① linux快速入门第八章：Shell基础
我们平时所说的 Shell 可以理解为 Linux 系统提供给用户的使用界面。Shell 为用户提供了输入命令和参数并可得到命令执行结果的环境。当一个用户登录 Linux 之后，系统初始化程序 init 就根据 /etc/passwd 文件中的设定，为每个用户运行一个被称为 Shell（外壳）的程序。
确切地说，Shell 是一个命令行解释器，它为用户提供了一个向 Linux 内核发送请求以便运行程序的界面系统级程序，用户可以用 Shell 来启动、挂起、停止甚至编写一些程序。
Shell 处在内核与外层应用程序之间，起着协调用户与系统的一致性、在用户与系统之间进行交互的作用。图 1 是 Linux 系统层次结构图，Shell 接收用户输入的命令，并把用户的命令从类似 abed 的 ASCII 码解释为类似 0101 的机器语言，然后把命令提交到系统内核处理；当内核处理完毕之后，把处理结果再通过 Shell 返回给用户。
换句话说：
Shell 是一个用 C 语言编写的程序，它是用户使用 Linux 的桥梁。Shell 既是一种命令语言，又是一种程序设计语言。
Shell 是指一种应用程序，这个应用程序提供了一个界面，用户通过这个界面访问操作系统内核的服务。
Ken Thompson 的 sh 是第一种 Unix Shell，Windows Explorer 是一个典型的图形界面 Shell。
Shell 与其他 Linux 命令一样，都是实用程序，但它们之间还是有区别的。一旦用户注册到系统后，Shell 就被系统装入内存并一直运行到用户退出系统为止；而一般命令仅当被调用时，才由系统装入内存执行。
与一般命令相比，Shell 除了是一个命令行解释器，同时还是一门功能强大的编程语言，易编写，易调试，灵活性较强。作为一种命令级语言，Shell 是解释性的，组合功能很强，与操作系统有密切的关系，可以在 Shell 脚本中直接使用系统命令。大多数 Linux 系统的启动相关文件（一般在 /etc/rc.d 目录下）都是使用 Shell 脚本编写的。
同传统的编程语言一样，Shell 提供了很多特性，这些特性可以使 Shell 脚本编程更为有用，如数据变量、参数传递、判断、流程控制、数据输入和输出、子程序及中断处理等。
说了这么多，其实我们在 Linux 中操作的命令行界面就是 Linux 的 Shell，也就是 Bash，但是我们的图形界面是 Shell 吗？其实从广义讲，图形界面当然也是 Shell，因为它同样用来接收用户的操作，并传递到内核进行处理。不过，这里的 Shell 主要指的是 Bash。
Shell 脚本
Shell 脚本（shell script），是一种为 shell 编写的脚本程序。
业界所说的 shell 通常都是指 shell 脚本，但读者朋友要知道，shell 和 shell script 是两个不同的概念。
由于习惯的原因，简洁起见，本文出现的 "shell编程" 都是指 shell 脚本编程，不是指开发 shell 自身。
Shell的分类
目前 Shell 的版本有很多种，如 Bourne Shell、C Shell、Bash、ksh、tcsh 等，它们各有特点，下面简要介绍一下。
最重要的 Shell 是 Bourne Shell，这个命名是为了纪念此 Shell 的发明者 Steven Bourne。从 1979 年起，UNIX 就开始使用 Boume Shell。Bourne Shell 的主文件名为 sh，开发人员便以 sh 作为 Bourne Shell 的主要识别名称。
虽然 Linux 与 UNIX 一样，可以支持多种 Shell，但 Boume Shell 的重要地位至今仍然没有改变，许多 UNIX 系统中仍然使用 sh 作为重要的管理工具。它的工作从开机到关机，几乎无所不包。在 Linux 中，用户 Shell 主要是 Bash，但在启动脚本、编辑等很多工作中仍然使用 Bourne Shell。
C Shell 是广为流行的 Shell 变种。C Shell 主要在 BSD 版的 UNIX 系统中使用，发明者是柏克莱大学的 Bill Joy。C Shell 因为其语法和 C 语言类似而得名，这也使得 UNIX 的系统工程师在学习 C Shell 时感到相当方便。
Bourne Shell 和 C Shell 形成了 Shell 的两大主流派别，后来的变种大都吸取这两种 Shell 的特点，如 Korn、 tcsh 及 Bash。
Bash Shell 是 GNU 计划的重要工具之一，也是 GNU 系统中标准的 Shell。Bash 与 sh 兼容，所以许多早期开发出来的 Bourne Shell 程序都可以继续在 Bash 中运行。现在使用的 Linux 就使用 Bash 作为用户的基本 Shell。
Bash 于 1988 年发布，并在 1995-1996年推出Bash 2.0。在这之前，广为使用的版本是1.14，Bash 2.0增加了许多新的功能，以及具备更好的兼容性。表 2 中详细列出了各版本的具体情况。
注意，Shell 的两种主要语法类型有 Bourne 和 C，这两种语法彼此不兼容。Boume 家族主要包括 sh、ksh、Bash、psh、zsh；C 家族主要包括 csh、tcsh（Bash 和 zsh 在不同程序上支持 csh 的语法）。
本章讲述的脚本编程就是在 Bash 环境中进行的。不过，在 Linux 中除了可以支持 Bash，还可以支持很多其他的 Shell。我们可以通过 /etc/shells 文件来査询 Linux 支持的 Shell。命令如下：
在 Linux 中，这些 Shell 是可以任意切换的，命令如下：
用户信息文件 /etc/passwd 的最后一列就是这个用户的登录 Shell。命令如下：
大家可以看到，root 用户和其他可以登录系统的普通用户的登录 Shell 都是 /bin/bash，也就是 Linux 的标准 Shell，所以这些用户登录之后可以执行权限允许范围内的所有命令。不过，所有的系统用户（伪用户）因为登录 Shell 是 /sbin/ndogin，所以不能登录系统。
笔记：
sh/bash/csh/Tcsh/ksh/pdksh等shell的区别
② Linux如何编写shell脚本
一般以#!/bin/sh开头（不是必须要写，但一定要单独一行），指定执行这个脚本的shell程序（也可以用#!/bin/zsh或其他），然后就是堆命令了。
Linux的shell脚本支持很多功能，加上Linux高度模块化的命令，完全可以用shell脚本写出复杂的程序。
以上只是简单介绍如何开始写shell脚本，如果要写复杂的脚本，还需要深入学习相关知识（如if——fi、case——esac等结构）。
当然，还需要给脚本加上可执行权限(chmod +x ./file.sh），否则可以用sh ./file.sh方式执行脚本（这里的sh是执行脚本所需shell，命令也可以是zsh ./file.sh或其他）。
整个shell脚本，其实就相当于你在终端输入的一系列命令，如果想在shell里做什么，就先想想在终端可以做什么吧，字符的的连接，就是直接用 "" 双引号，输出，变量定义无 $ 符号，但是使用时一定要加上 $ 符号。
"=" 赋值符号，两边一定不能有空格，这和其他语言有区别，尤其是你还有自己代码美观风格时特别注意，否则会报语法错误！
for 中的数组内容是以 " " 空格分隔，而非 "," 逗号分格。
条件判断 [ true ] 中括号 后面需要有一个空格，但是两个中括号之间不能有空格如 [[ true ]]。
while 条件判断可以用 () 括号，也可以用 [[ ]] 中括号。
如果用windows写shell,一定要注意换行符格式 而非 ， 需要借助一些编辑器(如notepad++)更改换行符格式！
③ Linux里面基本的shell脚本编写有哪些
shell脚本就是一些命令的集合。
举个例子，我想实现这样的操作：
1）进入到/tmp/目录；
2）列出当前目录中所有的文件名；
3）把所有当前的文件拷贝到/root/目录下；
4）删除当前目录下所有的文件。
简单的4步在shell窗口中需要你敲4次命令，按4次回车。这样是不是很麻烦？当然这4步操作非常简单，如果是更加复杂的命令设置需要几十次操作呢？那样的话一次一次敲键盘会很麻烦。所以不妨把所有的操作都记录到一个文档中，然后去调用文档中的命令，这样一步操作就可以完成。其实这个文档呢就是shell脚本了，只是这个shell脚本有它特殊的格式。《linux 就该这么学》
Shell脚本通常都是以.sh 为后缀名的，这个并不是说不带.sh这个脚本就不能执行，只是大家的一个习惯而已。所以，以后你发现了.sh为后缀的文件那么它一定会是一个shell脚本了。test.sh中第一行一定是 “#! /bin/bash” 它代表的意思是，该文件使用的是bash语法。如果不设置该行，那么你的shell脚本就不能被执行。’#’表示注释，在前面讲过的。后面跟一些该脚本的相关注释内容以及作者和创建日期或者版本等等。当然这些注释并非必须的，如果你懒的很，可以省略掉，但是笔者不建议省略。因为随着你工作时间的增加，你写的shell脚本也会越来越多，如果有一天你回头查看你写的某个脚本时，很有可能忘记该脚本是用来干什么的以及什么时候写的。所以写上注释是有必要的。另外系统管理员并非你一个，如果是其他管理员查看你的脚本，他看不懂岂不是很郁闷。该脚本再往下面则为要运行的命令了。
④ 学生信的那些事儿之七 - Linux基础之Shell脚本编程
沿着前面的轨迹，接下来是Linux中shell脚本的学习。这对于生信工程师后续处理大量 (海量更合适些) 数据是非常非常脊码重要的，但是同样的，作为一个有点古板的人，对于"脚本"是什么意思我都死磕了好久。主要觉得有些抽象，尤其是跟生信的同事讨论项目分析部分的问题时，他们经常会说道这个词，在他们意识里这是个不言自明的术语，殊不知对外行人而言 (比如我)，那简直就是无情的"知识的诅咒"。经常是我假装听懂了，然后继续讨论下面的问题，形成一个模糊的印象。
网络上的解释是：脚本（Script）是一种批处理文件的延伸，是一种纯文本保存的程序，一般来说的计算机脚本程序是确定的一系列控制计算机进行运算操作动作的组合，在其中可以实现一定的逻辑分支等。不知道你能不能看懂，反正我开始的时候真是一知半解。
鸟哥私房菜的解释是：shell script是利用 shell 的功能所写的一个"程序"，这个程序是使用纯文本文件，将一些shell的语法与命令(含外部命令)写在里面，搭配正则表达式、管道命令与数据流重定向等功能，以达到我们所想要的处理的目的。不明觉厉，好像更看不懂了···
Jude 的简单粗暴大白话解释是：脚本就是Linux中很多命令按照一定规则的组合，以实现某个特定的功能。Linux中有很多简单的命令，往往只是进行了简单的对话，比如 cd 就是进入到某个目录，简单直接。但是如果我想进入某个目录A，然后在目录A中创建目录B，再在目录B中创建文本C呢？当然可以一步一步操作，如果想要一步到位呢，那就可以用脚本，把三个命令写在一起，一起执行。好像有点啰嗦···
或者从英语的角度去理解，脚本的对应英文是Script，而这个单词的中文释义中还有剧本的意思。剧本就好理解了啊，剧本就是导演(生信工程师)基于某个主旨(要实现的目标)按照一定的手法(规则)所写的一个故事。不管是哪个演员，都得按照剧本演。所以，学好英语对于生信也是有帮助的~
按照脚本的复杂程度可以分为：
这个无需多说，其实就是若干个简单命令的顺序排列，执行脚本后会按照命令的前后关系从前往后一一执行。
相对于简单的基本脚本，结构化的命令脚本可以施加逻辑流程控制，从而改变程序(命令)执行的顺序。基本脚本中的命令就是从上往下执行，但兄野迅是结构化的命令脚本可以根据逻辑判断重复或者跳过某些命令。
常用的结构化命令(语句)有：
后面还有什么嵌套循环啊啥的，不过我觉得上面的7中命令学到家了，应该可以应付大部分在生信分析里面的应用了。
记得高中的时候，物理老师(也是班主任)在给我们讲解习题时有个有意思的套路：不管什么难题现在下面写个"答："，以示自己解决问题的决心，也是一种正向的心理暗示。脚本编写也是有套路的，不过总的来说还是比较简单。
对于简单的脚本(超级简单的那种)，直接几个命令连在一起即可，中间用"；"隔开。
对于更长更复杂的脚本，一般需要创建一个文本，并在里面编辑。这就涉及到了文本编辑器，比较常用和简单的一般有nano和vim，实在羡此很简单，规则也容易理解，教程随手可得，不多说。
比如用vim创建了一个脚本之后，具体的语法(套路)：
ok，脚本写完了，怎么让脚本开始工作呢？这有涉及到之前讲过的环境变量和相对路径、绝对路径了。方法有三：
就这么多吧，应该有点感觉到了，剩下的就是狂练狂练了~
⑤ linux shell脚本执行命令详解
在Linux下，如果你需要执行shell脚本，那么应该使用那个命令呢?下面由我为大家整理了linux shell脚本执行命令的相关知识，希望对大家有帮助!
linux shell脚本执行
linux shell脚本执行方法一： 切换到shell脚本所在的目录(此时，称为工作目录)执行shell脚本：
cd /data/shell
./hello.sh
./的意思是说在当前的工作目录下执行hello.sh。如果不加上./，bash可能会响应找到不到hello.sh的错误信息。因为目前的工作目录(/data/shell)可能不在执行程序默认的搜索路径之列,也就是说，不在环境变量PASH的内容之中。查看PATH的内容可用 echo $PASH 命令。现在的/data/shell就不在环境变量PASH中的，所以必须加上./才可执行。
linux shell脚本执行方法二： 以绝对路径的方式去执行bash shell脚本：
/data/shell/hello.sh
linux shell脚本执行方法三： 直接使用bash 或sh 来执行bash shell脚本：
cd /data/shell
bash hello.sh
或
cd /data/shell
sh hello.sh
注意，若是以方法三的方式来执行，那么，可以不必事先设定shell的执行权限，甚至都不用写shell文件中的第一行(指定bash路径)。因为方法三是将hello.sh作为参数传给sh(bash)命令来执行的。这时不是hello.sh自己来执行，而是被人家调用执行，所以不要执行权限。那么不用指定bash路径自然也好理解了啊。
linux shell脚本执行方法四： 在当前的shell环境中执行bash shell脚本：
cd /data/shell
. hello.sh
或
cd /data/shell
source hello.sh
前三种方法执行shell脚本时都是在当前shell(称为父shell)开启一个子shell环境，此shell脚本就在这个子shell环境中执行。shell脚本执行完后子shell环境随即关闭，然后又回到父shell中。而方法四则是在当前shell中执行的。
⑥ 如何在Windows下运行linux shell脚本
1、首先电脑中需要安装的是git的应用程序，安装完成之后，可以在开始菜单进行查看。
2、并需要配置好git的bin，配置环境变量，把bin的绝对路径复制到环境变量中path。
3、配置git的环境变量之后，在任意文件进行创建一个为mkdir.sh，文件名可以是随意的结尾需要为.sh。
4、然后在sh的文件中进行输入#!/bin/shtoucha.txtsleep10echo"testtesttesttest">>a.txt
创建一个为txt文件后testtesttesttest写入到txt文件中。
5、然后进行双击.sh的文件，会弹出git的命令窗口，根据代弊毁码的执行的时间窗口显示多久。
6、然后就会自动生成一个档旦a.txt的文件。
7、并会在a.txt文件中写入为“testtesttesttest”的一段文字，即代表运行linuxshell脚本成功。租蠢备
⑦ 每天三分钟搞定linux shell脚本24 后台模式运行
当运行脚本的时候在最后加上符号 & ，则对应的脚本在 后台运行 。建立脚本为，
输入 ./test.sh & 运行
运行后1.txt文件会不断增加内容，但是脚本以后台运行不会在终端占用。运行结果为：
输入 jobs 可以看到这个后台进程：
这个时候如果输入exit，不会提示有后台进程在运行，而且后台进程也会退出。因为终端会话退出的时候会给这个后台进程发送一个 SIGHUP信号 。如果想要终端退出之后，进程不退出，可以让进程捕获SIGHUP信号。当然还有另一个方法，使用 nohup 指令运行脚本，比如输入：
当用 nohup 并使用后台模式运行之后，即使退出终端，进程也不会收到SIGHUP信号。并且nohup会自动把标准输出和标准错误重定向到nohup.out的文件中。
一个 运行的进程或者暂停的进程 都是一个作业，使用 jobs 命令可以查看当前的作业状态。输入：
我当前的输出为：
（上面的作业2是输入 ctrl+z 后暂停的进程）
其中， + 号被当作是默认作业，每个作业的前面有自己的序号。如果后续操作不加序号，那么就被当做是在操作默认作业。比如使用 fg 指令前台运行作业，就是把27652这个进程前台运行，如果输入 fg 1 ，那么就是操作作业 1 了。带-号的表示下一个默认作业。
输入 bg 1 把 1号作业 后台运行，输入 fg 2 把 2号作业 前台运行。
⑧ Linux shell有哪些类型Linux基础教程
shell是一门脚本语言，即shell脚本，shell也是解释执行的脚本语言，可直接调用Linux命令，所以它在Linux系统中有着非常重袭激旅要的作用。那么Linux
shell有哪些类型?我们来看看吧。
shell脚本语言是弱类型语言，无需定义变量的类型就可使用，主要有两大类：bourne shell、C shell。
第一种：Bourne shell
Bourne shell又包括Bourne shell (sh)、Korn shell (ksh)、Bourne Again
Shell(bash)三种类型。
Bourne shell (sh)由AT&T的Steve Bourne开发，是标准的拍凳UNIX Shell，很多UNIX系统都配有sh。
Korn shell (ksh)由David Korn开发，是Bourne
shell(sh)的超集合，并且添加了csh引入的新功能，是目前很多UNIX系统标准配置的Shell，在这些系统上的/bin/sh往往是指向/bin/ksh的符号链接。
Bourne Again
Shell即bash由GNU项目组开发，主要目标是与POSIX标准保持一致，同时兼顾对sh的兼容，bash从csh和ksh借鉴了很多功能，是各种Linux发行版默认配置的Shell，在Linux系统上的/bin/sh往往是指向/bin/bash的符号链接。虽然如此，bash和sh还是有很多的不同，一方面，bash扩展了一些命令和参数，另一方面，bash并不完全和sh兼容，它们有些行为并不一致，但大多数企业运维的情况下区别不大，特殊场景可以使用bash替代sh。
第二种：C shell
C shell又包括csh、tcsh两种类型。
csh由Berkeley大学开发，随BSD UNIX发布，它的流程控制语句很像C语言，支持很多Bourne
Shell所不支持的功能，例如：作业控制、别名、系统算术、命令历史、命令行编辑等。
tcsh是csh的增强版，加入了命令补全等功能，在FreeBSD、Mac OS X等系统上替代了csh。
以上介绍的这些Shell中，较为通用的是标准的Bourne shell (sh)和C shell (csh)。其中Bourne shell
(sh)已经被Bourne Again shell (bash) 取代。
可通过以下命令查看CentOS7系统的Shell支持情铅举况。
[root@oldboy ~]# cat /etc/shells
/bin/sh #<==这是Linux里常用的Shell，指向/bin/bash。
/bin/bash #<==这是Linux里常用的Shell，也是默认使用的Shell。
/usr/bin/sh
/usr/bin/bash
Linux系统中的主流Shell是bash，bash是由Bourne
Shell(sh)发展而来的，但bash还包含了csh和ksh的特色，但大多数脚本都可以不加修改地在sh上运行，如果你使用sh后发现结果和预期有差异，那么可以尝试使用bash替代sh。