⑴ 怎样用php脚本调用安装在Windows中的*.exe程序
在尝试调用之前，至少你需要了解一定的知识才可以。
你的PHP环境是在Linux服务器还是Windows服务器上？如果是Linux服务器，那么是不支持exe程序运行的。
你的程序需要放在php文件能访问的目录中。当然，你必须能够访问PHP服务器才可以。如果只是客户端，那是没用的。PHP不能访问客户端的程序。
system或者exec都可以执行文件。不过没有尝试Windows下访问某个特定的程序。
下面是一个例子。使用exec执行‘whoami’程序。
<?php
// outputs the username that owns the running php/httpd
process
// (on a system with the "whoami" executable in the
path)
echo exec('whoami');
?>
⑵ php调用exe问题
PHP里面exec其它命令可以成功执行，而调用特定的程序没有成功，我推测有三个方面的原因：
一是APACHE的进程（估计是httpd.exe）身份与你命令行执行的是否相同，可以在进程管理器里面查看。
二是环境不同，你的julia是否需要某些特定环境变量支持，PHP执行的时候这些环境变量是否都有，可以在PHPINFO()里面查看。
三是相对路径不同，命令行下执行时系统查找文件的环境不同，试试看这样写：
exec(" julia 12.jl");
修改为：
exec("c:\\julia\\julia.exe d:\\jl\\12.jl");
此外，你的调试信息显示stderr异常，是否julia必须依赖stderr。还有，julia是CONSOLE环境还是GUI程序，如果是CONSOLE的，能否使用-?或者-v参数显示简单信息，用以测试调用julia是否成功，例如你的julia支持julia -version显示版本号，那么你可以在PHP里面这样写：
exec(" julia -version");
查看命令行和浏览器里面的效果。
⑶ 网页如何运行在服务器系统上服务器端的exe
要求应该是在客户端网页上发送消息到服务器，然后服务器响应这个消息并执行程序，然后将程序运行结果返回给网页。
当然还有一种要求是用网页管理服务端程序，跟远程桌面一样，这个由于篇幅限制不多解释，请自己去搜索VNC这个远程控制台。
回到正题，一般来讲，服务端脚本语言都可以执行程序的，这里以PHP为例子
<?php
exec("./run.sh",$output)//接收控制台输出的内容或者程序执行的结果
print_r($output)//输出这个结果给网页
?>
一般来讲，在网页直接指令执行服务器文件风险性极高，所以许多时候这些服务端脚本语言的默认设定是不会让你执行文件的，需要自行修改相关设置参数提升权限才可以获取让脚本语言执行文件的权限，系统文件夹的权限也相应需要修改。不同系统对应设置不同。
Windows的权限设置很详细，建议要进行这种高风险操作之前先详细了解文件权限方面知识，这部分内容不在本题范围中，不多做解释。
⑷ php调用exe程序
php可以调用外部exe程序，如果是在服务器端执行服务器端的程序，使用exec函数。
提示一点：php是服务器端脚本，因此，不能在客户端执行服务器端的程序。