说,print的功能还远远不足,我们希望有一个可以轻松使用,调试方便,对变量监视完整,格式已于查看的工具,而Behold就是那个非常好用的调试库。
3、Click
现在几乎所有的框架都有自己的命令行脚手架,Python也不例外,那么如何快速开发出属于自己的命令行程序呢?答案就是使用Python的Click库。Click库对命令行api进行了大量封装,你可以轻松开发出属于自己的CLI命令集。终端的颜色,环境变量信息,通过Click都可以轻松进行获取和改变。
4、Numba
如果你从事数学方面的分析和计算,那么Numba一定是你必不可少的库。Numpy通过将高速C库包装在Python接口中来工作,而Cython使用可选的类型将Python编译为C以提高性能。但是Numba无疑是最方便的,因为它允许使用装饰器选择性地加速Python函数。
5、Matlibplot
做过数据分析,数据可视化的数学学生一定知道matlab这个软件,这是一个收费的数学商用软件,在Python中,Matlibplot就是为了实现这个软件中功能开发的第三方Python库。并且它完全是免费的,很多学校都是用它来进行数学教学和研究的。
6、Pillow
图像处理是任何时候我们都需要关注的问题,平时我们看到很多ps中的神技,比如调整画面颜色,饱和度,调整图像尺寸,裁剪图像等等,这些其实都可以通过Python简单完成,而其中我们需要使用的库就是Pillow。
7、pyqt5
Python是可以开发图形界面程序的。而pyqt就是一款非常好用的第三方GUI库,有了它,你可以轻松开发出跨平台的图形应用程序,其中qtdesigner设计器,更是加速了我们开发图形界面的速度。
除了上述介绍的之外,Python还有很多库,比如:Pandas、NumPy、SciPy、Seaborn、Keras等。
在python中一共有多少个标准库?Python语言官方的参考手册钟,介绍了与Python一同发行的标准库。
文本处理服务
string?---常见的字符串操作
re?---正则表达式操作
difflib?---计算差异的辅助工具
textwrap?---文本自动换行与填充
unicodedata?---Unicode数据库
stringprep?---因特网字符串预备
readline?---GNUreadline接口
rlcompleter?---GNUreadline的补全函数
二进制数据服务
struct?---将字节串解读为打包的二进制数据
codecs?---编解码器注册和相关基类
数据类型
datetime?---基本日期和时间类型
zoneinfo?---IANA时区支持
calendar?---日历相关函数
collections?---容器数据类型
collections.abc?---容器的抽象基类
heapq?---堆队列算法
bisect?---数组二分查找算法
array?---高效的数值数组
weakref?---弱引用
types?---动态类型创建和内置类型名称
?---浅层(shallow)和深层(deep)复制操作
pprint?---数据美化输出
reprlib?---另一种?repr()?实现
enum?---对枚举的支持
graphlib?---操作类似图的结构的功能
数字和数学模块
numbers?---数字的抽象基类
math?---数学函数
cmath?---关于复数的数学函数
decimal?---十进制定点和浮点运算
fractions?---分数
random?---生成伪随机数
statistics?---数学统计函数
函数式编程模块
itertools?---为高效循环而创建迭代器的函数
functools?---高阶函数和可调用对象上的操作
operator?---标准运算符替代函数
文件和目录访问
pathlib?---面向对象的文件系统路径
os.path?---常用路径操作
fileinput?---迭代来自多个输入流的行
stat?---解析?stat()?结果
filecmp?---文件及目录的比较
tempfile?---生成临时文件和目录
glob?---Unix风格路径名模式扩展
fnmatch?---Unix文件名模式匹配
linecache?---随机读写文本行
shutil?---高阶文件操作
数据持久化
pickle?---Python对象序列化
reg?---注册配合?pickle?模块使用的函数
shelve?---Python对象持久化
marshal?---内部Python对象序列化
dbm?---Unix"数据库"接口
sqlite3?---SQLite数据库DB-API2.0接口模块
数据压缩和存档
zlib?---与?gzip?兼容的压缩
gzip?---对?gzip?格式的支持
bz2?---对?bzip2?压缩算法的支持
lzma?---用LZMA算法压缩
zipfile?---使用ZIP存档
tarfile?---读写tar归档文件
文件格式
csv?---CSV文件读写
configparser?---配置文件解析器
tomllib?---ParseTOMLfiles
netrc?---netrc文件处理
plistlib?---生成与解析Apple?.plist?文件
加密服务
hashlib?---安全哈希与消息摘要
hmac?---基于密钥的消息验证
secrets?---生成管理密码的安全随机数
通用操作系统服务
os?---多种操作系统接口
io?---处理流的核心工具
time?---时间的访问和转换
argparse?---命令行选项、参数和子命令解析器
getopt?---C风格的命令行选项解析器
logging?---Python的日志记录工具
logging.config?---日志记录配置
logging.handlers?---日志处理程序
getpass?---便携式密码输入工具
curses?---终端字符单元显示的处理
curses.textpad?---用于curses程序的文本输入控件
curses.ascii?---用于ASCII字符的工具
curses.panel?---curses的面板栈扩展
platform?---获取底层平台的标识数据
errno?---标准errno系统符号
ctypes?---Python的外部函数库
并发执行
threading?---基于线程的并行
multiprocessing?---基于进程的并行
multiprocessing.shared_memory?---
concurrent?包
concurrent.futures?---启动并行任务
subprocess?---子进程管理
sched?---事件调度器
queue?---一个同步的队列类
contextvars?---上下文变量
_thread?---底层多线程API
网络和进程间通信
asyncio?---异步I/O
socket?---底层网络接口
ssl?---套接字对象的TLS/SSL包装器
select?---等待I/O完成
selectors?---高级I/O复用库
signal?---设置异步事件处理程序
mmap?---内存映射文件支持
互联网数据处理
email?---电子邮件与MIME处理包
json?---JSON编码和解码器
mailbox?---操作多种格式的邮箱
mimetypes?---映射文件名到MIME类型
base64?---Base16,Base32,Base64,Base85数据编码
binascii?---二进制和ASCII码互转
quopri?---编码与解码经过MIME转码的可打印数据
结构化标记处理工具
html?---超文本标记语言支持
html.parser?---简单的HTML和XHTML解析器
html.entities?---HTML一般实体的定义
XML处理模块
xml.etree.ElementTree?---ElementTreeXMLAPI
xml.dom?---文档对象模型API
xml.dom.minidom?---最小化的DOM实现
xml.dom.pulldom?---支持构建部分DOM树
xml.sax?---支持SAX2解析器
xml.sax.handler?---SAX处理句柄的基类
xml.sax.saxutils?---SAX工具集
xml.sax.xmlreader?---用于XML解析器的接口
xml.parsers.expat?---使用Expat的快速XML解析
互联网协议和支持
webbrowser?---方便的Web浏览器控制工具
wsgiref?---WSGI工具和参考实现
urllib?---URL处理模块
urllib.request?---用于打开URL的可扩展库
urllib.response?---urllib使用的Response类
urllib.parse?用于解析URL
urllib.error?---urllib.request引发的异常类
urllib.robotparser?---robots.txt语法分析程序
http?---HTTP模块
http.client?---HTTP协议客户端
ftplib?---FTP协议客户端
poplib?---POP3协议客户端
imaplib?---IMAP4协议客户端
smtplib?---SMTP协议客户端
uuid?---?RFC4122?定义的UUID对象
socketserver?---用于网络服务器的框架
http.server?---HTTP服务器
http.cookies?---HTTP状态管理
http.cookiejar?——HTTP客户端的Cookie处理
xmlrpc?---XMLRPC服务端与客户端模块
xmlrpc.client?---XML-RPC客户端访问
xmlrpc.server?---基本XML-RPC服务器
ipaddress?---IPv4/IPv6操作库
多媒体服务
wave?---读写WAV格式文件
colorsys?---颜色系统间的转换
国际化
gettext?---多语种国际化服务
locale?---国际化服务
程序框架
turtle?---海龟绘图
cmd?---支持面向行的命令解释器
shlex?——简单的词法分析
Tk图形用户界面(GUI)
tkinter?——Tcl/Tk的Python接口
tkinter.colorchooser?---颜色选择对话框
tkinter.font?---Tkinter字体封装
Tkinter对话框
tkinter.messagebox?---Tkinter消息提示
tkinter.scrolledtext?---滚动文字控件
tkinter.dnd?---拖放操作支持
tkinter.ttk?---Tk风格的控件
tkinter.tix?---TK扩展包
Python常用的标准库以及第三方库有哪些?推荐5个常用的Python标准库:
1、os:提供了不少与操作系统相关联的函数库
os包是Python与操作系统的接口。我们可以用os包来实现操作系统的许多功能,比如管理系统进程,改变当前路径,改变文件权限等。但要注意,os包是建立在操作系统的平台上的,许多功能在Windows系统上是无法实现的。另外,在使用os包中,要注意其中的有些功能已经被其他的包取代。
我们通过文件系统来管理磁盘上储存的文件。查找、删除、复制文件以及列出文件列表等都是常见的文件操作。这些功能通常可以在操作系统中看到,但现在可以通过Python标准库中的glob包、shutil包、os.path包以及os包的一些函数等,在Python内部实现。
2、sys:通常用于命令行参数的库
sys包被用于管理Python自身的运行环境。Python是一个解释器,也是一个运行在操作系统上的程序。我们可以用sys包来控制这一程序运行的许多参数,比如说Python运行所能占据的内存和CPU,Python所要扫描的路径等。另一个重要功能是和Python自己的命令行互动,从命令行读取命令和参数。
3、random:用于生成随机数的库
Python标准库中的random函数,可以生成随机浮点数、整数、字符串,甚至帮助你随机选择列表序列中的一个元素,打乱一组数据等。
4、math:提供了数学常数和数学函数
标准库中,Python定义了一些新的数字类型,以弥补之前的数字类型可能的不足。标准库还包含了random包,用于处理随机数相关的功能。math包补充了一些重要的数学常数和数学函数,比如pi、三角函数等等。
5、datetime:日期和时间的操作库
日期和时间的管理并不复杂,但容易犯错。Python的标准库中对日期和时间的管理颇为完善,你不仅可以进行日期时间的查询和变换,还可以对日期时间进行运算。通过这些标准库,还可以根据需要控制日期时间输出的文本格式
结语:以上就是首席CTO笔记为大家介绍的关于python一共有多少库的全部内容了,希望对大家有所帮助,如果你还想了解更多这方面的信息,记得收藏关注本站。
‘肆’ 数据分析工具有哪些 python
IPython
IPython 是一个在多种编程语言之间进行交互计算的命令行 shell,最开始是用 python 开发的,提供增强的内省,富媒体,扩展的 shell
语法,tab 补全,丰富的历史等功能。IPython 提供了如下特性:
更强的交互 shell(基于 Qt 的终端)
一个基于浏览器的记事本,支持代码,纯文本,数学公式,内置图表和其他富媒体
支持交互数据可视化和图形界面工具
灵活,可嵌入解释器加载到任意一个自有工程里
简单易用,用于并行计算的高性能工具
由数据分析总监,Galvanize 专家 Nir Kaldero 提供。
GraphLab Greate 是一个 Python 库,由 C++ 引擎支持,可以快速构建大型高性能数据产品。
这有一些关于 GraphLab Greate 的特点:
可以在您的计算机上以交互的速度分析以 T 为计量单位的数据量。
在单一平台上可以分析表格数据、曲线、文字、图像。
最新的机器学习算法包括深度学习,进化树和 factorization machines 理论。
可以用 Hadoop Yarn 或者 EC2 聚类在你的笔记本或者分布系统上运行同样的代码。
借助于灵活的 API 函数专注于任务或者机器学习。
在云上用预测服务便捷地配置数据产品。
为探索和产品监测创建可视化的数据。
由 Galvanize 数据科学家 Benjamin Skrainka 提供。
Pandas
pandas 是一个开源的软件,它具有 BSD 的开源许可,为 Python
编程语言提供高性能,易用数据结构和数据分析工具。在数据改动和数据预处理方面,Python 早已名声显赫,但是在数据分析与建模方面,Python
是个短板。Pands 软件就填补了这个空白,能让你用 Python 方便地进行你所有数据的处理,而不用转而选择更主流的专业语言,例如 R 语言。
整合了劲爆的 IPyton 工具包和其他的库,它在 Python 中进行数据分析的开发环境在处理性能,速度,和兼容方面都性能卓越。Pands
不会执行重要的建模函数超出线性回归和面板回归;对于这些,参考 statsmodel 统计建模工具和 scikit-learn 库。为了把 Python
打造成顶级的统计建模分析环境,我们需要进一步努力,但是我们已经奋斗在这条路上了。
由 Galvanize 专家,数据科学家 Nir Kaldero 提供。
PuLP
线性编程是一种优化,其中一个对象函数被最大程度地限制了。PuLP 是一个用 Python
编写的线性编程模型。它能产生线性文件,能调用高度优化的求解器,GLPK,COIN CLP/CBC,CPLEX,和GUROBI,来求解这些线性问题。
由 Galvanize 数据科学家 Isaac Laughlin 提供
Matplotlib
matplotlib 是基于 Python 的
2D(数据)绘图库,它产生(输出)出版级质量的图表,用于各种打印纸质的原件格式和跨平台的交互式环境。matplotlib 既可以用在 python 脚本,
python 和 ipython 的 shell 界面 (ala MATLAB? 或 Mathematica?),web 应用服务器,和6类 GUI
工具箱。
matplotlib 尝试使容易事情变得更容易,使困难事情变为可能。你只需要少量几行代码,就可以生成图表,直方图,能量光谱(power
spectra),柱状图,errorcharts,散点图(scatterplots)等,。
为简化数据绘图,pyplot 提供一个类 MATLAB 的接口界面,尤其是它与 IPython
共同使用时。对于高级用户,你可以完全定制包括线型,字体属性,坐标属性等,借助面向对象接口界面,或项 MATLAB 用户提供类似(MATLAB)的界面。
Galvanize 公司的首席科学官 Mike Tamir 供稿。
Scikit-Learn
Scikit-Learn 是一个简单有效地数据挖掘和数据分析工具(库)。关于最值得一提的是,它人人可用,重复用于多种语境。它基于
NumPy,SciPy 和 mathplotlib 等构建。Scikit 采用开源的 BSD 授权协议,同时也可用于商业。Scikit-Learn
具备如下特性:
分类(Classification) – 识别鉴定一个对象属于哪一类别
回归(Regression) – 预测对象关联的连续值属性
聚类(Clustering) – 类似对象自动分组集合
降维(Dimensionality Rection) – 减少需要考虑的随机变量数量
模型选择(Model Selection) –比较、验证和选择参数和模型
预处理(Preprocessing) – 特征提取和规范化
Galvanize 公司数据科学讲师,Isaac Laughlin提供
Spark
Spark 由一个驱动程序构成,它运行用户的 main 函数并在聚类上执行多个并行操作。Spark
最吸引人的地方在于它提供的弹性分布数据集(RDD),那是一个按照聚类的节点进行分区的元素的集合,它可以在并行计算中使用。RDDs 可以从一个 Hadoop
文件系统中的文件(或者其他的 Hadoop 支持的文件系统的文件)来创建,或者是驱动程序中其他的已经存在的标量数据集合,把它进行变换。用户也许想要 Spark
在内存中永久保存 RDD,来通过并行操作有效地对 RDD 进行复用。最终,RDDs 无法从节点中自动复原。
Spark 中第二个吸引人的地方在并行操作中变量的共享。默认情况下,当 Spark
在并行情况下运行一个函数作为一组不同节点上的任务时,它把每一个函数中用到的变量拷贝一份送到每一任务。有时,一个变量需要被许多任务和驱动程序共享。Spark
支持两种方式的共享变量:广播变量,它可以用来在所有的节点上缓存数据。另一种方式是累加器,这是一种只能用作执行加法的变量,例如在计数器中和加法运算中。