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linux使用r语言

发布时间:2022-07-07 08:32:48

A. R读取大型数据集内存不足如何解决,如果利用linux有什么有效方法吗

有个比较简单暴力的方法是fread里的nrows参数设置。
R所有读取数据的函数都有nrows和skip这两个参数,可以写个循环,一个文件分段读取,skip跳过前面读过的,用nrows控制最大读入行数,防止内存不足。
分段处理之后将文件写入本地,用rm将比较大的变量消除掉,用gc()释放这部分内存。
——好处是简单粗暴多平台可用,缺点是,真的很慢……
如果有条件还是建议申请个服务器来跑,比如学生可以询问导师院系有没有用于大型计算的服务器。
另外Unix系统对内存的限制确实是比Windows好些,可惜我也不知道正确的打开方式QAQ

B. 如何在linux环境下使用r语言

1、下载
wget http://mirror.bjtu.e.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz

2、解压
tar -zxvf
R-3.0.1.tar.gz
cd R-3.0.1

3、安装 (当然也可以跳过)
yum
install readline-devel
yum install libXt-devel
./configure

4、 配置环境并编译安装
#
如果使用rjava需要加上 --enable-R-shlib
(这个我不需要,所以加入到后面)
# 如果3没安装, 那么后面加上: --with-readline=no
--with-x=no
./configure --prefix=/usr/R-3.0.1
make $$ make install

5、配置环境变量并生效
vi
.bash_profile
export R_HOME=/usr/R-3.0.1
export PATH=.:$R_HOME/bin:$PATH

# 试环境变量生效
source .bash_profile

6、 命令行测试
[admin@JD
software]$ R
WARNING: ignoring environment value of R_HOME

R version 3.0.1 (2013-05-16) -- "Good Sport"
Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)

R是自由软件,不带任何担保。
在某些条件下你可以将其自由散布。
用'license()'或'licence()'来看散布的详细条件。

R是个合作计划,有许多人为之做出了贡献.
用'contributors()'来看合作者的详细情况
用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。

用'demo()'来看一些示范程序,用'help()'来阅读在线帮助文件,或
用'help.start()'通过HTML浏览器来看帮助文件。
用'q()'退出R.

> q()

7、创建脚本测试(t.R)
cd
/opt/script/R
vim t.R

#!/path/to/Rscript
#第一行
x<-c(1,2,3)
#R语言代码
y<-c(102,299,301)
model<-lm(y~x)
summary(model)

8、测试:执行脚本
R CMD BATCH
--args /opt/script/R/t.R
more
/opt/script/R/t.Rout
#查看执行的结果
或者第二种方式
Rscript
/opt/script/R/test.R
#结果直接输出到终端

C. r语言中怎么使用linux语句

1、下载
wget http://mirror.bjtu.e.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz

2、解压:
tar -zxvf
R-3.0.1.tar.gz
cd R-3.0.1

3、安装 (当然也可以跳过)
yum
install readline-devel
yum install libXt-devel
./configure

4、 配置环境并编译安装
#
如果使用rJava需要加上 --enable-R-shlib
(这个我不需要,所以加入到后面)
# 如果3没安装, 那么后面加上: --with-readline=no
--with-x=no
./configure --prefix=/usr/R-3.0.1
make $$ make install

5、配置环境变量并生效
vi

D. linux服务器怎么运行r语言

我有点不太理解是什么意思……Linux系统都有对应的R软件版本,可以从R的官网下载,安装了之后直接打开R运行就好了吧。

E. 跪求!!Linux下用R语言画图的高手(Error in X11,unable to open connection to X11 display )

楼主图形界面是必须在X模式下显示的,就算你需要浏览一张图片也需要X。
除非你这个图片单纯由printf colour组成的。

if [ -n "$(pgrep -x X) ]; then
sudo killall X
fi
xinit &> /dev/null &
export DISPLAY=:0.0

你可以去问下你们老师,他绝对不敢说,比如说我打开office不需要启动X

F. r语言中,关于工作目录的使用,哪些说法正确

正确说法有
1、通过命令设置工作目录,查看工作目录下的文件。
2、通过rstudio工具设置默认的工作目录。
3、R语言的赋值符号 <- 、<<-
4、查看和删除对象。
5、历史记录、清空屏幕、保存工作空间。
工作目录(present working directory)是文件系统当前所在的目录,如果命令没有额外指定路径,则默认为当前工作目录。比如ls命令,如果没有指定目录,就会显示出当前工作目录的文件。
在Linux中,路径可以用绝对路径和相对路径表示,相对路径就是相对于当前工作目录。当前工作目录可以使用pwd命令获取。

G. Linux环境下,java怎么调用R语言

1、下载wgethttp://mirror.bjtu.e.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz2、解压:tar-zxvfR-3.0.1.tar.gzcdR-3.0.13、安装(当然也可以跳过)yuminstallreadline-develyuminstalllibXt-devel./configure4、配置环境并编译安装#如果使用rJava需要加上--enable-R-shlib(这个我不需要,所以加入到后面)#如果3没安装,那么后面加上:--with-readline=no--with-x=no./configure--prefix=/usr/R-3.0.1make$$makeinstall5、配置环境变量并生效vi.bash_profileexportR_HOME=/usr/R-3.0.1exportPATH=.:$R_HOME/bin:$PATH#试环境变量生效source.bash_profile6、命令行测试[admin@JDsoftware]$RWARNING:ignoringenvironmentvalueofR_HOMERversion3.0.1(2013-05-16)--"GoodSport"Copyright(C):x86_64-unknown-linux-gnu(64-bit)R是自由软件,不带任何担保。在某些条件下你可以将其自由散布。用'license()'或'licence()'来看散布的详细条件。R是个合作计划,有许多人为之做出了贡献.用'contributors()'来看合作者的详细情况用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。用'demo()'来看一些示范程序,用'help()'来阅读在线帮助文件,或用'help.start()'通过HTML浏览器来看帮助文件。用'q()'退出R.>q()7、创建脚本测试(t.R)cd/opt/script/Rvimt.R#!/path/to/Rscript#第一行x<-c(1,2,3)#R语言代码y<-c(102,299,301)model<-lm(y~x)summary(model)8、测试:执行脚本RCMDBATCH--args/opt/script/R/t.Rmore/opt/script/R/t.Rout#查看执行的结果或者第二种方式Rscript/opt/script/R/test.R#结果直接输出到终端

H. linux r语言写的包怎么使用

1、通过选择菜单:程序包->安装程序包->在弹出的对话框中,选择你要安装的包,然后确定。2、使用命令install.packages(package_name,dir)package_name:是指定要安装的包名,请注意大小写。dir:包安装的路径。默认情况下是安装在..\library 文件...

I. linux R语言运行脚本,提示载入程辑包,运行不成功

“载入需要的程辑包:”这种提示没什么大不了的,实在觉得烦就在脚本里导致出现这些东西的命令外面套一层suppressMessages()函数,比如suppressMessages(library(foreach))。
关键是后面提示的错误要解决。

J. linux虚拟系统中怎么安装最新版R语言

一.准备安装所需要的软件:

1.VMware虚拟机的下载和安装在我的博客中已经提到,这里就不再详细阐述。

2.下载一个redhat,因为redhat已经商业化了,推荐大家使用centos,如果自己有合适的linux安装版本,可以不使用这个。

二.在VMware虚拟机为RedHat Linux创建新的虚拟机 :

1.打开虚拟机,选择新建虚拟机:
2.选择自定义(这里选择典型可能会在安装过程中出现一个硬件找不到的错误,所以推荐选择自定义),然后点下一步:
3 作系统选择linux,版本不用修改:
4.命名,并选择虚拟操作系统的存放位置(位置所在硬盘空间最好大于5G):
5.给虚拟机分配内存(这个自己看情况,我的电脑内存是512,给虚拟机分配了256)
6.选择虚拟机网络类型(推荐使用桥接网络)
7.选择磁盘类型,这里选择IDE(这也是第三步选择自定义的原因,因为选择典型的话,系统会自动选择SCSI硬盘,而有的linux,主要是早的linux版本,不能使用SCSI硬盘,所以才会出现没有发现硬盘的错误)
8.指定磁盘容量(推荐大小为8g,基本够用了)
二、安装linux系统就很简单了,网上也有很多的教程。虚拟机和真实服务器基本么有什么差别。
三、linux下安装程序
1.yum 安装 直接敲yum install 后面跟软件名称,linux系统会自动到yum源上寻找你所要安装的软件,以及它所需要的依赖关系的软件等
2.rpm安装 也是直接敲rpm install后面跟软件名称,系统会到rpm源上寻找软件,但是可能会提示在安装它之前还需要安装其他的软件,yum会直接帮你安装,但是rpm不会,你需要自己安装
3.源码包安装 相对于yum和rpm安装。源码包安装比较麻烦,但是它相当于软件的定制版,你可以设定安装目录及安装参数等等,比较自由。

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