sed简介：流编辑工具，用来对文本进行过滤与替换操作。
sed流程：sed通过一次仅读取一行内容来对某些指令进行处理后输出。
1、sed通过文件或管道读取文件内容，但sed默认并不直接修改源文件，而是将读入的内容复制到缓冲区中，称之为模式空间。
2、所有的指令操作都是在模式空间找那个进行
3、sed根据相应的指令对模式空间中的内容进行处理并输出结果，默认输出至标准输出（即屏幕上）。
sed基本语法格式：
用法：sed[选项]...{脚本指令}[输入文件]...
选项： -version 显示sed版本
-help ：显示帮助文档
-n,-quiet,-silent静默输出，默认情况下，sed程序在所有的脚本指令执行完毕后，将自动打印模式空间中的内容。
-e script允许多个脚本指令被执行
-f script-file从文件中读取脚本指令，对编写自动化脚本程序很实用
-i ,-in-place 该选项直接修改源文件
-l N 该选项指定l指令可以输出的行长度，l指令为输出非打印字符。
-posix 禁用GNU sed扩展功能。
-r 在脚本指令中使用扩展正则表达式。
-s，-separate 默认情况下，sed将把输入的多个文件名作为一个长的连续的输入流。而GNU sed则允许把它们当作单独的文件。
-u，-unbuffered 最低限度的缓存输入与输出
a，append表示追加指令；
i，insert表示插入指令；
d，delete表示删除指令；
s，substitution表示替换指令。
sed脚本指令的基本格式是：
[地址,即路径]命令（有些命令仅可以对一行操作，有些可以对多行操作），命令也可以用花括号进行组合，使命令序列可以作用于同一个地址。
address{
command1
command2
command3
}
sed的基本工作方式是：
sed的替换命令s：
1、全局替换 ： s/old/new/g ，其中g为全局替换，用于替换所有出现的次数； /如果和正则匹配的内容冲突可以使用其他符号，如 ： s@old@new@g
2、标志位
为什么要有多行模式: 配置文件一般有单行出现，但也有使用json或XML格式的配置文件，为多行出现。
多行模式处理命令N、D、P
❷ Linux sed 命令详解
sed命令行格式：sed [options] 'command' file(s)
options常用选项：
-n或--quiet或——silent：仅显示script处理后的结果;
-e：以选项中的指定的script来处理输入的文本文件;
-f：以选项中指定的script文件来处理输入的文本文件;
-r∶sed 的动作支援的是延伸型正规表示法的语法;
-i∶直接修改读取的档案内容，而不是由萤幕输出;
-h或--help：显示帮助;
-V或--version：显示版本信息。
Command常用命令：
a：新增，a 的后面可以接字符串，而这些字符串会在新的一行出现(目前的下一行);
c：取代，c 的后面可以接字符串，这些字符串可以取代 n1,n2 之间的行;
d：删除，d 后面通常不接任何字符串;
i：插入，i 的后面可以接字符串，而这些字符串会在新的一行出现(目前的上一行);
p：打印，亦即将某个选择的资料印出。通常 p 会与参数 sed -n 一起运作;
s：取代，可以直接进行取代的工作，通常与正规表达式搭配使用。
实例说明：
新增操作：a命令
sed '/^bird/a\test' file将test追加到 以bird开头的行后面
删除操作：d命令
sed '/^$/d' file #删除空白行;
sed '2d' file #删除第二行;
sed '2,$d' file #删除第2行到最后一行;
sed '$d' file #删除最后一行;
sed '/^bird/'d file #删除所有开头是bird的行;
插入操作：i命令
sed -i '3i\bird ' bird.conf #在bird.conf文件第3行之前插入bird
替换文本中的字符串：s命令
sed 's/bird/birds/' file #将文本中的bird替换成birds;
sed -i 's/ bird / birds /g' file #将file文件中每一行的第一个bird替换为birds;
❸ Linux文本操作常用命令
在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令：
通过多敲键盘，形成手感 肌肉记忆 ，熟练掌握这些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍（主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记）
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来：
参数的用法介绍：
注意事项：
用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 编辑文本 ，编辑文本要加 > 符号，退出时，另起一行，按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件，tac逆向查看
结合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默认 10 行 （在R语言里head和tail默认是前6行）。
less命令用得最多 ，more命令用得比较少
3.1 less命令
less [参数] 文件名
less命令重要的补充用法1 ：
需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q键
less命令重要的补充用法2 ：
参数用法：
less命令 不加参数 查看文件：
less命令加 -N参数 查看文件：显示行号
less命令加 -S参数 查看文件：单行显示，非常规整
对比：less和cat命令显示文本行号的用法：less -N，cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐页查看，按空格翻页，按回车换行 ，more命令一般很少用，熟练掌握less命令就好
查看压缩文件
wc 统计字符是也把换行符统计进去，但是别的命令不一定会把换行符算进去，。
常见参数:
切记：用less命令，按q退出
cut命令是按关键词来切的
常见参数:
排列前：
排列后：
解释：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。
命令行查看一个表格结构时，因为制表符对齐的原因，出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样，所以 加上-n参数 ， 让数值有数学意义上的大小来排序 。
uniq命令去重，只有两行出现重复，而且是相邻的两行，如果不相邻，即使出现两行一模一样，不会去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
换其它文件试试
总之，uniq命令使用时经常和sort一起
常见参数:
常见用法1：
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常见用法2 : paste - -
常见参数:
要养成一个好习惯，原始数据不要轻易修改，修改的东西另外保存，文本保存用> (重定向)或是 >>(追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符传递给 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容
3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列
4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计
5. 在第4步的基础上，将空格替换成制表符
补充小知识 ：
清屏 ：control L
查看历史（输入过的）命令 ：history
❹ Linux环境下文本处理，提取需要的内容
linux 文本编辑器有这个功能，可以进行光标的调整来获取你要的内容。很方便的！